Protein–RNA interactions for Protein: Q80TM9

Nisch, Nischarin, mousemouse

Predictions only

Length 1,593 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NischQ80TM9 AC125209.1-201ENSMUST00000225812 766 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
NischQ80TM9 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
NischQ80TM9 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
NischQ80TM9 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
NischQ80TM9 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
NischQ80TM9 Jhy-201ENSMUST00000034521 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
NischQ80TM9 Gm13293-201ENSMUST00000131188 1615 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
NischQ80TM9 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
NischQ80TM9 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
NischQ80TM9 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
NischQ80TM9 Cox6c-203ENSMUST00000153512 738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.97
NischQ80TM9 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
NischQ80TM9 Gm38304-201ENSMUST00000161826 600 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.97
NischQ80TM9 Gm9211-201ENSMUST00000182882 975 ntBASIC27.39■■□□□ 1.97
NischQ80TM9 Gm17812-201ENSMUST00000204935 318 ntBASIC27.39■■□□□ 1.97
NischQ80TM9 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
NischQ80TM9 Gm5369-201ENSMUST00000217499 588 ntBASIC27.39■■□□□ 1.97
NischQ80TM9 Rps12-203ENSMUST00000218107 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
NischQ80TM9 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
NischQ80TM9 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
NischQ80TM9 Gm43081-201ENSMUST00000199082 1380 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
NischQ80TM9 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
NischQ80TM9 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
NischQ80TM9 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
NischQ80TM9 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
NischQ80TM9 4930550C17Rik-201ENSMUST00000181629 1411 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
NischQ80TM9 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
NischQ80TM9 Hsd17b10-202ENSMUST00000112617 992 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
NischQ80TM9 1110038B12Rik-203ENSMUST00000173070 434 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
NischQ80TM9 D9Wsu149-201ENSMUST00000214169 594 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
NischQ80TM9 Hsd17b10-201ENSMUST00000026289 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
NischQ80TM9 Phpt1-201ENSMUST00000039156 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
NischQ80TM9 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
NischQ80TM9 Ripk3-201ENSMUST00000022830 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
NischQ80TM9 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
NischQ80TM9 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
NischQ80TM9 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
NischQ80TM9 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
NischQ80TM9 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
NischQ80TM9 CT010488.1-201ENSMUST00000214890 1522 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
NischQ80TM9 Gm9550-201ENSMUST00000161130 862 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
NischQ80TM9 Malat1-204ENSMUST00000173523 656 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
NischQ80TM9 1110002L01Rik-203ENSMUST00000179637 586 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
NischQ80TM9 Gm44545-201ENSMUST00000208262 746 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
NischQ80TM9 Gm45598-202ENSMUST00000210719 986 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
NischQ80TM9 4930447K03Rik-201ENSMUST00000222745 1033 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
NischQ80TM9 Esam-201ENSMUST00000002011 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
NischQ80TM9 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
NischQ80TM9 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
NischQ80TM9 Ywhaz-203ENSMUST00000110361 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
NischQ80TM9 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
NischQ80TM9 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
NischQ80TM9 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
NischQ80TM9 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
NischQ80TM9 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
NischQ80TM9 Dpm2-203ENSMUST00000140592 1412 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
NischQ80TM9 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
NischQ80TM9 AC122197.2-201ENSMUST00000219196 1635 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
NischQ80TM9 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
NischQ80TM9 Ins2-203ENSMUST00000105931 472 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
NischQ80TM9 3300002P13Rik-201ENSMUST00000204020 1092 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
NischQ80TM9 Gm10312-201ENSMUST00000078515 489 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
NischQ80TM9 Mir339-201ENSMUST00000083659 96 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
NischQ80TM9 Asic3-202ENSMUST00000196296 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
NischQ80TM9 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
NischQ80TM9 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
NischQ80TM9 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
NischQ80TM9 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
NischQ80TM9 Bnip3-203ENSMUST00000130500 719 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
NischQ80TM9 Dlx1as-202ENSMUST00000137251 647 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
NischQ80TM9 Fam168a-210ENSMUST00000216021 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
NischQ80TM9 Gm18730-201ENSMUST00000218038 343 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
NischQ80TM9 Spcs1-203ENSMUST00000226374 592 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
NischQ80TM9 Olfr959-201ENSMUST00000079178 1055 ntAPPRIS P1 BASIC27.35■■□□□ 1.97
NischQ80TM9 Chchd3-202ENSMUST00000115091 1363 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
NischQ80TM9 6030443J06Rik-202ENSMUST00000181374 1353 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
NischQ80TM9 H2-Ob-202ENSMUST00000167280 1878 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
NischQ80TM9 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
NischQ80TM9 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
NischQ80TM9 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
NischQ80TM9 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
NischQ80TM9 Mrpl50-201ENSMUST00000057829 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
NischQ80TM9 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
NischQ80TM9 Gm30725-201ENSMUST00000195170 1419 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
NischQ80TM9 Ighv5-4-201ENSMUST00000103444 425 ntAPPRIS P1 BASIC27.35■■□□□ 1.97
NischQ80TM9 Ighv1-52-201ENSMUST00000103522 348 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
NischQ80TM9 Gm16036-201ENSMUST00000150385 1112 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
NischQ80TM9 Crnde-207ENSMUST00000180102 732 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
NischQ80TM9 4930564D02Rik-201ENSMUST00000070584 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
NischQ80TM9 Ufc1-201ENSMUST00000080001 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
NischQ80TM9 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
NischQ80TM9 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
NischQ80TM9 Tom1-201ENSMUST00000078847 1769 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
NischQ80TM9 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
NischQ80TM9 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
NischQ80TM9 Fyn-206ENSMUST00000136659 1910 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
NischQ80TM9 Gm14051-201ENSMUST00000131603 377 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
NischQ80TM9 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
NischQ80TM9 Gm43584-201ENSMUST00000199762 605 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
NischQ80TM9 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
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