Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFE2

Hpf1, Histone PARylation factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 346 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hpf1Q8CFE2 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Hpf1Q8CFE2 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Hpf1Q8CFE2 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Hpf1Q8CFE2 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Hpf1Q8CFE2 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Hpf1Q8CFE2 Slc22a15-201ENSMUST00000106928 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Hpf1Q8CFE2 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Hpf1Q8CFE2 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Hpf1Q8CFE2 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Hpf1Q8CFE2 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Hpf1Q8CFE2 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Hpf1Q8CFE2 Bach2-201ENSMUST00000037416 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Hpf1Q8CFE2 Cfap69-201ENSMUST00000054865 4956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Hpf1Q8CFE2 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Hpf1Q8CFE2 Olfr279-202ENSMUST00000205772 5330 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Hpf1Q8CFE2 Trabd2b-201ENSMUST00000094894 6617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Hpf1Q8CFE2 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Hpf1Q8CFE2 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
Hpf1Q8CFE2 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Hpf1Q8CFE2 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Hpf1Q8CFE2 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Hpf1Q8CFE2 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Hpf1Q8CFE2 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Hpf1Q8CFE2 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Hpf1Q8CFE2 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Hpf1Q8CFE2 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
Hpf1Q8CFE2 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Hpf1Q8CFE2 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Hpf1Q8CFE2 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Hpf1Q8CFE2 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Hpf1Q8CFE2 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Hpf1Q8CFE2 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Hpf1Q8CFE2 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Hpf1Q8CFE2 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Hpf1Q8CFE2 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Hpf1Q8CFE2 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Hpf1Q8CFE2 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Hpf1Q8CFE2 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Hpf1Q8CFE2 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Hpf1Q8CFE2 Phf21a-206ENSMUST00000111292 2461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Hpf1Q8CFE2 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Hpf1Q8CFE2 Igf2r-201ENSMUST00000024599 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Hpf1Q8CFE2 C530008M17Rik-204ENSMUST00000121160 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Hpf1Q8CFE2 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Hpf1Q8CFE2 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Hpf1Q8CFE2 Vmn1r198-203ENSMUST00000226909 6259 ntAPPRIS P2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Hpf1Q8CFE2 Bptf-203ENSMUST00000106763 12036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Hpf1Q8CFE2 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Hpf1Q8CFE2 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Hpf1Q8CFE2 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Hpf1Q8CFE2 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Hpf1Q8CFE2 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Hpf1Q8CFE2 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Hpf1Q8CFE2 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Hpf1Q8CFE2 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Hpf1Q8CFE2 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Hpf1Q8CFE2 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Hpf1Q8CFE2 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Hpf1Q8CFE2 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Hpf1Q8CFE2 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Hpf1Q8CFE2 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Hpf1Q8CFE2 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Hpf1Q8CFE2 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Hpf1Q8CFE2 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Hpf1Q8CFE2 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Hpf1Q8CFE2 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Hpf1Q8CFE2 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Hpf1Q8CFE2 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Hpf1Q8CFE2 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Hpf1Q8CFE2 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Hpf1Q8CFE2 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Hpf1Q8CFE2 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Hpf1Q8CFE2 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Hpf1Q8CFE2 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Hpf1Q8CFE2 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Hpf1Q8CFE2 Gm45740-201ENSMUST00000212103 2003 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Hpf1Q8CFE2 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Hpf1Q8CFE2 Scd2-201ENSMUST00000026221 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Hpf1Q8CFE2 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Hpf1Q8CFE2 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Hpf1Q8CFE2 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Hpf1Q8CFE2 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Hpf1Q8CFE2 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Hpf1Q8CFE2 Bcl11a-202ENSMUST00000109514 5989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Hpf1Q8CFE2 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Hpf1Q8CFE2 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Hpf1Q8CFE2 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Hpf1Q8CFE2 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Hpf1Q8CFE2 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Hpf1Q8CFE2 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Hpf1Q8CFE2 Spon1-201ENSMUST00000046687 6161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Hpf1Q8CFE2 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Hpf1Q8CFE2 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Hpf1Q8CFE2 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Hpf1Q8CFE2 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Hpf1Q8CFE2 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Hpf1Q8CFE2 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Hpf1Q8CFE2 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Hpf1Q8CFE2 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Hpf1Q8CFE2 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms