Protein–RNA interactions for Protein: Q80ZU4

Smim19, Small integral membrane protein 19, mousemouse

Predictions only

Length 107 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim19Q80ZU4 Bcl7a-201ENSMUST00000031391 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Smim19Q80ZU4 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Smim19Q80ZU4 Kmt5b-205ENSMUST00000113972 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Smim19Q80ZU4 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Smim19Q80ZU4 Abcc5-202ENSMUST00000079158 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Smim19Q80ZU4 Inpp5e-205ENSMUST00000145701 4147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Smim19Q80ZU4 Armcx1-205ENSMUST00000113199 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Smim19Q80ZU4 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Smim19Q80ZU4 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Smim19Q80ZU4 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Smim19Q80ZU4 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Smim19Q80ZU4 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Smim19Q80ZU4 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Smim19Q80ZU4 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Smim19Q80ZU4 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Smim19Q80ZU4 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Smim19Q80ZU4 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Smim19Q80ZU4 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Smim19Q80ZU4 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Smim19Q80ZU4 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Smim19Q80ZU4 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Smim19Q80ZU4 Pitpnm3-201ENSMUST00000075258 6555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Smim19Q80ZU4 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Smim19Q80ZU4 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Smim19Q80ZU4 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Smim19Q80ZU4 St6gal1-201ENSMUST00000023601 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Smim19Q80ZU4 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Smim19Q80ZU4 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Smim19Q80ZU4 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Smim19Q80ZU4 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Smim19Q80ZU4 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Smim19Q80ZU4 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Smim19Q80ZU4 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Smim19Q80ZU4 Usp13-201ENSMUST00000072312 7580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Smim19Q80ZU4 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Smim19Q80ZU4 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Smim19Q80ZU4 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Smim19Q80ZU4 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Smim19Q80ZU4 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Smim19Q80ZU4 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Smim19Q80ZU4 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Smim19Q80ZU4 Elmsan1-201ENSMUST00000046266 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Smim19Q80ZU4 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Smim19Q80ZU4 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Smim19Q80ZU4 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Smim19Q80ZU4 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Smim19Q80ZU4 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Smim19Q80ZU4 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Smim19Q80ZU4 Unc13a-201ENSMUST00000030170 10255 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Smim19Q80ZU4 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Smim19Q80ZU4 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Smim19Q80ZU4 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Smim19Q80ZU4 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Smim19Q80ZU4 Acin1-221ENSMUST00000150371 2494 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Smim19Q80ZU4 Gm37269-201ENSMUST00000193906 1891 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Smim19Q80ZU4 Pkp1-201ENSMUST00000027667 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Smim19Q80ZU4 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Smim19Q80ZU4 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Smim19Q80ZU4 Wdr66-202ENSMUST00000121964 4873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Smim19Q80ZU4 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Smim19Q80ZU4 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Smim19Q80ZU4 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Smim19Q80ZU4 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Smim19Q80ZU4 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Smim19Q80ZU4 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Smim19Q80ZU4 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Smim19Q80ZU4 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Smim19Q80ZU4 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Smim19Q80ZU4 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Smim19Q80ZU4 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Smim19Q80ZU4 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Smim19Q80ZU4 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Smim19Q80ZU4 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Smim19Q80ZU4 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Smim19Q80ZU4 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Smim19Q80ZU4 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Smim19Q80ZU4 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Smim19Q80ZU4 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Smim19Q80ZU4 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Smim19Q80ZU4 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Smim19Q80ZU4 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Smim19Q80ZU4 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Smim19Q80ZU4 Tmem30c-202ENSMUST00000119407 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Smim19Q80ZU4 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Smim19Q80ZU4 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Smim19Q80ZU4 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Smim19Q80ZU4 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Smim19Q80ZU4 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Smim19Q80ZU4 C3-201ENSMUST00000024988 5136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Smim19Q80ZU4 Usp24-204ENSMUST00000165709 10594 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Smim19Q80ZU4 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Smim19Q80ZU4 Stard8-201ENSMUST00000036606 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Smim19Q80ZU4 Urgcp-202ENSMUST00000093362 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Smim19Q80ZU4 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Smim19Q80ZU4 Zfp354a-202ENSMUST00000102766 2592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Smim19Q80ZU4 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Smim19Q80ZU4 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Smim19Q80ZU4 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Smim19Q80ZU4 C130012C08Rik-201ENSMUST00000194287 3665 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Smim19Q80ZU4 Chd7-201ENSMUST00000039267 9444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms