Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ94

Dnajc5b, DnaJ homolog subfamily C member 5B, mousemouse

Predictions only

Length 199 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnajc5bQ9CQ94 CT010431.1-201ENSMUST00000221249 1080 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Dnajc5bQ9CQ94 AC113282.2-201ENSMUST00000224012 945 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Dnajc5bQ9CQ94 AC113282.3-201ENSMUST00000224757 942 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Dnajc5bQ9CQ94 Mgp-201ENSMUST00000032342 617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Dnajc5bQ9CQ94 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Dnajc5bQ9CQ94 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Dnajc5bQ9CQ94 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Dnajc5bQ9CQ94 Ube2a-201ENSMUST00000016452 1732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Dnajc5bQ9CQ94 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Dnajc5bQ9CQ94 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Dnajc5bQ9CQ94 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Dnajc5bQ9CQ94 Dph7-201ENSMUST00000028351 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Dnajc5bQ9CQ94 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Dnajc5bQ9CQ94 Chchd7-202ENSMUST00000108386 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Dnajc5bQ9CQ94 Cdk2ap1-202ENSMUST00000111472 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Dnajc5bQ9CQ94 Gm11578-201ENSMUST00000118530 459 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Dnajc5bQ9CQ94 Chchd7-206ENSMUST00000121110 381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Dnajc5bQ9CQ94 Gm14198-201ENSMUST00000153208 948 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Dnajc5bQ9CQ94 Gm22146-201ENSMUST00000157397 288 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Dnajc5bQ9CQ94 Pitpnm2os2-201ENSMUST00000159053 828 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Dnajc5bQ9CQ94 Elof1-202ENSMUST00000166335 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Dnajc5bQ9CQ94 Gm20662-201ENSMUST00000176356 601 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Dnajc5bQ9CQ94 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Dnajc5bQ9CQ94 Gm28882-201ENSMUST00000185504 314 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Dnajc5bQ9CQ94 Gm37695-201ENSMUST00000191765 530 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Dnajc5bQ9CQ94 Gm43552-201ENSMUST00000196121 365 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Dnajc5bQ9CQ94 Gm45909-201ENSMUST00000212413 1031 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Dnajc5bQ9CQ94 AC102368.1-201ENSMUST00000227161 892 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Dnajc5bQ9CQ94 1700028J19Rik-201ENSMUST00000037220 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Dnajc5bQ9CQ94 Cox5a-201ENSMUST00000000090 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Dnajc5bQ9CQ94 Gm10775-201ENSMUST00000099425 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Dnajc5bQ9CQ94 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Dnajc5bQ9CQ94 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Dnajc5bQ9CQ94 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Dnajc5bQ9CQ94 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Dnajc5bQ9CQ94 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Dnajc5bQ9CQ94 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Dnajc5bQ9CQ94 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Dnajc5bQ9CQ94 Gtf2f1-201ENSMUST00000002733 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Dnajc5bQ9CQ94 Gm24891-201ENSMUST00000104391 136 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Dnajc5bQ9CQ94 Eef1d-207ENSMUST00000116440 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Dnajc5bQ9CQ94 Gm11422-201ENSMUST00000118925 1103 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Dnajc5bQ9CQ94 Gm16178-201ENSMUST00000129408 677 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Dnajc5bQ9CQ94 Gm23085-201ENSMUST00000157849 293 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Dnajc5bQ9CQ94 Gm7568-202ENSMUST00000160446 709 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Dnajc5bQ9CQ94 Abhd14a-203ENSMUST00000171925 1122 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Dnajc5bQ9CQ94 6430590A07Rik-201ENSMUST00000181813 1032 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Dnajc5bQ9CQ94 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Dnajc5bQ9CQ94 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Dnajc5bQ9CQ94 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Dnajc5bQ9CQ94 Dusp14-201ENSMUST00000018792 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Dnajc5bQ9CQ94 Atp5s-204ENSMUST00000220916 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Dnajc5bQ9CQ94 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Dnajc5bQ9CQ94 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Dnajc5bQ9CQ94 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Dnajc5bQ9CQ94 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Dnajc5bQ9CQ94 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Dnajc5bQ9CQ94 Mrps23-201ENSMUST00000024486 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Dnajc5bQ9CQ94 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Dnajc5bQ9CQ94 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Dnajc5bQ9CQ94 Cdc45-202ENSMUST00000096990 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Dnajc5bQ9CQ94 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Dnajc5bQ9CQ94 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Dnajc5bQ9CQ94 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Dnajc5bQ9CQ94 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Dnajc5bQ9CQ94 Use1-202ENSMUST00000110053 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Dnajc5bQ9CQ94 Nudt7-204ENSMUST00000134593 707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Dnajc5bQ9CQ94 Gm26782-202ENSMUST00000181697 971 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Dnajc5bQ9CQ94 A930036I15Rik-201ENSMUST00000196018 1045 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Dnajc5bQ9CQ94 Gm6450-201ENSMUST00000200896 574 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Dnajc5bQ9CQ94 AC135669.1-202ENSMUST00000216742 540 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Dnajc5bQ9CQ94 AC167013.1-201ENSMUST00000228592 202 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Dnajc5bQ9CQ94 Ly96-201ENSMUST00000026881 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Dnajc5bQ9CQ94 Rpl9-ps6-201ENSMUST00000078034 691 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Dnajc5bQ9CQ94 Pja1-204ENSMUST00000113797 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Dnajc5bQ9CQ94 5033403F01Rik-201ENSMUST00000181376 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Dnajc5bQ9CQ94 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Dnajc5bQ9CQ94 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Dnajc5bQ9CQ94 Ppox-201ENSMUST00000073120 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Dnajc5bQ9CQ94 Ggt6-201ENSMUST00000076443 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Dnajc5bQ9CQ94 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Dnajc5bQ9CQ94 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Dnajc5bQ9CQ94 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Dnajc5bQ9CQ94 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Dnajc5bQ9CQ94 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Dnajc5bQ9CQ94 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Dnajc5bQ9CQ94 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Dnajc5bQ9CQ94 Ins2-203ENSMUST00000105931 472 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Dnajc5bQ9CQ94 Gm12337-201ENSMUST00000119634 400 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Dnajc5bQ9CQ94 Gm15595-201ENSMUST00000120840 961 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Dnajc5bQ9CQ94 Gm11706-201ENSMUST00000151282 316 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Dnajc5bQ9CQ94 Gm7211-201ENSMUST00000172692 1118 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Dnajc5bQ9CQ94 Magohb-205ENSMUST00000173837 897 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Dnajc5bQ9CQ94 Gm13272-201ENSMUST00000179425 811 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Dnajc5bQ9CQ94 Olfr431-ps1-201ENSMUST00000192435 544 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Dnajc5bQ9CQ94 Gm17877-201ENSMUST00000192578 814 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Dnajc5bQ9CQ94 Ssr4-201ENSMUST00000002090 765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Dnajc5bQ9CQ94 AC110091.3-202ENSMUST00000217104 791 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Dnajc5bQ9CQ94 Gm4930-201ENSMUST00000219926 1087 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Dnajc5bQ9CQ94 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.8 ms