Protein–RNA interactions for Protein: Q99L02

Pagr1a, PAXIP1-associated glutamate-rich protein 1A, mousemouse

Predictions only

Length 253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pagr1aQ99L02 Gm12167-201ENSMUST00000148132 578 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pagr1aQ99L02 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pagr1aQ99L02 Gm38341-201ENSMUST00000195357 515 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Pagr1aQ99L02 Gm44632-201ENSMUST00000207245 474 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pagr1aQ99L02 CT033793.1-201ENSMUST00000216883 565 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pagr1aQ99L02 AC154462.2-201ENSMUST00000227519 370 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Pagr1aQ99L02 Krtap4-7-201ENSMUST00000055121 984 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pagr1aQ99L02 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pagr1aQ99L02 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pagr1aQ99L02 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pagr1aQ99L02 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pagr1aQ99L02 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pagr1aQ99L02 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pagr1aQ99L02 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pagr1aQ99L02 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pagr1aQ99L02 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pagr1aQ99L02 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pagr1aQ99L02 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pagr1aQ99L02 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pagr1aQ99L02 Akp-ps1-201ENSMUST00000188050 1600 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Pagr1aQ99L02 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pagr1aQ99L02 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pagr1aQ99L02 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pagr1aQ99L02 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pagr1aQ99L02 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pagr1aQ99L02 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pagr1aQ99L02 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pagr1aQ99L02 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pagr1aQ99L02 Phlda2-201ENSMUST00000010904 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pagr1aQ99L02 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pagr1aQ99L02 Gm8805-201ENSMUST00000117848 313 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Pagr1aQ99L02 4930524O07Rik-201ENSMUST00000161822 1050 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pagr1aQ99L02 Gm6222-202ENSMUST00000182143 629 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Pagr1aQ99L02 Gm29396-201ENSMUST00000185659 716 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Pagr1aQ99L02 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pagr1aQ99L02 Gm4857-201ENSMUST00000192718 785 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Pagr1aQ99L02 Gm36937-201ENSMUST00000192957 429 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pagr1aQ99L02 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pagr1aQ99L02 Tmem205-203ENSMUST00000213698 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pagr1aQ99L02 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Pagr1aQ99L02 Mea1-201ENSMUST00000002845 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pagr1aQ99L02 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pagr1aQ99L02 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pagr1aQ99L02 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pagr1aQ99L02 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pagr1aQ99L02 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pagr1aQ99L02 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pagr1aQ99L02 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Pagr1aQ99L02 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pagr1aQ99L02 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pagr1aQ99L02 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pagr1aQ99L02 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Pagr1aQ99L02 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pagr1aQ99L02 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pagr1aQ99L02 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pagr1aQ99L02 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pagr1aQ99L02 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pagr1aQ99L02 Gulp1-203ENSMUST00000160854 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pagr1aQ99L02 Psmd13-208ENSMUST00000163610 1382 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pagr1aQ99L02 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pagr1aQ99L02 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pagr1aQ99L02 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pagr1aQ99L02 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pagr1aQ99L02 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pagr1aQ99L02 Inca1-203ENSMUST00000108542 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pagr1aQ99L02 Gm16202-201ENSMUST00000117532 544 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Pagr1aQ99L02 Gm12241-201ENSMUST00000118330 726 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Pagr1aQ99L02 Gm11658-201ENSMUST00000120913 1008 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Pagr1aQ99L02 Psme1-202ENSMUST00000172738 681 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pagr1aQ99L02 Gm2467-201ENSMUST00000182266 1010 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Pagr1aQ99L02 Gm6981-201ENSMUST00000182467 1008 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Pagr1aQ99L02 1500004A13Rik-208ENSMUST00000184958 823 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pagr1aQ99L02 Lats2-202ENSMUST00000038381 933 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pagr1aQ99L02 Nr0b2-201ENSMUST00000042706 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pagr1aQ99L02 Olfr1346-201ENSMUST00000056144 1051 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pagr1aQ99L02 A430005L14Rik-201ENSMUST00000058393 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pagr1aQ99L02 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pagr1aQ99L02 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pagr1aQ99L02 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pagr1aQ99L02 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pagr1aQ99L02 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pagr1aQ99L02 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pagr1aQ99L02 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pagr1aQ99L02 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pagr1aQ99L02 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pagr1aQ99L02 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pagr1aQ99L02 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pagr1aQ99L02 Sgce-201ENSMUST00000004750 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pagr1aQ99L02 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pagr1aQ99L02 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pagr1aQ99L02 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pagr1aQ99L02 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pagr1aQ99L02 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pagr1aQ99L02 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pagr1aQ99L02 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pagr1aQ99L02 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pagr1aQ99L02 Creb3-206ENSMUST00000167751 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pagr1aQ99L02 Pced1c-ps-201ENSMUST00000187740 751 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Pagr1aQ99L02 Gm18827-201ENSMUST00000188341 790 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Pagr1aQ99L02 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms