Protein–RNA interactions for Protein: Q80WQ9

Zbed4, Zinc finger BED domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,168 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbed4Q80WQ9 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Zbed4Q80WQ9 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Zbed4Q80WQ9 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Zbed4Q80WQ9 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Zbed4Q80WQ9 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Zbed4Q80WQ9 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Zbed4Q80WQ9 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Zbed4Q80WQ9 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Zbed4Q80WQ9 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Zbed4Q80WQ9 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Zbed4Q80WQ9 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Zbed4Q80WQ9 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Zbed4Q80WQ9 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Zbed4Q80WQ9 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Zbed4Q80WQ9 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Zbed4Q80WQ9 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Zbed4Q80WQ9 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Zbed4Q80WQ9 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Zbed4Q80WQ9 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Zbed4Q80WQ9 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Zbed4Q80WQ9 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Zbed4Q80WQ9 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Zbed4Q80WQ9 Proscos-202ENSMUST00000178990 666 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Zbed4Q80WQ9 Gm27331-201ENSMUST00000183705 60 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Zbed4Q80WQ9 Gm6013-201ENSMUST00000212264 699 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Zbed4Q80WQ9 Gm29705-201ENSMUST00000212598 474 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Zbed4Q80WQ9 AC153845.2-201ENSMUST00000217535 673 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Zbed4Q80WQ9 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Zbed4Q80WQ9 Rrp36-201ENSMUST00000024766 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Zbed4Q80WQ9 Comt-201ENSMUST00000000335 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Zbed4Q80WQ9 Dnal4-202ENSMUST00000069877 1011 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Zbed4Q80WQ9 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Zbed4Q80WQ9 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Zbed4Q80WQ9 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Zbed4Q80WQ9 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Zbed4Q80WQ9 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Zbed4Q80WQ9 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Zbed4Q80WQ9 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Zbed4Q80WQ9 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Zbed4Q80WQ9 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Zbed4Q80WQ9 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Zbed4Q80WQ9 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Zbed4Q80WQ9 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Zbed4Q80WQ9 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Zbed4Q80WQ9 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Zbed4Q80WQ9 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Zbed4Q80WQ9 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Zbed4Q80WQ9 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Zbed4Q80WQ9 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Zbed4Q80WQ9 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Zbed4Q80WQ9 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Zbed4Q80WQ9 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Zbed4Q80WQ9 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Zbed4Q80WQ9 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Zbed4Q80WQ9 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Zbed4Q80WQ9 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Zbed4Q80WQ9 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Zbed4Q80WQ9 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Zbed4Q80WQ9 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Zbed4Q80WQ9 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Zbed4Q80WQ9 Rdh18-ps-201ENSMUST00000137395 944 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Zbed4Q80WQ9 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Zbed4Q80WQ9 Gm15444-201ENSMUST00000148335 388 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Zbed4Q80WQ9 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Zbed4Q80WQ9 1600014C10Rik-203ENSMUST00000177983 403 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Zbed4Q80WQ9 Gm26618-201ENSMUST00000181123 497 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Zbed4Q80WQ9 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Zbed4Q80WQ9 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Zbed4Q80WQ9 Gm18054-201ENSMUST00000207539 555 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Zbed4Q80WQ9 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Zbed4Q80WQ9 Mrto4-ps1-201ENSMUST00000220565 721 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Zbed4Q80WQ9 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Zbed4Q80WQ9 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Zbed4Q80WQ9 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Zbed4Q80WQ9 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Zbed4Q80WQ9 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Zbed4Q80WQ9 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Zbed4Q80WQ9 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Zbed4Q80WQ9 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Zbed4Q80WQ9 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Zbed4Q80WQ9 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Zbed4Q80WQ9 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Zbed4Q80WQ9 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Zbed4Q80WQ9 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Zbed4Q80WQ9 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Zbed4Q80WQ9 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Zbed4Q80WQ9 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Zbed4Q80WQ9 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Zbed4Q80WQ9 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Zbed4Q80WQ9 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Zbed4Q80WQ9 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Zbed4Q80WQ9 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Zbed4Q80WQ9 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Zbed4Q80WQ9 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Zbed4Q80WQ9 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Zbed4Q80WQ9 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Zbed4Q80WQ9 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Zbed4Q80WQ9 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Zbed4Q80WQ9 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Zbed4Q80WQ9 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.9 ms