Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6Z1

Nop56, Nucleolar protein 56, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 580 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nop56Q9D6Z1 B3gat2-201ENSMUST00000063663 5655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Nop56Q9D6Z1 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Nop56Q9D6Z1 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Nop56Q9D6Z1 Epm2aip1-201ENSMUST00000060711 7149 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.19
Nop56Q9D6Z1 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.19
Nop56Q9D6Z1 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Nop56Q9D6Z1 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Nop56Q9D6Z1 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Nop56Q9D6Z1 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Nop56Q9D6Z1 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Nop56Q9D6Z1 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Nop56Q9D6Z1 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Nop56Q9D6Z1 Rbm47-204ENSMUST00000113726 4703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Nop56Q9D6Z1 Rbm4-206ENSMUST00000180248 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Nop56Q9D6Z1 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Nop56Q9D6Z1 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Nop56Q9D6Z1 Eif1ax-201ENSMUST00000087143 5172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Nop56Q9D6Z1 Apol7e-201ENSMUST00000096358 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Nop56Q9D6Z1 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Nop56Q9D6Z1 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Nop56Q9D6Z1 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Nop56Q9D6Z1 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Nop56Q9D6Z1 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Nop56Q9D6Z1 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Nop56Q9D6Z1 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Nop56Q9D6Z1 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Nop56Q9D6Z1 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Nop56Q9D6Z1 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Nop56Q9D6Z1 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Nop56Q9D6Z1 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Nop56Q9D6Z1 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Nop56Q9D6Z1 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Nop56Q9D6Z1 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Nop56Q9D6Z1 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Nop56Q9D6Z1 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Nop56Q9D6Z1 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Nop56Q9D6Z1 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Nop56Q9D6Z1 Mfap3l-202ENSMUST00000160719 6335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Nop56Q9D6Z1 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Nop56Q9D6Z1 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Nop56Q9D6Z1 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Nop56Q9D6Z1 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Nop56Q9D6Z1 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Nop56Q9D6Z1 Rnft2-202ENSMUST00000121369 4431 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Nop56Q9D6Z1 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Nop56Q9D6Z1 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Nop56Q9D6Z1 Grm5-202ENSMUST00000125009 8047 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Nop56Q9D6Z1 Cacna2d1-201ENSMUST00000039370 3933 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Nop56Q9D6Z1 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Nop56Q9D6Z1 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Nop56Q9D6Z1 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Nop56Q9D6Z1 Cul9-201ENSMUST00000066026 7818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Nop56Q9D6Z1 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Nop56Q9D6Z1 Atp1a2-201ENSMUST00000085913 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Nop56Q9D6Z1 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Nop56Q9D6Z1 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Nop56Q9D6Z1 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Nop56Q9D6Z1 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Nop56Q9D6Z1 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Nop56Q9D6Z1 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Nop56Q9D6Z1 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Nop56Q9D6Z1 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Nop56Q9D6Z1 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Nop56Q9D6Z1 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Nop56Q9D6Z1 Prkar1b-202ENSMUST00000110889 2457 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Nop56Q9D6Z1 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Nop56Q9D6Z1 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Nop56Q9D6Z1 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Nop56Q9D6Z1 Capn3-203ENSMUST00000090028 2640 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Nop56Q9D6Z1 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Nop56Q9D6Z1 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Nop56Q9D6Z1 Hnf1b-201ENSMUST00000021016 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Nop56Q9D6Z1 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Nop56Q9D6Z1 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Nop56Q9D6Z1 Rbpj-207ENSMUST00000201883 4961 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Nop56Q9D6Z1 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Nop56Q9D6Z1 AC122228.1-201ENSMUST00000223113 2057 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Nop56Q9D6Z1 Ppp1r15a-201ENSMUST00000042105 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Nop56Q9D6Z1 Btnl2-202ENSMUST00000178562 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Nop56Q9D6Z1 Btnl2-201ENSMUST00000025198 2564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Nop56Q9D6Z1 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Nop56Q9D6Z1 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Nop56Q9D6Z1 Ptpn7-203ENSMUST00000187985 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Nop56Q9D6Z1 Arhgef40-202ENSMUST00000100639 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Nop56Q9D6Z1 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Nop56Q9D6Z1 Gck-203ENSMUST00000109823 2361 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Nop56Q9D6Z1 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Nop56Q9D6Z1 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Nop56Q9D6Z1 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Nop56Q9D6Z1 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Nop56Q9D6Z1 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Nop56Q9D6Z1 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Nop56Q9D6Z1 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Nop56Q9D6Z1 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Nop56Q9D6Z1 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Nop56Q9D6Z1 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Nop56Q9D6Z1 Gm45609-206ENSMUST00000210176 1023 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Nop56Q9D6Z1 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Nop56Q9D6Z1 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Nop56Q9D6Z1 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms