Protein–RNA interactions for Protein: Q6IFX4

Krt39, Keratin, type I cytoskeletal 39, mousemouse

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Length 482 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt39Q6IFX4 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Krt39Q6IFX4 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Krt39Q6IFX4 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Krt39Q6IFX4 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Krt39Q6IFX4 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Krt39Q6IFX4 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Krt39Q6IFX4 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
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Krt39Q6IFX4 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Krt39Q6IFX4 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Krt39Q6IFX4 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Krt39Q6IFX4 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Krt39Q6IFX4 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Krt39Q6IFX4 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Krt39Q6IFX4 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Krt39Q6IFX4 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Krt39Q6IFX4 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Krt39Q6IFX4 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Krt39Q6IFX4 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Krt39Q6IFX4 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Krt39Q6IFX4 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Krt39Q6IFX4 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Krt39Q6IFX4 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Krt39Q6IFX4 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Krt39Q6IFX4 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Krt39Q6IFX4 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Krt39Q6IFX4 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Krt39Q6IFX4 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Krt39Q6IFX4 Glis2-201ENSMUST00000014447 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Krt39Q6IFX4 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Krt39Q6IFX4 Llgl2-201ENSMUST00000103032 3551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Krt39Q6IFX4 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Krt39Q6IFX4 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Krt39Q6IFX4 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Krt39Q6IFX4 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Krt39Q6IFX4 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Krt39Q6IFX4 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Krt39Q6IFX4 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Krt39Q6IFX4 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Krt39Q6IFX4 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Krt39Q6IFX4 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Krt39Q6IFX4 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Krt39Q6IFX4 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Krt39Q6IFX4 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Krt39Q6IFX4 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Krt39Q6IFX4 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Krt39Q6IFX4 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Krt39Q6IFX4 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Krt39Q6IFX4 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Krt39Q6IFX4 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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Krt39Q6IFX4 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Krt39Q6IFX4 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Krt39Q6IFX4 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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Krt39Q6IFX4 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Krt39Q6IFX4 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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Krt39Q6IFX4 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Krt39Q6IFX4 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Krt39Q6IFX4 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Krt39Q6IFX4 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Krt39Q6IFX4 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
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Krt39Q6IFX4 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Krt39Q6IFX4 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Krt39Q6IFX4 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Krt39Q6IFX4 Afap1l1-201ENSMUST00000120472 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Krt39Q6IFX4 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Krt39Q6IFX4 C130026L21Rik-201ENSMUST00000064930 2472 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Krt39Q6IFX4 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Krt39Q6IFX4 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Krt39Q6IFX4 Gm15459-201ENSMUST00000117405 1941 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Krt39Q6IFX4 Gm8355-201ENSMUST00000177767 1941 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Krt39Q6IFX4 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Krt39Q6IFX4 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Krt39Q6IFX4 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Krt39Q6IFX4 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Krt39Q6IFX4 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Krt39Q6IFX4 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Krt39Q6IFX4 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Krt39Q6IFX4 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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