Protein–RNA interactions for Protein: Q7TS55

Tnfsf18, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 18, mousemouse

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Length 173 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf18Q7TS55 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Tnfsf18Q7TS55 Myo18a-205ENSMUST00000100794 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Tnfsf18Q7TS55 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Tnfsf18Q7TS55 Galntl6-208ENSMUST00000204128 5680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Tnfsf18Q7TS55 Sp4-201ENSMUST00000026367 5694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Tnfsf18Q7TS55 Wnt3-201ENSMUST00000000127 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Tnfsf18Q7TS55 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Tnfsf18Q7TS55 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Tnfsf18Q7TS55 Irf1-203ENSMUST00000108922 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Tnfsf18Q7TS55 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Tnfsf18Q7TS55 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Tnfsf18Q7TS55 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Tnfsf18Q7TS55 Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Tnfsf18Q7TS55 S1pr1-201ENSMUST00000055676 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Tnfsf18Q7TS55 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Tnfsf18Q7TS55 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Tnfsf18Q7TS55 Cep41-203ENSMUST00000115131 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Tnfsf18Q7TS55 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Tnfsf18Q7TS55 Gm26677-201ENSMUST00000180553 1672 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Tnfsf18Q7TS55 Incenp-201ENSMUST00000025562 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Tnfsf18Q7TS55 Synj2-202ENSMUST00000080283 4793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Tnfsf18Q7TS55 Itga4-201ENSMUST00000099972 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
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Tnfsf18Q7TS55 Zmynd8-203ENSMUST00000099084 5232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Tnfsf18Q7TS55 Pcdhga3-201ENSMUST00000073447 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
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Tnfsf18Q7TS55 Selenot-201ENSMUST00000107924 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Tnfsf18Q7TS55 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Tnfsf18Q7TS55 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
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Tnfsf18Q7TS55 Foxj3-202ENSMUST00000106310 4660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Tnfsf18Q7TS55 Wdr25-202ENSMUST00000167816 2657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
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Tnfsf18Q7TS55 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
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Tnfsf18Q7TS55 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Tnfsf18Q7TS55 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
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Tnfsf18Q7TS55 Grm1-202ENSMUST00000105560 4265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Tnfsf18Q7TS55 Wdr18-201ENSMUST00000045247 3911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
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Tnfsf18Q7TS55 Cdc7-203ENSMUST00000117196 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
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Tnfsf18Q7TS55 Pdzrn4-202ENSMUST00000169942 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Tnfsf18Q7TS55 Arhgap31-201ENSMUST00000023487 7964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Tnfsf18Q7TS55 Armc6-201ENSMUST00000019679 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
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Tnfsf18Q7TS55 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
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Tnfsf18Q7TS55 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Tnfsf18Q7TS55 Xpnpep1-209ENSMUST00000183108 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Tnfsf18Q7TS55 Pex5-204ENSMUST00000112531 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Tnfsf18Q7TS55 Cyb5rl-203ENSMUST00000106758 2516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Tnfsf18Q7TS55 Nudt8-201ENSMUST00000155405 3904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Tnfsf18Q7TS55 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Tnfsf18Q7TS55 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Tnfsf18Q7TS55 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Tnfsf18Q7TS55 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Tnfsf18Q7TS55 Armcx2-203ENSMUST00000119010 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Tnfsf18Q7TS55 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Tnfsf18Q7TS55 Olfm2-201ENSMUST00000034692 1836 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Tnfsf18Q7TS55 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Tnfsf18Q7TS55 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Tnfsf18Q7TS55 Ophn1-201ENSMUST00000033560 7170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Tnfsf18Q7TS55 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Tnfsf18Q7TS55 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Tnfsf18Q7TS55 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Tnfsf18Q7TS55 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Tnfsf18Q7TS55 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Tnfsf18Q7TS55 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Tnfsf18Q7TS55 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Tnfsf18Q7TS55 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Tnfsf18Q7TS55 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Tnfsf18Q7TS55 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Tnfsf18Q7TS55 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Tnfsf18Q7TS55 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Tnfsf18Q7TS55 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Tnfsf18Q7TS55 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Tnfsf18Q7TS55 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Tnfsf18Q7TS55 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
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