Protein–RNA interactions for Protein: Q6PIP5

Nudcd1, NudC domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 582 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nudcd1Q6PIP5 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nudcd1Q6PIP5 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nudcd1Q6PIP5 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nudcd1Q6PIP5 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nudcd1Q6PIP5 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nudcd1Q6PIP5 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nudcd1Q6PIP5 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nudcd1Q6PIP5 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nudcd1Q6PIP5 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nudcd1Q6PIP5 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nudcd1Q6PIP5 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nudcd1Q6PIP5 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nudcd1Q6PIP5 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nudcd1Q6PIP5 Gm8213-201ENSMUST00000118191 441 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Nudcd1Q6PIP5 Egfl7-208ENSMUST00000149789 683 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nudcd1Q6PIP5 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Nudcd1Q6PIP5 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Nudcd1Q6PIP5 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nudcd1Q6PIP5 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nudcd1Q6PIP5 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nudcd1Q6PIP5 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Nudcd1Q6PIP5 Gm42442-201ENSMUST00000197951 1133 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Nudcd1Q6PIP5 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nudcd1Q6PIP5 Gm42303-201ENSMUST00000209960 1170 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nudcd1Q6PIP5 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nudcd1Q6PIP5 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nudcd1Q6PIP5 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nudcd1Q6PIP5 Gm6091-201ENSMUST00000098307 165 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Nudcd1Q6PIP5 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nudcd1Q6PIP5 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nudcd1Q6PIP5 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nudcd1Q6PIP5 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nudcd1Q6PIP5 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nudcd1Q6PIP5 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nudcd1Q6PIP5 Emd-202ENSMUST00000088313 1338 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nudcd1Q6PIP5 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nudcd1Q6PIP5 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nudcd1Q6PIP5 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nudcd1Q6PIP5 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nudcd1Q6PIP5 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nudcd1Q6PIP5 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nudcd1Q6PIP5 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nudcd1Q6PIP5 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nudcd1Q6PIP5 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nudcd1Q6PIP5 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nudcd1Q6PIP5 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nudcd1Q6PIP5 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nudcd1Q6PIP5 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nudcd1Q6PIP5 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nudcd1Q6PIP5 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nudcd1Q6PIP5 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nudcd1Q6PIP5 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nudcd1Q6PIP5 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nudcd1Q6PIP5 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nudcd1Q6PIP5 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nudcd1Q6PIP5 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nudcd1Q6PIP5 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nudcd1Q6PIP5 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Nudcd1Q6PIP5 Gm16136-203ENSMUST00000162520 1121 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nudcd1Q6PIP5 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nudcd1Q6PIP5 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Nudcd1Q6PIP5 2610306M01Rik-201ENSMUST00000185414 1042 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Nudcd1Q6PIP5 Gm29649-201ENSMUST00000185649 419 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Nudcd1Q6PIP5 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nudcd1Q6PIP5 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nudcd1Q6PIP5 Gm8598-201ENSMUST00000221184 836 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Nudcd1Q6PIP5 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nudcd1Q6PIP5 Gm9899-201ENSMUST00000065519 555 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Nudcd1Q6PIP5 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nudcd1Q6PIP5 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nudcd1Q6PIP5 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nudcd1Q6PIP5 Mdga2-201ENSMUST00000037181 9833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nudcd1Q6PIP5 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nudcd1Q6PIP5 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nudcd1Q6PIP5 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nudcd1Q6PIP5 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nudcd1Q6PIP5 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nudcd1Q6PIP5 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nudcd1Q6PIP5 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nudcd1Q6PIP5 Gm9200-201ENSMUST00000118513 1354 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Nudcd1Q6PIP5 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nudcd1Q6PIP5 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nudcd1Q6PIP5 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nudcd1Q6PIP5 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nudcd1Q6PIP5 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nudcd1Q6PIP5 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nudcd1Q6PIP5 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nudcd1Q6PIP5 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nudcd1Q6PIP5 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nudcd1Q6PIP5 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nudcd1Q6PIP5 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nudcd1Q6PIP5 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nudcd1Q6PIP5 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nudcd1Q6PIP5 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Nudcd1Q6PIP5 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nudcd1Q6PIP5 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nudcd1Q6PIP5 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nudcd1Q6PIP5 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nudcd1Q6PIP5 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nudcd1Q6PIP5 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms