Protein–RNA interactions for Protein: Q9D289

Trappc6b, Trafficking protein particle complex subunit 6B, mousemouse

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Length 158 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc6bQ9D289 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Trappc6bQ9D289 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Trappc6bQ9D289 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Trappc6bQ9D289 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Trappc6bQ9D289 Cgnl1-202ENSMUST00000121322 6541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Trappc6bQ9D289 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Trappc6bQ9D289 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Trappc6bQ9D289 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Trappc6bQ9D289 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Trappc6bQ9D289 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Trappc6bQ9D289 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Trappc6bQ9D289 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Trappc6bQ9D289 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Trappc6bQ9D289 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Trappc6bQ9D289 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Trappc6bQ9D289 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Trappc6bQ9D289 Dnmbp-202ENSMUST00000212032 5074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Trappc6bQ9D289 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Trappc6bQ9D289 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Trappc6bQ9D289 Pitpnm3-202ENSMUST00000108508 6450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Trappc6bQ9D289 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Trappc6bQ9D289 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Trappc6bQ9D289 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Trappc6bQ9D289 Krba1-202ENSMUST00000077093 8380 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Trappc6bQ9D289 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Trappc6bQ9D289 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Trappc6bQ9D289 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Trappc6bQ9D289 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Trappc6bQ9D289 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Trappc6bQ9D289 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Trappc6bQ9D289 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Trappc6bQ9D289 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Trappc6bQ9D289 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Trappc6bQ9D289 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Trappc6bQ9D289 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Trappc6bQ9D289 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Trappc6bQ9D289 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Trappc6bQ9D289 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Trappc6bQ9D289 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Trappc6bQ9D289 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Trappc6bQ9D289 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Trappc6bQ9D289 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Trappc6bQ9D289 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Trappc6bQ9D289 Eme2-201ENSMUST00000119848 5226 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Trappc6bQ9D289 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Trappc6bQ9D289 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Trappc6bQ9D289 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Trappc6bQ9D289 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Trappc6bQ9D289 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Trappc6bQ9D289 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Trappc6bQ9D289 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Trappc6bQ9D289 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Trappc6bQ9D289 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Trappc6bQ9D289 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Trappc6bQ9D289 Dab2ip-205ENSMUST00000112986 5580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Trappc6bQ9D289 Brd3-202ENSMUST00000077737 5272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Trappc6bQ9D289 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Trappc6bQ9D289 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Trappc6bQ9D289 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Trappc6bQ9D289 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Trappc6bQ9D289 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Trappc6bQ9D289 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Trappc6bQ9D289 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Trappc6bQ9D289 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Trappc6bQ9D289 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Trappc6bQ9D289 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Trappc6bQ9D289 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Trappc6bQ9D289 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Trappc6bQ9D289 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Trappc6bQ9D289 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Trappc6bQ9D289 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Trappc6bQ9D289 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Trappc6bQ9D289 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Trappc6bQ9D289 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Trappc6bQ9D289 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Trappc6bQ9D289 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Trappc6bQ9D289 Llgl2-201ENSMUST00000103032 3551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Trappc6bQ9D289 Plch2-206ENSMUST00000135665 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Trappc6bQ9D289 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Trappc6bQ9D289 St6gal1-201ENSMUST00000023601 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Trappc6bQ9D289 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Trappc6bQ9D289 Myo7a-203ENSMUST00000107127 6806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Trappc6bQ9D289 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Trappc6bQ9D289 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Trappc6bQ9D289 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Trappc6bQ9D289 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Trappc6bQ9D289 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Trappc6bQ9D289 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Trappc6bQ9D289 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Trappc6bQ9D289 Samd5-201ENSMUST00000100070 6818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Trappc6bQ9D289 Glis2-201ENSMUST00000014447 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Trappc6bQ9D289 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Trappc6bQ9D289 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Trappc6bQ9D289 Gm13288-201ENSMUST00000094977 2850 ntAPPRIS P1 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Trappc6bQ9D289 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Trappc6bQ9D289 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Trappc6bQ9D289 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Trappc6bQ9D289 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Trappc6bQ9D289 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Trappc6bQ9D289 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
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