Protein–RNA interactions for Protein: Q80W85

Npm2, Nucleoplasmin-2, mousemouse

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Length 207 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Npm2Q80W85 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Npm2Q80W85 Pnck-203ENSMUST00000114473 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Npm2Q80W85 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Npm2Q80W85 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Npm2Q80W85 Gm26540-201ENSMUST00000181858 1310 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Npm2Q80W85 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Npm2Q80W85 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Npm2Q80W85 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Npm2Q80W85 Gm11793-201ENSMUST00000120433 981 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Npm2Q80W85 Zdhhc4-208ENSMUST00000161915 1216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Npm2Q80W85 Gm20618-202ENSMUST00000177482 1227 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Npm2Q80W85 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Npm2Q80W85 5830462O15Rik-201ENSMUST00000214603 1655 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Npm2Q80W85 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Npm2Q80W85 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Npm2Q80W85 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Npm2Q80W85 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Npm2Q80W85 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Npm2Q80W85 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Npm2Q80W85 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Npm2Q80W85 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Npm2Q80W85 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Npm2Q80W85 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Npm2Q80W85 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Npm2Q80W85 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Npm2Q80W85 Fpr1-201ENSMUST00000061516 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Npm2Q80W85 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Npm2Q80W85 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Npm2Q80W85 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Npm2Q80W85 Gm27243-201ENSMUST00000183964 521 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Npm2Q80W85 Rad51d-202ENSMUST00000021033 1201 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Npm2Q80W85 Gm18935-201ENSMUST00000212692 664 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Npm2Q80W85 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Npm2Q80W85 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Npm2Q80W85 Tas2r137-201ENSMUST00000064932 1073 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Npm2Q80W85 Chchd1-201ENSMUST00000071215 616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Npm2Q80W85 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Npm2Q80W85 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Npm2Q80W85 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Npm2Q80W85 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Npm2Q80W85 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Npm2Q80W85 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Npm2Q80W85 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Npm2Q80W85 Psme2b-201ENSMUST00000104958 837 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Npm2Q80W85 Gm11569-201ENSMUST00000105057 869 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Npm2Q80W85 Gm13350-201ENSMUST00000120519 479 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Npm2Q80W85 1110006O24Rik-201ENSMUST00000201728 768 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Npm2Q80W85 AC159246.1-201ENSMUST00000214478 249 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Npm2Q80W85 Gm4935-201ENSMUST00000221316 1198 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Npm2Q80W85 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Npm2Q80W85 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Npm2Q80W85 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Npm2Q80W85 Gm14608-201ENSMUST00000120030 1553 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Npm2Q80W85 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Npm2Q80W85 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Npm2Q80W85 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Npm2Q80W85 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Npm2Q80W85 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Npm2Q80W85 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Npm2Q80W85 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Npm2Q80W85 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Npm2Q80W85 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Npm2Q80W85 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Npm2Q80W85 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Npm2Q80W85 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Npm2Q80W85 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Npm2Q80W85 0610037L13Rik-205ENSMUST00000119394 741 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Npm2Q80W85 4930524O07Rik-201ENSMUST00000161822 1050 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Npm2Q80W85 Psme1-202ENSMUST00000172738 681 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Npm2Q80W85 Myl6-205ENSMUST00000217969 608 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Npm2Q80W85 AC148335.1-201ENSMUST00000218778 818 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Npm2Q80W85 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Npm2Q80W85 Otud6a-201ENSMUST00000060241 873 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Npm2Q80W85 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Npm2Q80W85 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Npm2Q80W85 Bcs1l-203ENSMUST00000113733 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Npm2Q80W85 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Npm2Q80W85 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Npm2Q80W85 Ddo-203ENSMUST00000213503 1759 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Npm2Q80W85 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Npm2Q80W85 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Npm2Q80W85 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Npm2Q80W85 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Npm2Q80W85 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Npm2Q80W85 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Npm2Q80W85 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Npm2Q80W85 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Npm2Q80W85 Lrp1-202ENSMUST00000118455 2097 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Npm2Q80W85 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Npm2Q80W85 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Npm2Q80W85 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Npm2Q80W85 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Npm2Q80W85 Art3-206ENSMUST00000120416 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Npm2Q80W85 Psmd13-208ENSMUST00000163610 1382 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Npm2Q80W85 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Npm2Q80W85 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Npm2Q80W85 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Npm2Q80W85 Gm13342-201ENSMUST00000121055 207 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Npm2Q80W85 Gm12167-201ENSMUST00000148132 578 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Npm2Q80W85 Men1-210ENSMUST00000166909 295 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.8 ms