Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0C4

Ccser1, Serine-rich coiled-coil domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 895 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccser1Q8C0C4 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccser1Q8C0C4 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccser1Q8C0C4 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccser1Q8C0C4 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccser1Q8C0C4 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccser1Q8C0C4 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccser1Q8C0C4 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccser1Q8C0C4 Neurl3-202ENSMUST00000188666 1206 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccser1Q8C0C4 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccser1Q8C0C4 Gm42929-201ENSMUST00000198374 1286 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccser1Q8C0C4 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccser1Q8C0C4 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccser1Q8C0C4 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccser1Q8C0C4 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccser1Q8C0C4 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccser1Q8C0C4 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccser1Q8C0C4 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccser1Q8C0C4 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccser1Q8C0C4 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccser1Q8C0C4 Araf-203ENSMUST00000122312 2854 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccser1Q8C0C4 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccser1Q8C0C4 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccser1Q8C0C4 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccser1Q8C0C4 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccser1Q8C0C4 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccser1Q8C0C4 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccser1Q8C0C4 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccser1Q8C0C4 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccser1Q8C0C4 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccser1Q8C0C4 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccser1Q8C0C4 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccser1Q8C0C4 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccser1Q8C0C4 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccser1Q8C0C4 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccser1Q8C0C4 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccser1Q8C0C4 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccser1Q8C0C4 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccser1Q8C0C4 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccser1Q8C0C4 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccser1Q8C0C4 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccser1Q8C0C4 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccser1Q8C0C4 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccser1Q8C0C4 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccser1Q8C0C4 Gm11803-201ENSMUST00000119966 444 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccser1Q8C0C4 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccser1Q8C0C4 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccser1Q8C0C4 Proscos-202ENSMUST00000178990 666 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccser1Q8C0C4 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccser1Q8C0C4 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccser1Q8C0C4 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccser1Q8C0C4 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccser1Q8C0C4 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccser1Q8C0C4 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccser1Q8C0C4 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccser1Q8C0C4 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccser1Q8C0C4 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccser1Q8C0C4 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccser1Q8C0C4 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccser1Q8C0C4 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccser1Q8C0C4 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccser1Q8C0C4 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccser1Q8C0C4 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccser1Q8C0C4 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccser1Q8C0C4 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccser1Q8C0C4 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccser1Q8C0C4 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccser1Q8C0C4 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccser1Q8C0C4 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccser1Q8C0C4 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccser1Q8C0C4 Mypopos-202ENSMUST00000205975 2321 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccser1Q8C0C4 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccser1Q8C0C4 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccser1Q8C0C4 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccser1Q8C0C4 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccser1Q8C0C4 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccser1Q8C0C4 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccser1Q8C0C4 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccser1Q8C0C4 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccser1Q8C0C4 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccser1Q8C0C4 Gm24196-201ENSMUST00000179161 110 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccser1Q8C0C4 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccser1Q8C0C4 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccser1Q8C0C4 Gm9124-201ENSMUST00000191789 1092 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccser1Q8C0C4 Gm9113-201ENSMUST00000192510 1018 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccser1Q8C0C4 Gm9131-201ENSMUST00000193557 1089 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccser1Q8C0C4 Gm9121-201ENSMUST00000193749 1071 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccser1Q8C0C4 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccser1Q8C0C4 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccser1Q8C0C4 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccser1Q8C0C4 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccser1Q8C0C4 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccser1Q8C0C4 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccser1Q8C0C4 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccser1Q8C0C4 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccser1Q8C0C4 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccser1Q8C0C4 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccser1Q8C0C4 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccser1Q8C0C4 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccser1Q8C0C4 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccser1Q8C0C4 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
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