Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6Y7

Msra, Mitochondrial peptide methionine sulfoxide reductase, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MsraQ9D6Y7 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
MsraQ9D6Y7 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
MsraQ9D6Y7 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
MsraQ9D6Y7 Rap1a-ps2-201ENSMUST00000118467 559 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
MsraQ9D6Y7 Gm12208-201ENSMUST00000122004 163 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
MsraQ9D6Y7 1700003G13Rik-202ENSMUST00000131342 705 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
MsraQ9D6Y7 Rps19-ps11-201ENSMUST00000160308 433 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
MsraQ9D6Y7 Iqcf6-201ENSMUST00000171091 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
MsraQ9D6Y7 Gm4598-201ENSMUST00000206756 1080 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
MsraQ9D6Y7 Gm18730-201ENSMUST00000218038 343 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
MsraQ9D6Y7 Riiad1-201ENSMUST00000029785 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
MsraQ9D6Y7 Pf4-201ENSMUST00000031320 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
MsraQ9D6Y7 Mrps34-201ENSMUST00000043907 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
MsraQ9D6Y7 Olfr524-201ENSMUST00000051943 1058 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
MsraQ9D6Y7 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
MsraQ9D6Y7 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
MsraQ9D6Y7 Tssk5-201ENSMUST00000071119 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
MsraQ9D6Y7 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
MsraQ9D6Y7 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
MsraQ9D6Y7 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
MsraQ9D6Y7 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
MsraQ9D6Y7 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
MsraQ9D6Y7 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
MsraQ9D6Y7 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
MsraQ9D6Y7 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
MsraQ9D6Y7 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
MsraQ9D6Y7 Cdc26-202ENSMUST00000107459 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
MsraQ9D6Y7 Blvrb-202ENSMUST00000108357 782 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
MsraQ9D6Y7 Gm6335-201ENSMUST00000118081 1194 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
MsraQ9D6Y7 Gm7816-201ENSMUST00000119884 1194 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
MsraQ9D6Y7 Gm15542-201ENSMUST00000121585 1194 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
MsraQ9D6Y7 Krtap20-2-201ENSMUST00000169954 528 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
MsraQ9D6Y7 C1qtnf2-203ENSMUST00000173002 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
MsraQ9D6Y7 Ighv8-4-201ENSMUST00000178949 294 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
MsraQ9D6Y7 Gm45765-201ENSMUST00000212027 1035 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
MsraQ9D6Y7 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
MsraQ9D6Y7 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
MsraQ9D6Y7 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
MsraQ9D6Y7 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
MsraQ9D6Y7 AC079680.2-201ENSMUST00000219181 1306 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
MsraQ9D6Y7 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
MsraQ9D6Y7 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
MsraQ9D6Y7 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
MsraQ9D6Y7 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
MsraQ9D6Y7 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
MsraQ9D6Y7 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
MsraQ9D6Y7 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
MsraQ9D6Y7 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
MsraQ9D6Y7 Cyp4f17-201ENSMUST00000165999 1693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
MsraQ9D6Y7 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
MsraQ9D6Y7 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
MsraQ9D6Y7 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
MsraQ9D6Y7 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
MsraQ9D6Y7 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
MsraQ9D6Y7 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
MsraQ9D6Y7 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
MsraQ9D6Y7 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
MsraQ9D6Y7 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
MsraQ9D6Y7 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
MsraQ9D6Y7 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
MsraQ9D6Y7 Nfyc-203ENSMUST00000118902 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
MsraQ9D6Y7 Ighv1-61-201ENSMUST00000103531 351 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
MsraQ9D6Y7 Gm13296-201ENSMUST00000117854 997 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
MsraQ9D6Y7 Gm13492-201ENSMUST00000119772 665 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
MsraQ9D6Y7 Tex22-201ENSMUST00000012355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
MsraQ9D6Y7 Higd1c-201ENSMUST00000175683 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
MsraQ9D6Y7 Gm28694-201ENSMUST00000190681 722 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
MsraQ9D6Y7 Rassf4-202ENSMUST00000203029 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
MsraQ9D6Y7 Gm45433-201ENSMUST00000209386 247 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
MsraQ9D6Y7 AC140293.1-201ENSMUST00000225626 1247 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
MsraQ9D6Y7 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
MsraQ9D6Y7 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
MsraQ9D6Y7 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
MsraQ9D6Y7 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
MsraQ9D6Y7 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
MsraQ9D6Y7 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
MsraQ9D6Y7 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
MsraQ9D6Y7 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
MsraQ9D6Y7 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
MsraQ9D6Y7 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
MsraQ9D6Y7 Krt31-201ENSMUST00000007318 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
MsraQ9D6Y7 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
MsraQ9D6Y7 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
MsraQ9D6Y7 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
MsraQ9D6Y7 Pla2g10-202ENSMUST00000115807 964 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
MsraQ9D6Y7 Gm12058-201ENSMUST00000118614 437 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
MsraQ9D6Y7 Dnajb6-202ENSMUST00000012734 1024 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
MsraQ9D6Y7 Gm27230-202ENSMUST00000184671 857 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
MsraQ9D6Y7 Gm36503-201ENSMUST00000204284 875 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
MsraQ9D6Y7 Gm8913-201ENSMUST00000209491 641 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
MsraQ9D6Y7 Gm37419-201ENSMUST00000210705 114 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
MsraQ9D6Y7 Gm33104-201ENSMUST00000214178 1010 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
MsraQ9D6Y7 Dhrs2-201ENSMUST00000022820 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
MsraQ9D6Y7 4930596D02Rik-201ENSMUST00000043266 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
MsraQ9D6Y7 Ufc1-201ENSMUST00000080001 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
MsraQ9D6Y7 Krtap19-1-201ENSMUST00000081334 493 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
MsraQ9D6Y7 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
MsraQ9D6Y7 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
MsraQ9D6Y7 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
MsraQ9D6Y7 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.6 ms