Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSN1

Snw1, SNW domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 536 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snw1Q9CSN1 Lgals8-203ENSMUST00000124888 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snw1Q9CSN1 Gm36995-201ENSMUST00000126170 5727 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snw1Q9CSN1 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snw1Q9CSN1 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snw1Q9CSN1 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snw1Q9CSN1 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snw1Q9CSN1 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snw1Q9CSN1 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snw1Q9CSN1 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snw1Q9CSN1 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snw1Q9CSN1 Gm26551-201ENSMUST00000181262 2432 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snw1Q9CSN1 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snw1Q9CSN1 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Snw1Q9CSN1 Samd7-201ENSMUST00000108262 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snw1Q9CSN1 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Snw1Q9CSN1 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Snw1Q9CSN1 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Snw1Q9CSN1 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snw1Q9CSN1 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snw1Q9CSN1 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snw1Q9CSN1 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snw1Q9CSN1 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snw1Q9CSN1 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snw1Q9CSN1 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snw1Q9CSN1 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snw1Q9CSN1 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snw1Q9CSN1 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snw1Q9CSN1 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snw1Q9CSN1 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snw1Q9CSN1 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snw1Q9CSN1 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snw1Q9CSN1 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snw1Q9CSN1 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snw1Q9CSN1 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Snw1Q9CSN1 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Snw1Q9CSN1 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Snw1Q9CSN1 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Snw1Q9CSN1 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Snw1Q9CSN1 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Snw1Q9CSN1 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Snw1Q9CSN1 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Snw1Q9CSN1 Gzf1-201ENSMUST00000028928 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Snw1Q9CSN1 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Snw1Q9CSN1 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Snw1Q9CSN1 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Snw1Q9CSN1 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Snw1Q9CSN1 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Snw1Q9CSN1 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Snw1Q9CSN1 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Snw1Q9CSN1 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Snw1Q9CSN1 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Snw1Q9CSN1 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Snw1Q9CSN1 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Snw1Q9CSN1 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Snw1Q9CSN1 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Snw1Q9CSN1 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Snw1Q9CSN1 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Snw1Q9CSN1 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Snw1Q9CSN1 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Snw1Q9CSN1 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Snw1Q9CSN1 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Snw1Q9CSN1 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Snw1Q9CSN1 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Snw1Q9CSN1 Ralgds-202ENSMUST00000100241 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Snw1Q9CSN1 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Snw1Q9CSN1 Kcnk16-202ENSMUST00000225596 2127 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Snw1Q9CSN1 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Snw1Q9CSN1 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Snw1Q9CSN1 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Snw1Q9CSN1 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Snw1Q9CSN1 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Snw1Q9CSN1 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Snw1Q9CSN1 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Snw1Q9CSN1 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Snw1Q9CSN1 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Snw1Q9CSN1 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Snw1Q9CSN1 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Snw1Q9CSN1 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Snw1Q9CSN1 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Snw1Q9CSN1 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Snw1Q9CSN1 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Snw1Q9CSN1 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Snw1Q9CSN1 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Snw1Q9CSN1 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Snw1Q9CSN1 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Snw1Q9CSN1 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Snw1Q9CSN1 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Snw1Q9CSN1 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Snw1Q9CSN1 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Snw1Q9CSN1 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Snw1Q9CSN1 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Snw1Q9CSN1 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Snw1Q9CSN1 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Snw1Q9CSN1 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Snw1Q9CSN1 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Snw1Q9CSN1 Gne-209ENSMUST00000173234 2149 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Snw1Q9CSN1 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Snw1Q9CSN1 Adamts16-201ENSMUST00000080145 4981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Snw1Q9CSN1 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Snw1Q9CSN1 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38 ms