Protein–RNA interactions for Protein: Q8K1J5

Sde2, Replication stress response regulator SDE2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 448 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sde2Q8K1J5 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sde2Q8K1J5 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sde2Q8K1J5 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sde2Q8K1J5 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sde2Q8K1J5 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sde2Q8K1J5 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sde2Q8K1J5 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sde2Q8K1J5 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sde2Q8K1J5 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sde2Q8K1J5 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sde2Q8K1J5 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sde2Q8K1J5 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sde2Q8K1J5 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sde2Q8K1J5 Tmod4-202ENSMUST00000107227 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sde2Q8K1J5 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sde2Q8K1J5 Gm13297-201ENSMUST00000120205 934 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Sde2Q8K1J5 Gm45692-201ENSMUST00000131138 557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sde2Q8K1J5 Gm26083-201ENSMUST00000157904 193 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Sde2Q8K1J5 Gm2991-201ENSMUST00000173338 480 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Sde2Q8K1J5 Gm37489-201ENSMUST00000191883 159 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Sde2Q8K1J5 1700045I11Rik-201ENSMUST00000194752 493 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Sde2Q8K1J5 Gm7118-201ENSMUST00000200167 1003 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Sde2Q8K1J5 Ifi30-202ENSMUST00000222087 981 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sde2Q8K1J5 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sde2Q8K1J5 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sde2Q8K1J5 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sde2Q8K1J5 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sde2Q8K1J5 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sde2Q8K1J5 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sde2Q8K1J5 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sde2Q8K1J5 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sde2Q8K1J5 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sde2Q8K1J5 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sde2Q8K1J5 Rab3a-203ENSMUST00000110092 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sde2Q8K1J5 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sde2Q8K1J5 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sde2Q8K1J5 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sde2Q8K1J5 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sde2Q8K1J5 9230102O04Rik-201ENSMUST00000114915 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sde2Q8K1J5 Gm12363-201ENSMUST00000122250 668 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Sde2Q8K1J5 Cdk3-ps-202ENSMUST00000174177 915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sde2Q8K1J5 Gm3890-201ENSMUST00000182416 207 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Sde2Q8K1J5 Gm28693-202ENSMUST00000190758 331 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Sde2Q8K1J5 Gm6621-201ENSMUST00000193251 772 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Sde2Q8K1J5 Gm31651-201ENSMUST00000198864 560 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sde2Q8K1J5 AC132384.14-201ENSMUST00000219346 1147 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Sde2Q8K1J5 Dph3-201ENSMUST00000022461 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sde2Q8K1J5 4930442H23Rik-201ENSMUST00000056086 1245 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sde2Q8K1J5 1700007G11Rik-201ENSMUST00000080333 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sde2Q8K1J5 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sde2Q8K1J5 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sde2Q8K1J5 Taz-204ENSMUST00000124200 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sde2Q8K1J5 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sde2Q8K1J5 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sde2Q8K1J5 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sde2Q8K1J5 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sde2Q8K1J5 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sde2Q8K1J5 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sde2Q8K1J5 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sde2Q8K1J5 Ccdc94-201ENSMUST00000086869 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sde2Q8K1J5 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sde2Q8K1J5 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sde2Q8K1J5 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sde2Q8K1J5 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sde2Q8K1J5 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sde2Q8K1J5 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sde2Q8K1J5 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sde2Q8K1J5 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sde2Q8K1J5 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sde2Q8K1J5 Gm37885-201ENSMUST00000192568 1391 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sde2Q8K1J5 Inca1-203ENSMUST00000108542 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sde2Q8K1J5 Ufc1-202ENSMUST00000111302 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sde2Q8K1J5 Gm15046-201ENSMUST00000130153 408 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sde2Q8K1J5 Gm15501-201ENSMUST00000133910 849 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sde2Q8K1J5 Gm7008-202ENSMUST00000170019 402 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sde2Q8K1J5 Mospd4-201ENSMUST00000180618 576 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Sde2Q8K1J5 Gm37259-201ENSMUST00000193903 849 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Sde2Q8K1J5 Gm7046-201ENSMUST00000221351 977 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Sde2Q8K1J5 n-R5s77-201ENSMUST00000083757 119 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Sde2Q8K1J5 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sde2Q8K1J5 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sde2Q8K1J5 Olfr763-201ENSMUST00000077460 2523 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sde2Q8K1J5 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sde2Q8K1J5 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sde2Q8K1J5 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sde2Q8K1J5 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sde2Q8K1J5 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sde2Q8K1J5 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sde2Q8K1J5 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sde2Q8K1J5 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sde2Q8K1J5 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sde2Q8K1J5 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sde2Q8K1J5 Gm3756-201ENSMUST00000169182 1355 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Sde2Q8K1J5 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sde2Q8K1J5 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sde2Q8K1J5 Zfp384-202ENSMUST00000054553 2451 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sde2Q8K1J5 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sde2Q8K1J5 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sde2Q8K1J5 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sde2Q8K1J5 Mir877-201ENSMUST00000104738 85 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.3 ms