Protein–RNA interactions for Protein: Q80U87

Usp8, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 8, mousemouse

Predictions only

Length 1,080 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp8Q80U87 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Usp8Q80U87 Vps4b-201ENSMUST00000094646 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Usp8Q80U87 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Usp8Q80U87 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Usp8Q80U87 Plcb1-202ENSMUST00000110116 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Usp8Q80U87 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Usp8Q80U87 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Usp8Q80U87 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Usp8Q80U87 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Usp8Q80U87 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Usp8Q80U87 Irs4-201ENSMUST00000067841 6294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Usp8Q80U87 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Usp8Q80U87 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Usp8Q80U87 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Usp8Q80U87 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Usp8Q80U87 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Usp8Q80U87 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Usp8Q80U87 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Usp8Q80U87 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Usp8Q80U87 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Usp8Q80U87 Ttbk1-203ENSMUST00000225808 8926 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Usp8Q80U87 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Usp8Q80U87 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Usp8Q80U87 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Usp8Q80U87 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Usp8Q80U87 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Usp8Q80U87 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Usp8Q80U87 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Usp8Q80U87 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Usp8Q80U87 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Usp8Q80U87 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Usp8Q80U87 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Usp8Q80U87 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Usp8Q80U87 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Usp8Q80U87 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Usp8Q80U87 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Usp8Q80U87 Mcph1-201ENSMUST00000039412 4662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Usp8Q80U87 Brdt-201ENSMUST00000031215 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Usp8Q80U87 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Usp8Q80U87 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Usp8Q80U87 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Usp8Q80U87 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Usp8Q80U87 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Usp8Q80U87 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Usp8Q80U87 2410002F23Rik-203ENSMUST00000084937 2092 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Usp8Q80U87 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Usp8Q80U87 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Usp8Q80U87 Tln1-201ENSMUST00000030187 8393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Usp8Q80U87 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Usp8Q80U87 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Usp8Q80U87 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Usp8Q80U87 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Usp8Q80U87 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Usp8Q80U87 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Usp8Q80U87 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Usp8Q80U87 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Usp8Q80U87 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Usp8Q80U87 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Usp8Q80U87 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Usp8Q80U87 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Usp8Q80U87 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Usp8Q80U87 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Usp8Q80U87 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Usp8Q80U87 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Usp8Q80U87 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Usp8Q80U87 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Usp8Q80U87 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Usp8Q80U87 Mast4-207ENSMUST00000167058 10636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Usp8Q80U87 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Usp8Q80U87 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Usp8Q80U87 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Usp8Q80U87 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Usp8Q80U87 E230029C05Rik-205ENSMUST00000208362 2444 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Usp8Q80U87 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Usp8Q80U87 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Usp8Q80U87 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Usp8Q80U87 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Usp8Q80U87 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Usp8Q80U87 Dsp-201ENSMUST00000124830 9592 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Usp8Q80U87 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Usp8Q80U87 Wwtr1-201ENSMUST00000029380 4697 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Usp8Q80U87 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Usp8Q80U87 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Usp8Q80U87 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Usp8Q80U87 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Usp8Q80U87 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Usp8Q80U87 Tfb2m-201ENSMUST00000027769 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Usp8Q80U87 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Usp8Q80U87 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Usp8Q80U87 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Usp8Q80U87 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Usp8Q80U87 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Usp8Q80U87 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Usp8Q80U87 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Usp8Q80U87 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Usp8Q80U87 Rps6kb1-207ENSMUST00000154617 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Usp8Q80U87 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Usp8Q80U87 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Usp8Q80U87 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Usp8Q80U87 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms