Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY25

Mis12, Protein MIS12 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 206 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mis12Q9CY25 Kif16b-201ENSMUST00000043589 6383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Mis12Q9CY25 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Mis12Q9CY25 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Mis12Q9CY25 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Mis12Q9CY25 Mllt6-201ENSMUST00000044730 7274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Mis12Q9CY25 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Mis12Q9CY25 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Mis12Q9CY25 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
Mis12Q9CY25 Eif4enif1-213ENSMUST00000179770 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Mis12Q9CY25 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Mis12Q9CY25 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
Mis12Q9CY25 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
Mis12Q9CY25 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Mis12Q9CY25 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
Mis12Q9CY25 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
Mis12Q9CY25 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Mis12Q9CY25 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
Mis12Q9CY25 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
Mis12Q9CY25 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Mis12Q9CY25 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Mis12Q9CY25 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Mis12Q9CY25 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Mis12Q9CY25 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Mis12Q9CY25 Pcdhgc3-201ENSMUST00000076807 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Mis12Q9CY25 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Mis12Q9CY25 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Mis12Q9CY25 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Mis12Q9CY25 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Mis12Q9CY25 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Mis12Q9CY25 Erg-201ENSMUST00000077773 2232 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Mis12Q9CY25 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Mis12Q9CY25 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Mis12Q9CY25 Tecpr1-201ENSMUST00000085701 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Mis12Q9CY25 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Mis12Q9CY25 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Mis12Q9CY25 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Mis12Q9CY25 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Mis12Q9CY25 Pphln1-203ENSMUST00000109256 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Mis12Q9CY25 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Mis12Q9CY25 Dab2ip-204ENSMUST00000112983 6051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Mis12Q9CY25 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Mis12Q9CY25 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Mis12Q9CY25 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Mis12Q9CY25 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Mis12Q9CY25 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Mis12Q9CY25 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Mis12Q9CY25 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Mis12Q9CY25 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Mis12Q9CY25 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
Mis12Q9CY25 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Mis12Q9CY25 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Mis12Q9CY25 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Mis12Q9CY25 Gsdmcl2-203ENSMUST00000185431 1911 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
Mis12Q9CY25 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Mis12Q9CY25 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Mis12Q9CY25 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Mis12Q9CY25 Cacna1g-202ENSMUST00000100561 8125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Mis12Q9CY25 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Mis12Q9CY25 Igf2r-201ENSMUST00000024599 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Mis12Q9CY25 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Mis12Q9CY25 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Mis12Q9CY25 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Mis12Q9CY25 Ahsg-201ENSMUST00000023583 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Mis12Q9CY25 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Mis12Q9CY25 Nol4-206ENSMUST00000164186 2622 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Mis12Q9CY25 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Mis12Q9CY25 Banp-201ENSMUST00000026354 1970 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Mis12Q9CY25 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Mis12Q9CY25 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Mis12Q9CY25 Api5-201ENSMUST00000028617 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Mis12Q9CY25 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Mis12Q9CY25 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Mis12Q9CY25 Hhipl2-202ENSMUST00000192527 2310 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Mis12Q9CY25 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Mis12Q9CY25 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Mis12Q9CY25 Spast-201ENSMUST00000024869 4672 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Mis12Q9CY25 Tmem178b-201ENSMUST00000061740 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Mis12Q9CY25 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Mis12Q9CY25 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Mis12Q9CY25 Rbm47-204ENSMUST00000113726 4703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Mis12Q9CY25 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Mis12Q9CY25 Pcdhga9-201ENSMUST00000091935 4724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Mis12Q9CY25 Ralgds-202ENSMUST00000100241 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Mis12Q9CY25 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Mis12Q9CY25 Asap1-217ENSMUST00000177371 6164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Mis12Q9CY25 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Mis12Q9CY25 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC14.43□□□□□ -0.1
Mis12Q9CY25 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
Mis12Q9CY25 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Mis12Q9CY25 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC14.43□□□□□ -0.1
Mis12Q9CY25 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC14.43□□□□□ -0.1
Mis12Q9CY25 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Mis12Q9CY25 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Mis12Q9CY25 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Mis12Q9CY25 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Mis12Q9CY25 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Mis12Q9CY25 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
Mis12Q9CY25 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
Mis12Q9CY25 Gm28373-201ENSMUST00000178129 2724 ntTSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
Mis12Q9CY25 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.8 ms