Protein–RNA interactions for Protein: Q715T0

Nme8, Thioredoxin domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 586 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nme8Q715T0 Cenpm-202ENSMUST00000089157 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nme8Q715T0 Sdf4-202ENSMUST00000097734 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nme8Q715T0 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nme8Q715T0 Lrp1-202ENSMUST00000118455 2097 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nme8Q715T0 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nme8Q715T0 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nme8Q715T0 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nme8Q715T0 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nme8Q715T0 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nme8Q715T0 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nme8Q715T0 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nme8Q715T0 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nme8Q715T0 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nme8Q715T0 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nme8Q715T0 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nme8Q715T0 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nme8Q715T0 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nme8Q715T0 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nme8Q715T0 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nme8Q715T0 Glrx2-202ENSMUST00000111957 580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nme8Q715T0 Gm12742-201ENSMUST00000117326 410 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Nme8Q715T0 Cdk4-202ENSMUST00000120226 714 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nme8Q715T0 Gm11751-201ENSMUST00000126187 460 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nme8Q715T0 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nme8Q715T0 Gm16315-201ENSMUST00000163009 783 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nme8Q715T0 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nme8Q715T0 C87198-201ENSMUST00000173553 1045 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nme8Q715T0 Gm8565-201ENSMUST00000183259 1014 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Nme8Q715T0 Gm36198-201ENSMUST00000217490 416 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nme8Q715T0 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nme8Q715T0 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nme8Q715T0 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nme8Q715T0 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nme8Q715T0 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nme8Q715T0 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nme8Q715T0 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Nme8Q715T0 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nme8Q715T0 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nme8Q715T0 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nme8Q715T0 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nme8Q715T0 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nme8Q715T0 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nme8Q715T0 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nme8Q715T0 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nme8Q715T0 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nme8Q715T0 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nme8Q715T0 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nme8Q715T0 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nme8Q715T0 Gm43630-201ENSMUST00000201550 776 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Nme8Q715T0 AC134254.1-201ENSMUST00000221362 167 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Nme8Q715T0 Gm34466-201ENSMUST00000222218 505 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nme8Q715T0 AC125350.2-201ENSMUST00000224737 727 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Nme8Q715T0 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nme8Q715T0 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nme8Q715T0 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nme8Q715T0 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nme8Q715T0 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nme8Q715T0 Gm9955-201ENSMUST00000067987 309 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nme8Q715T0 Snora73a-201ENSMUST00000082453 205 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Nme8Q715T0 Gm10268-201ENSMUST00000085340 555 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Nme8Q715T0 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nme8Q715T0 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nme8Q715T0 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nme8Q715T0 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nme8Q715T0 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nme8Q715T0 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nme8Q715T0 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nme8Q715T0 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nme8Q715T0 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nme8Q715T0 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Nme8Q715T0 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nme8Q715T0 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nme8Q715T0 Vax2os-201ENSMUST00000123402 1435 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nme8Q715T0 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nme8Q715T0 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nme8Q715T0 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nme8Q715T0 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Nme8Q715T0 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Nme8Q715T0 Ddo-203ENSMUST00000213503 1759 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nme8Q715T0 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nme8Q715T0 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nme8Q715T0 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nme8Q715T0 Drap1-209ENSMUST00000136579 734 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nme8Q715T0 Gm14285-201ENSMUST00000146049 380 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nme8Q715T0 Gm16282-201ENSMUST00000162641 451 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nme8Q715T0 Gm28693-202ENSMUST00000190758 331 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Nme8Q715T0 Lsmem2-201ENSMUST00000191791 369 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nme8Q715T0 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nme8Q715T0 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nme8Q715T0 Olfr983-201ENSMUST00000050996 1050 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nme8Q715T0 Gm9899-201ENSMUST00000065519 555 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Nme8Q715T0 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nme8Q715T0 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nme8Q715T0 Gm5620-201ENSMUST00000077991 1348 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Nme8Q715T0 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nme8Q715T0 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nme8Q715T0 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nme8Q715T0 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nme8Q715T0 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nme8Q715T0 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.1 ms