Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQC3

Protein C9orf135 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CQC3 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Q9CQC3 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Q9CQC3 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Q9CQC3 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Q9CQC3 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Q9CQC3 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Q9CQC3 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Q9CQC3 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Q9CQC3 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Q9CQC3 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Q9CQC3 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Q9CQC3 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Q9CQC3 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Q9CQC3 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Q9CQC3 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Q9CQC3 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Q9CQC3 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Q9CQC3 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Q9CQC3 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Q9CQC3 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Q9CQC3 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Q9CQC3 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Q9CQC3 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Q9CQC3 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Q9CQC3 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Q9CQC3 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Q9CQC3 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Q9CQC3 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Q9CQC3 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Q9CQC3 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Q9CQC3 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Q9CQC3 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Q9CQC3 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Q9CQC3 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Q9CQC3 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Q9CQC3 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Q9CQC3 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Q9CQC3 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Q9CQC3 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Q9CQC3 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Q9CQC3 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Q9CQC3 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Q9CQC3 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Q9CQC3 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Q9CQC3 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Q9CQC3 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Q9CQC3 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Q9CQC3 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Q9CQC3 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Q9CQC3 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Q9CQC3 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Q9CQC3 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Q9CQC3 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Q9CQC3 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Q9CQC3 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Q9CQC3 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Q9CQC3 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Q9CQC3 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Q9CQC3 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Q9CQC3 Gm9755-201ENSMUST00000032981 1356 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Q9CQC3 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Q9CQC3 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Q9CQC3 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Q9CQC3 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Q9CQC3 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Q9CQC3 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Q9CQC3 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Q9CQC3 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Q9CQC3 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Q9CQC3 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Q9CQC3 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Q9CQC3 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Q9CQC3 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Q9CQC3 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Q9CQC3 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Q9CQC3 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Q9CQC3 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Q9CQC3 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Q9CQC3 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Q9CQC3 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Q9CQC3 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Q9CQC3 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Q9CQC3 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Q9CQC3 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Q9CQC3 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Q9CQC3 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Q9CQC3 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Q9CQC3 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Q9CQC3 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Q9CQC3 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Q9CQC3 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Q9CQC3 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Q9CQC3 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Q9CQC3 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Q9CQC3 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Q9CQC3 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Q9CQC3 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Q9CQC3 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Q9CQC3 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Q9CQC3 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
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