Protein–RNA interactions for Protein: Q8C1M2

Znf428, Zinc finger protein 428, mousemouse

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Length 176 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf428Q8C1M2 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Znf428Q8C1M2 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Znf428Q8C1M2 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Znf428Q8C1M2 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Znf428Q8C1M2 Gm26826-201ENSMUST00000181317 1395 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Znf428Q8C1M2 Acsl6-201ENSMUST00000000145 2297 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Znf428Q8C1M2 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Znf428Q8C1M2 Slamf7-204ENSMUST00000194531 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Znf428Q8C1M2 Gm5106-201ENSMUST00000181058 1334 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Znf428Q8C1M2 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Znf428Q8C1M2 Sdccag8-202ENSMUST00000056773 1551 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Znf428Q8C1M2 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Znf428Q8C1M2 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Znf428Q8C1M2 Elovl1-203ENSMUST00000102673 1248 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Znf428Q8C1M2 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Znf428Q8C1M2 Gm2231-201ENSMUST00000125661 612 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
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Znf428Q8C1M2 Gm29856-201ENSMUST00000191905 1257 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Znf428Q8C1M2 Gm31256-201ENSMUST00000194705 506 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Znf428Q8C1M2 AC153974.2-201ENSMUST00000218577 1025 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Znf428Q8C1M2 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Znf428Q8C1M2 Itln1-201ENSMUST00000043094 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Znf428Q8C1M2 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Znf428Q8C1M2 Mrpl18-201ENSMUST00000079121 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Znf428Q8C1M2 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Znf428Q8C1M2 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Znf428Q8C1M2 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Znf428Q8C1M2 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Znf428Q8C1M2 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Znf428Q8C1M2 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Znf428Q8C1M2 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Znf428Q8C1M2 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Znf428Q8C1M2 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Znf428Q8C1M2 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Znf428Q8C1M2 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
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Znf428Q8C1M2 Birc7-201ENSMUST00000108875 1178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
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Znf428Q8C1M2 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
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Znf428Q8C1M2 Kcnk7-201ENSMUST00000052448 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
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Znf428Q8C1M2 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Znf428Q8C1M2 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Znf428Q8C1M2 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Znf428Q8C1M2 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
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Znf428Q8C1M2 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Znf428Q8C1M2 Tomt-202ENSMUST00000106970 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Znf428Q8C1M2 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Znf428Q8C1M2 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Znf428Q8C1M2 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Znf428Q8C1M2 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Znf428Q8C1M2 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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Znf428Q8C1M2 Spata24-202ENSMUST00000096573 709 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Znf428Q8C1M2 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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Znf428Q8C1M2 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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Znf428Q8C1M2 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Znf428Q8C1M2 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Znf428Q8C1M2 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Znf428Q8C1M2 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Znf428Q8C1M2 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Znf428Q8C1M2 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Znf428Q8C1M2 C530008M17Rik-204ENSMUST00000121160 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Znf428Q8C1M2 Lexm-204ENSMUST00000189032 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Znf428Q8C1M2 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Znf428Q8C1M2 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Znf428Q8C1M2 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Znf428Q8C1M2 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Znf428Q8C1M2 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Znf428Q8C1M2 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Znf428Q8C1M2 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Znf428Q8C1M2 Lamr1-ps1-201ENSMUST00000119759 874 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
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Znf428Q8C1M2 Gm12348-201ENSMUST00000138915 313 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Znf428Q8C1M2 Aamdc-210ENSMUST00000146605 642 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Znf428Q8C1M2 Igdcc4-203ENSMUST00000166273 778 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Znf428Q8C1M2 Gm20457-201ENSMUST00000173374 682 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Znf428Q8C1M2 Gm19605-201ENSMUST00000220603 686 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms