Protein–RNA interactions for Protein: Q8BK72

Mrps27, 28S ribosomal protein S27, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 415 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrps27Q8BK72 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mrps27Q8BK72 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mrps27Q8BK72 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mrps27Q8BK72 Erg-201ENSMUST00000077773 2232 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mrps27Q8BK72 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mrps27Q8BK72 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mrps27Q8BK72 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mrps27Q8BK72 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mrps27Q8BK72 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mrps27Q8BK72 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mrps27Q8BK72 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mrps27Q8BK72 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mrps27Q8BK72 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mrps27Q8BK72 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mrps27Q8BK72 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mrps27Q8BK72 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mrps27Q8BK72 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mrps27Q8BK72 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mrps27Q8BK72 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mrps27Q8BK72 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mrps27Q8BK72 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mrps27Q8BK72 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mrps27Q8BK72 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mrps27Q8BK72 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Mrps27Q8BK72 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Mrps27Q8BK72 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Mrps27Q8BK72 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mrps27Q8BK72 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mrps27Q8BK72 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mrps27Q8BK72 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mrps27Q8BK72 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mrps27Q8BK72 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Mrps27Q8BK72 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mrps27Q8BK72 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mrps27Q8BK72 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mrps27Q8BK72 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mrps27Q8BK72 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mrps27Q8BK72 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mrps27Q8BK72 Gm44851-201ENSMUST00000205735 2309 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Mrps27Q8BK72 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mrps27Q8BK72 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mrps27Q8BK72 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mrps27Q8BK72 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mrps27Q8BK72 Lrrc30-201ENSMUST00000097290 1759 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mrps27Q8BK72 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mrps27Q8BK72 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mrps27Q8BK72 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mrps27Q8BK72 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mrps27Q8BK72 Gm45643-201ENSMUST00000211364 1484 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Mrps27Q8BK72 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mrps27Q8BK72 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mrps27Q8BK72 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mrps27Q8BK72 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mrps27Q8BK72 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mrps27Q8BK72 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mrps27Q8BK72 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mrps27Q8BK72 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mrps27Q8BK72 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mrps27Q8BK72 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mrps27Q8BK72 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Mrps27Q8BK72 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mrps27Q8BK72 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mrps27Q8BK72 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mrps27Q8BK72 Ankfn1-201ENSMUST00000050983 2665 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mrps27Q8BK72 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mrps27Q8BK72 AC151895.1-201ENSMUST00000219025 1742 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Mrps27Q8BK72 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mrps27Q8BK72 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mrps27Q8BK72 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mrps27Q8BK72 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mrps27Q8BK72 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mrps27Q8BK72 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mrps27Q8BK72 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mrps27Q8BK72 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mrps27Q8BK72 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mrps27Q8BK72 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mrps27Q8BK72 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mrps27Q8BK72 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mrps27Q8BK72 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mrps27Q8BK72 Mpp3-204ENSMUST00000107168 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mrps27Q8BK72 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mrps27Q8BK72 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mrps27Q8BK72 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mrps27Q8BK72 Tcf4-210ENSMUST00000128706 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mrps27Q8BK72 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mrps27Q8BK72 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mrps27Q8BK72 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mrps27Q8BK72 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mrps27Q8BK72 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mrps27Q8BK72 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mrps27Q8BK72 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mrps27Q8BK72 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mrps27Q8BK72 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mrps27Q8BK72 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mrps27Q8BK72 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mrps27Q8BK72 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mrps27Q8BK72 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mrps27Q8BK72 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mrps27Q8BK72 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mrps27Q8BK72 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms