Protein–RNA interactions for Protein: Q9D541

Ccdc7, Coiled-coil domain-containing protein 7, mousemouse

Predictions only

Length 371 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc7Q9D541 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc7Q9D541 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc7Q9D541 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc7Q9D541 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc7Q9D541 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc7Q9D541 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc7Q9D541 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc7Q9D541 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc7Q9D541 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc7Q9D541 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc7Q9D541 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc7Q9D541 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc7Q9D541 Ankfn1-201ENSMUST00000050983 2665 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc7Q9D541 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc7Q9D541 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc7Q9D541 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc7Q9D541 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc7Q9D541 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc7Q9D541 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc7Q9D541 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc7Q9D541 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc7Q9D541 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc7Q9D541 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc7Q9D541 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc7Q9D541 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc7Q9D541 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc7Q9D541 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc7Q9D541 Gm45643-201ENSMUST00000211364 1484 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc7Q9D541 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc7Q9D541 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc7Q9D541 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc7Q9D541 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc7Q9D541 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc7Q9D541 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc7Q9D541 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc7Q9D541 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc7Q9D541 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc7Q9D541 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc7Q9D541 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc7Q9D541 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc7Q9D541 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc7Q9D541 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc7Q9D541 Tcf4-226ENSMUST00000201094 2172 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc7Q9D541 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc7Q9D541 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc7Q9D541 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc7Q9D541 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc7Q9D541 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc7Q9D541 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc7Q9D541 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc7Q9D541 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc7Q9D541 Tcf4-210ENSMUST00000128706 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc7Q9D541 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc7Q9D541 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc7Q9D541 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc7Q9D541 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc7Q9D541 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc7Q9D541 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc7Q9D541 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc7Q9D541 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc7Q9D541 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc7Q9D541 Prkce-201ENSMUST00000097274 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc7Q9D541 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc7Q9D541 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc7Q9D541 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc7Q9D541 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Ccdc7Q9D541 Naaladl1-201ENSMUST00000044451 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Ccdc7Q9D541 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Ccdc7Q9D541 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Ccdc7Q9D541 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Ccdc7Q9D541 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Ccdc7Q9D541 Gm27194-201ENSMUST00000175753 2936 ntBASIC15.71■□□□□ 0.1
Ccdc7Q9D541 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Ccdc7Q9D541 Gm1661-203ENSMUST00000165128 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Ccdc7Q9D541 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc7Q9D541 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc7Q9D541 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc7Q9D541 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc7Q9D541 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc7Q9D541 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc7Q9D541 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc7Q9D541 Ptpn7-203ENSMUST00000187985 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc7Q9D541 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc7Q9D541 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc7Q9D541 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc7Q9D541 Gm6161-201ENSMUST00000121942 1102 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc7Q9D541 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc7Q9D541 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc7Q9D541 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc7Q9D541 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc7Q9D541 Gm6254-201ENSMUST00000168178 1072 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc7Q9D541 Gm6153-201ENSMUST00000172004 1058 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc7Q9D541 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc7Q9D541 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc7Q9D541 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc7Q9D541 Gm5641-202ENSMUST00000198699 1080 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc7Q9D541 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc7Q9D541 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc7Q9D541 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc7Q9D541 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.2 ms