Protein–RNA interactions for Protein: Q8CHZ9

Mterf1a, Transcription termination factor 1a, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 379 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mterf1aQ8CHZ9 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Mterf1aQ8CHZ9 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Mterf1aQ8CHZ9 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Mterf1aQ8CHZ9 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Mterf1aQ8CHZ9 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Mterf1aQ8CHZ9 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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Mterf1aQ8CHZ9 Acin1-221ENSMUST00000150371 2494 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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Mterf1aQ8CHZ9 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Mterf1aQ8CHZ9 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
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Mterf1aQ8CHZ9 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
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Mterf1aQ8CHZ9 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Mterf1aQ8CHZ9 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
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Mterf1aQ8CHZ9 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Mterf1aQ8CHZ9 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
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Mterf1aQ8CHZ9 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
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Mterf1aQ8CHZ9 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
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Mterf1aQ8CHZ9 Tlr9-201ENSMUST00000062241 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
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Mterf1aQ8CHZ9 Fbn1-201ENSMUST00000028633 9847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Mterf1aQ8CHZ9 Gm27194-201ENSMUST00000175753 2936 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
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Mterf1aQ8CHZ9 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Mterf1aQ8CHZ9 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Mterf1aQ8CHZ9 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Mterf1aQ8CHZ9 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
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Mterf1aQ8CHZ9 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Mterf1aQ8CHZ9 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Mterf1aQ8CHZ9 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Mterf1aQ8CHZ9 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Mterf1aQ8CHZ9 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Mterf1aQ8CHZ9 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Mterf1aQ8CHZ9 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Mterf1aQ8CHZ9 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Mterf1aQ8CHZ9 4931429P17Rik-201ENSMUST00000061899 2012 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Mterf1aQ8CHZ9 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Mterf1aQ8CHZ9 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Mterf1aQ8CHZ9 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Mterf1aQ8CHZ9 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Mterf1aQ8CHZ9 Gm9279-201ENSMUST00000223175 1606 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Mterf1aQ8CHZ9 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Mterf1aQ8CHZ9 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Mterf1aQ8CHZ9 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Mterf1aQ8CHZ9 Stox2-201ENSMUST00000079195 10467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Mterf1aQ8CHZ9 Hid1-202ENSMUST00000106542 3276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Mterf1aQ8CHZ9 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.8 ms