Protein–RNA interactions for Protein: Q8VEJ9

Vps4a, Vacuolar protein sorting-associated protein 4A, mousemouse

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps4aQ8VEJ9 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Vps4aQ8VEJ9 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Vps4aQ8VEJ9 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Vps4aQ8VEJ9 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Vps4aQ8VEJ9 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Vps4aQ8VEJ9 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Vps4aQ8VEJ9 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Vps4aQ8VEJ9 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Vps4aQ8VEJ9 Gsdme-201ENSMUST00000031845 2502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Vps4aQ8VEJ9 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Vps4aQ8VEJ9 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Vps4aQ8VEJ9 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Vps4aQ8VEJ9 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Vps4aQ8VEJ9 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Vps4aQ8VEJ9 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Vps4aQ8VEJ9 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Vps4aQ8VEJ9 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Vps4aQ8VEJ9 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Vps4aQ8VEJ9 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Vps4aQ8VEJ9 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Vps4aQ8VEJ9 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Vps4aQ8VEJ9 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Vps4aQ8VEJ9 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Vps4aQ8VEJ9 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Vps4aQ8VEJ9 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Vps4aQ8VEJ9 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Vps4aQ8VEJ9 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Vps4aQ8VEJ9 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Vps4aQ8VEJ9 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Vps4aQ8VEJ9 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Vps4aQ8VEJ9 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Vps4aQ8VEJ9 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Vps4aQ8VEJ9 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Vps4aQ8VEJ9 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Vps4aQ8VEJ9 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Vps4aQ8VEJ9 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Vps4aQ8VEJ9 Mrpl40-202ENSMUST00000119273 778 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Vps4aQ8VEJ9 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Vps4aQ8VEJ9 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Vps4aQ8VEJ9 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Vps4aQ8VEJ9 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Vps4aQ8VEJ9 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Vps4aQ8VEJ9 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Vps4aQ8VEJ9 Gas5-210ENSMUST00000159706 557 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Vps4aQ8VEJ9 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Vps4aQ8VEJ9 Mir7085-201ENSMUST00000184353 66 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Vps4aQ8VEJ9 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Vps4aQ8VEJ9 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Vps4aQ8VEJ9 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Vps4aQ8VEJ9 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Vps4aQ8VEJ9 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Vps4aQ8VEJ9 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Vps4aQ8VEJ9 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Vps4aQ8VEJ9 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Vps4aQ8VEJ9 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Vps4aQ8VEJ9 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Vps4aQ8VEJ9 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Vps4aQ8VEJ9 Ntng1-208ENSMUST00000133268 5587 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Vps4aQ8VEJ9 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Vps4aQ8VEJ9 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Vps4aQ8VEJ9 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Vps4aQ8VEJ9 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Vps4aQ8VEJ9 Armc8-201ENSMUST00000035043 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Vps4aQ8VEJ9 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Vps4aQ8VEJ9 Etl4-201ENSMUST00000045555 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Vps4aQ8VEJ9 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Vps4aQ8VEJ9 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Vps4aQ8VEJ9 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Vps4aQ8VEJ9 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Vps4aQ8VEJ9 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Vps4aQ8VEJ9 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Vps4aQ8VEJ9 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Vps4aQ8VEJ9 Adgrl1-204ENSMUST00000131717 5152 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Vps4aQ8VEJ9 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Vps4aQ8VEJ9 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Vps4aQ8VEJ9 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Vps4aQ8VEJ9 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Vps4aQ8VEJ9 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Vps4aQ8VEJ9 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Vps4aQ8VEJ9 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Vps4aQ8VEJ9 D430019H16Rik-201ENSMUST00000178224 5786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Vps4aQ8VEJ9 Lmo7-201ENSMUST00000100337 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Vps4aQ8VEJ9 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Vps4aQ8VEJ9 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Vps4aQ8VEJ9 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Vps4aQ8VEJ9 Bcl11a-202ENSMUST00000109514 5989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Vps4aQ8VEJ9 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Vps4aQ8VEJ9 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Vps4aQ8VEJ9 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Vps4aQ8VEJ9 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Vps4aQ8VEJ9 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Vps4aQ8VEJ9 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Vps4aQ8VEJ9 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Vps4aQ8VEJ9 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Vps4aQ8VEJ9 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Vps4aQ8VEJ9 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Vps4aQ8VEJ9 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Vps4aQ8VEJ9 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Vps4aQ8VEJ9 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Vps4aQ8VEJ9 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.3 ms