Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX07

Ctdsp2, Carboxy-terminal domain RNA polymerase II polypeptide A small phosphatase 2, mousemouse

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Length 270 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdsp2Q8BX07 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ctdsp2Q8BX07 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Ctdsp2Q8BX07 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ctdsp2Q8BX07 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ctdsp2Q8BX07 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Ctdsp2Q8BX07 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ctdsp2Q8BX07 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ctdsp2Q8BX07 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ctdsp2Q8BX07 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ctdsp2Q8BX07 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ctdsp2Q8BX07 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ctdsp2Q8BX07 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ctdsp2Q8BX07 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ctdsp2Q8BX07 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ctdsp2Q8BX07 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ctdsp2Q8BX07 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ctdsp2Q8BX07 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ctdsp2Q8BX07 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ctdsp2Q8BX07 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ctdsp2Q8BX07 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ctdsp2Q8BX07 Gsdme-201ENSMUST00000031845 2502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ctdsp2Q8BX07 Chrna10-201ENSMUST00000084830 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ctdsp2Q8BX07 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ctdsp2Q8BX07 Gm45332-201ENSMUST00000210508 1949 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ctdsp2Q8BX07 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ctdsp2Q8BX07 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ctdsp2Q8BX07 Gart-201ENSMUST00000023684 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ctdsp2Q8BX07 Daglb-201ENSMUST00000045593 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ctdsp2Q8BX07 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ctdsp2Q8BX07 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ctdsp2Q8BX07 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ctdsp2Q8BX07 Pcdhgc3-201ENSMUST00000076807 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ctdsp2Q8BX07 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ctdsp2Q8BX07 Slc26a5-201ENSMUST00000030878 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ctdsp2Q8BX07 Reep3-201ENSMUST00000020023 5430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ctdsp2Q8BX07 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ctdsp2Q8BX07 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ctdsp2Q8BX07 Smug1-201ENSMUST00000064067 3281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ctdsp2Q8BX07 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ctdsp2Q8BX07 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Ctdsp2Q8BX07 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Ctdsp2Q8BX07 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Ctdsp2Q8BX07 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Ctdsp2Q8BX07 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Ctdsp2Q8BX07 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ctdsp2Q8BX07 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ctdsp2Q8BX07 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ctdsp2Q8BX07 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Ctdsp2Q8BX07 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ctdsp2Q8BX07 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ctdsp2Q8BX07 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Ctdsp2Q8BX07 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Ctdsp2Q8BX07 D430019H16Rik-201ENSMUST00000178224 5786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ctdsp2Q8BX07 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ctdsp2Q8BX07 Asxl1-201ENSMUST00000109790 6968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ctdsp2Q8BX07 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ctdsp2Q8BX07 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ctdsp2Q8BX07 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ctdsp2Q8BX07 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ctdsp2Q8BX07 4930458D05Rik-201ENSMUST00000142871 3055 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ctdsp2Q8BX07 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ctdsp2Q8BX07 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ctdsp2Q8BX07 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ctdsp2Q8BX07 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ctdsp2Q8BX07 Syt1-202ENSMUST00000105276 4820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ctdsp2Q8BX07 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
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Ctdsp2Q8BX07 Pphln1-202ENSMUST00000068457 3816 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ctdsp2Q8BX07 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ctdsp2Q8BX07 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ctdsp2Q8BX07 Dhtkd1-202ENSMUST00000095147 5480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ctdsp2Q8BX07 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ctdsp2Q8BX07 Klhl38-201ENSMUST00000022985 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ctdsp2Q8BX07 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ctdsp2Q8BX07 Fbxl12-203ENSMUST00000131128 4182 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ctdsp2Q8BX07 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ctdsp2Q8BX07 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Ctdsp2Q8BX07 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ctdsp2Q8BX07 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ctdsp2Q8BX07 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ctdsp2Q8BX07 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ctdsp2Q8BX07 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ctdsp2Q8BX07 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Ctdsp2Q8BX07 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ctdsp2Q8BX07 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ctdsp2Q8BX07 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ctdsp2Q8BX07 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ctdsp2Q8BX07 Gm45643-201ENSMUST00000211364 1484 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Ctdsp2Q8BX07 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ctdsp2Q8BX07 Kiss1r-201ENSMUST00000045529 3163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ctdsp2Q8BX07 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ctdsp2Q8BX07 Sltm-206ENSMUST00000216816 3755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ctdsp2Q8BX07 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ctdsp2Q8BX07 Trp53i11-202ENSMUST00000111266 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ctdsp2Q8BX07 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ctdsp2Q8BX07 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ctdsp2Q8BX07 Ttc25-202ENSMUST00000092684 2240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ctdsp2Q8BX07 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ctdsp2Q8BX07 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ctdsp2Q8BX07 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
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