Protein–RNA interactions for Protein: Q78IS1

Tmed3, Transmembrane emp24 domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed3Q78IS1 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Tmed3Q78IS1 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Tmed3Q78IS1 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Tmed3Q78IS1 Sel1l-210ENSMUST00000178462 6150 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Tmed3Q78IS1 Entpd8-203ENSMUST00000114380 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Tmed3Q78IS1 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Tmed3Q78IS1 Uap1l1-201ENSMUST00000102925 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Tmed3Q78IS1 Vsx2-201ENSMUST00000021665 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Tmed3Q78IS1 Xkr5-201ENSMUST00000055503 3176 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Tmed3Q78IS1 Frmd4a-202ENSMUST00000091497 6208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Tmed3Q78IS1 Cdk7-201ENSMUST00000091299 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Tmed3Q78IS1 Ippk-201ENSMUST00000021817 2856 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Tmed3Q78IS1 Pcdhgb6-201ENSMUST00000003599 4684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Tmed3Q78IS1 Zfp41-201ENSMUST00000054555 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Tmed3Q78IS1 Ptpn11-201ENSMUST00000054547 5535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Tmed3Q78IS1 Pou2f1-209ENSMUST00000160908 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Tmed3Q78IS1 Umod-206ENSMUST00000209095 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Tmed3Q78IS1 Cog7-203ENSMUST00000205438 3355 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Tmed3Q78IS1 Pitpnm2-201ENSMUST00000086123 6620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Tmed3Q78IS1 Gm13093-201ENSMUST00000126212 2485 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Tmed3Q78IS1 Cic-212ENSMUST00000169266 8221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Tmed3Q78IS1 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Tmed3Q78IS1 Prex1-203ENSMUST00000109246 2386 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Tmed3Q78IS1 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Tmed3Q78IS1 St6galnac6-202ENSMUST00000081879 2345 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Tmed3Q78IS1 Bicra-204ENSMUST00000210781 5975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Tmed3Q78IS1 B4galnt3-203ENSMUST00000212457 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Tmed3Q78IS1 Als2cl-206ENSMUST00000155014 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Tmed3Q78IS1 Gja5-203ENSMUST00000199597 3668 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Tmed3Q78IS1 Nsd3-206ENSMUST00000142395 10105 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Tmed3Q78IS1 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Tmed3Q78IS1 Arhgap20os-204ENSMUST00000152203 2113 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Tmed3Q78IS1 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Tmed3Q78IS1 Sec14l1-202ENSMUST00000090433 4654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Tmed3Q78IS1 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Tmed3Q78IS1 Slc35f6-205ENSMUST00000196740 1972 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Tmed3Q78IS1 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Tmed3Q78IS1 Plekhn1-203ENSMUST00000217885 1982 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Tmed3Q78IS1 Poldip3-201ENSMUST00000058793 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Tmed3Q78IS1 Chrd-201ENSMUST00000007171 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Tmed3Q78IS1 Tspyl4-201ENSMUST00000047935 3879 ntAPPRIS P1 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Tmed3Q78IS1 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Tmed3Q78IS1 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Tmed3Q78IS1 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Tmed3Q78IS1 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Tmed3Q78IS1 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Tmed3Q78IS1 Anxa8-201ENSMUST00000022519 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Tmed3Q78IS1 5031434O11Rik-201ENSMUST00000180404 3731 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Tmed3Q78IS1 Ccdc154-203ENSMUST00000182621 2402 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Tmed3Q78IS1 Mob3b-201ENSMUST00000102975 6030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Tmed3Q78IS1 Zbtb49-201ENSMUST00000094833 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Tmed3Q78IS1 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Tmed3Q78IS1 Ntng1-211ENSMUST00000156177 4652 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Tmed3Q78IS1 Vmn2r-ps25-201ENSMUST00000202322 2321 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Tmed3Q78IS1 Gm33543-203ENSMUST00000211096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Tmed3Q78IS1 Tbcd-201ENSMUST00000103013 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Tmed3Q78IS1 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Tmed3Q78IS1 Asph-207ENSMUST00000108333 2652 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Tmed3Q78IS1 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Tmed3Q78IS1 Gm5124-202ENSMUST00000132683 2083 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Tmed3Q78IS1 Rgma-202ENSMUST00000119206 3481 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Tmed3Q78IS1 Sfxn3-201ENSMUST00000062213 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Tmed3Q78IS1 Ptpn4-201ENSMUST00000064091 10874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Tmed3Q78IS1 Comt-204ENSMUST00000165430 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Tmed3Q78IS1 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Tmed3Q78IS1 Mkl1-209ENSMUST00000149582 4366 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Tmed3Q78IS1 Gm43174-201ENSMUST00000195914 2445 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Tmed3Q78IS1 Axl-202ENSMUST00000085948 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Tmed3Q78IS1 Chst4-201ENSMUST00000109222 1942 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Tmed3Q78IS1 Gm10432-202ENSMUST00000223300 4791 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Tmed3Q78IS1 Qrich1-201ENSMUST00000006851 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Tmed3Q78IS1 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Tmed3Q78IS1 Tor1aip1-202ENSMUST00000097527 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Tmed3Q78IS1 Pi16-202ENSMUST00000114701 2756 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Tmed3Q78IS1 Lsamp-208ENSMUST00000189358 2766 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Tmed3Q78IS1 Mcm9-204ENSMUST00000219838 4132 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Tmed3Q78IS1 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Tmed3Q78IS1 Pfkfb3-220ENSMUST00000192949 4801 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Tmed3Q78IS1 Trim9-209ENSMUST00000222316 3049 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Tmed3Q78IS1 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Tmed3Q78IS1 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Tmed3Q78IS1 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Tmed3Q78IS1 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Tmed3Q78IS1 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Tmed3Q78IS1 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Tmed3Q78IS1 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Tmed3Q78IS1 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Tmed3Q78IS1 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Tmed3Q78IS1 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Tmed3Q78IS1 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Tmed3Q78IS1 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Tmed3Q78IS1 Gm16083-201ENSMUST00000125681 2547 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Tmed3Q78IS1 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Tmed3Q78IS1 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Tmed3Q78IS1 Rassf4-201ENSMUST00000035842 6460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Tmed3Q78IS1 Paip2b-201ENSMUST00000058383 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Tmed3Q78IS1 Erich5-201ENSMUST00000060894 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Tmed3Q78IS1 Otop1-201ENSMUST00000063136 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Tmed3Q78IS1 Clpb-201ENSMUST00000001884 4627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Tmed3Q78IS1 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.3 ms