Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVF2

Pdcl3, Phosducin-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdcl3Q8BVF2 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Pdcl3Q8BVF2 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Pdcl3Q8BVF2 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pdcl3Q8BVF2 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pdcl3Q8BVF2 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Pdcl3Q8BVF2 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pdcl3Q8BVF2 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pdcl3Q8BVF2 Hk3-202ENSMUST00000123097 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pdcl3Q8BVF2 Zfp862-ps-204ENSMUST00000204484 6065 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pdcl3Q8BVF2 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pdcl3Q8BVF2 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pdcl3Q8BVF2 Cysltr2-202ENSMUST00000169168 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pdcl3Q8BVF2 Slc12a8-206ENSMUST00000122427 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pdcl3Q8BVF2 Gm5124-202ENSMUST00000132683 2083 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Pdcl3Q8BVF2 Apopt1-203ENSMUST00000162316 3107 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pdcl3Q8BVF2 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pdcl3Q8BVF2 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pdcl3Q8BVF2 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pdcl3Q8BVF2 Ppp1r10-202ENSMUST00000087211 4255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pdcl3Q8BVF2 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pdcl3Q8BVF2 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Pdcl3Q8BVF2 Bcar1-203ENSMUST00000212349 3116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Pdcl3Q8BVF2 Prkcsh-202ENSMUST00000115331 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Pdcl3Q8BVF2 Clcnkb-201ENSMUST00000006378 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pdcl3Q8BVF2 Arhgef3-204ENSMUST00000225949 3198 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Pdcl3Q8BVF2 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pdcl3Q8BVF2 Igsf9-201ENSMUST00000052629 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pdcl3Q8BVF2 4933412E12Rik-201ENSMUST00000217853 1698 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pdcl3Q8BVF2 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pdcl3Q8BVF2 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pdcl3Q8BVF2 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pdcl3Q8BVF2 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Pdcl3Q8BVF2 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Pdcl3Q8BVF2 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Pdcl3Q8BVF2 Dgcr8-201ENSMUST00000009321 4320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pdcl3Q8BVF2 Gsn-205ENSMUST00000201185 2607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pdcl3Q8BVF2 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Pdcl3Q8BVF2 Fgfr3-211ENSMUST00000171509 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pdcl3Q8BVF2 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pdcl3Q8BVF2 Acin1-208ENSMUST00000126166 2369 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pdcl3Q8BVF2 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pdcl3Q8BVF2 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pdcl3Q8BVF2 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pdcl3Q8BVF2 Gm3716-202ENSMUST00000198582 2879 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pdcl3Q8BVF2 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pdcl3Q8BVF2 Smtn-204ENSMUST00000110011 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pdcl3Q8BVF2 Sppl2a-201ENSMUST00000028844 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pdcl3Q8BVF2 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pdcl3Q8BVF2 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pdcl3Q8BVF2 AC241621.2-201ENSMUST00000223991 2151 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Pdcl3Q8BVF2 Gm37600-201ENSMUST00000193764 3292 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Pdcl3Q8BVF2 Lef1-204ENSMUST00000106341 3357 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pdcl3Q8BVF2 Lef1-202ENSMUST00000066849 3398 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pdcl3Q8BVF2 Wdfy1-204ENSMUST00000113512 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pdcl3Q8BVF2 Wdfy1-205ENSMUST00000113513 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pdcl3Q8BVF2 Wdfy1-206ENSMUST00000113514 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pdcl3Q8BVF2 Wdfy1-207ENSMUST00000113515 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pdcl3Q8BVF2 Gm5475-202ENSMUST00000148928 2320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pdcl3Q8BVF2 Lrrn4-201ENSMUST00000049787 3715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pdcl3Q8BVF2 Slc17a5-202ENSMUST00000117645 3114 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pdcl3Q8BVF2 CT025681.1-201ENSMUST00000225453 1855 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Pdcl3Q8BVF2 Cryz-208ENSMUST00000192462 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pdcl3Q8BVF2 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pdcl3Q8BVF2 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pdcl3Q8BVF2 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pdcl3Q8BVF2 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pdcl3Q8BVF2 Prkca-201ENSMUST00000059595 8409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pdcl3Q8BVF2 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pdcl3Q8BVF2 Myh13-202ENSMUST00000108684 6062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pdcl3Q8BVF2 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pdcl3Q8BVF2 Traf3ip2-201ENSMUST00000019987 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pdcl3Q8BVF2 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pdcl3Q8BVF2 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pdcl3Q8BVF2 Atp2b2-203ENSMUST00000101045 8877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pdcl3Q8BVF2 Gm44913-201ENSMUST00000208060 2990 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Pdcl3Q8BVF2 Grk4-202ENSMUST00000074651 3234 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pdcl3Q8BVF2 Slc16a12-201ENSMUST00000009522 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pdcl3Q8BVF2 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pdcl3Q8BVF2 Gm27177-202ENSMUST00000183514 2703 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Pdcl3Q8BVF2 Ggt6-201ENSMUST00000076443 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pdcl3Q8BVF2 Slc35f6-205ENSMUST00000196740 1972 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pdcl3Q8BVF2 AC160410.1-201ENSMUST00000219298 1972 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Pdcl3Q8BVF2 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pdcl3Q8BVF2 Olfr222-203ENSMUST00000215339 2166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pdcl3Q8BVF2 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pdcl3Q8BVF2 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pdcl3Q8BVF2 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Pdcl3Q8BVF2 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pdcl3Q8BVF2 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pdcl3Q8BVF2 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pdcl3Q8BVF2 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pdcl3Q8BVF2 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pdcl3Q8BVF2 Nr3c1-201ENSMUST00000025300 4989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pdcl3Q8BVF2 AC151895.1-201ENSMUST00000219025 1742 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Pdcl3Q8BVF2 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pdcl3Q8BVF2 Gpcpd1-205ENSMUST00000110142 3703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pdcl3Q8BVF2 Astl-201ENSMUST00000059839 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pdcl3Q8BVF2 Rnf6-201ENSMUST00000067837 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pdcl3Q8BVF2 Serpina1f-202ENSMUST00000117053 2830 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pdcl3Q8BVF2 Pars2-202ENSMUST00000106781 3046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.3 ms