Protein–RNA interactions for Protein: Q68FG2

Sptbn2, Spectrin beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 2,388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sptbn2Q68FG2 4930578M07Rik-202ENSMUST00000212946 552 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Sptbn2Q68FG2 Gm36264-202ENSMUST00000221989 1142 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Sptbn2Q68FG2 Treml1-205ENSMUST00000225849 974 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Sptbn2Q68FG2 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Sptbn2Q68FG2 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Sptbn2Q68FG2 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Sptbn2Q68FG2 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Sptbn2Q68FG2 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Sptbn2Q68FG2 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Sptbn2Q68FG2 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Sptbn2Q68FG2 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Sptbn2Q68FG2 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Sptbn2Q68FG2 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Sptbn2Q68FG2 Unc13a-201ENSMUST00000030170 10255 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Sptbn2Q68FG2 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Sptbn2Q68FG2 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Sptbn2Q68FG2 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Sptbn2Q68FG2 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Sptbn2Q68FG2 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Sptbn2Q68FG2 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Sptbn2Q68FG2 2410131K14Rik-201ENSMUST00000049138 5649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Sptbn2Q68FG2 Lexm-204ENSMUST00000189032 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Sptbn2Q68FG2 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Sptbn2Q68FG2 Rhbdd2-201ENSMUST00000043707 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Sptbn2Q68FG2 Ivns1abp-201ENSMUST00000023918 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Sptbn2Q68FG2 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Sptbn2Q68FG2 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Sptbn2Q68FG2 Gm12012-201ENSMUST00000118857 1066 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Sptbn2Q68FG2 3300002P13Rik-201ENSMUST00000204020 1092 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Sptbn2Q68FG2 Rpl18a-201ENSMUST00000054220 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Sptbn2Q68FG2 Olfr1346-201ENSMUST00000056144 1051 ntAPPRIS P1 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Sptbn2Q68FG2 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Sptbn2Q68FG2 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Sptbn2Q68FG2 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Sptbn2Q68FG2 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Sptbn2Q68FG2 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Sptbn2Q68FG2 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Sptbn2Q68FG2 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Sptbn2Q68FG2 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Sptbn2Q68FG2 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Sptbn2Q68FG2 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Sptbn2Q68FG2 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Sptbn2Q68FG2 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Sptbn2Q68FG2 Tspan32-203ENSMUST00000082008 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Sptbn2Q68FG2 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Sptbn2Q68FG2 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Sptbn2Q68FG2 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Sptbn2Q68FG2 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Sptbn2Q68FG2 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Sptbn2Q68FG2 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Sptbn2Q68FG2 Gm14208-201ENSMUST00000119645 678 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Sptbn2Q68FG2 Rbm3-ps-201ENSMUST00000121422 465 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Sptbn2Q68FG2 Cabp2-201ENSMUST00000159148 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Sptbn2Q68FG2 Gm8194-201ENSMUST00000159783 859 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Sptbn2Q68FG2 2010320O07Rik-201ENSMUST00000160935 525 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Sptbn2Q68FG2 Tepp-204ENSMUST00000161029 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Sptbn2Q68FG2 Gng2-205ENSMUST00000161247 419 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Sptbn2Q68FG2 Rps13-201ENSMUST00000170953 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Sptbn2Q68FG2 1700065D16Rik-203ENSMUST00000189279 393 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Sptbn2Q68FG2 Hax1-206ENSMUST00000197786 857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Sptbn2Q68FG2 Gm44100-201ENSMUST00000204329 436 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Sptbn2Q68FG2 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Sptbn2Q68FG2 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Sptbn2Q68FG2 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Sptbn2Q68FG2 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Sptbn2Q68FG2 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Sptbn2Q68FG2 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Sptbn2Q68FG2 Plch2-206ENSMUST00000135665 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Sptbn2Q68FG2 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Sptbn2Q68FG2 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Sptbn2Q68FG2 Rgma-202ENSMUST00000119206 3481 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Sptbn2Q68FG2 Ncmap-202ENSMUST00000105857 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Sptbn2Q68FG2 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Sptbn2Q68FG2 Psme1-202ENSMUST00000172738 681 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Sptbn2Q68FG2 Gm28379-201ENSMUST00000186450 554 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Sptbn2Q68FG2 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Sptbn2Q68FG2 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Sptbn2Q68FG2 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Sptbn2Q68FG2 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Sptbn2Q68FG2 Gm9279-201ENSMUST00000223175 1606 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Sptbn2Q68FG2 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Sptbn2Q68FG2 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Sptbn2Q68FG2 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Sptbn2Q68FG2 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Sptbn2Q68FG2 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Sptbn2Q68FG2 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Sptbn2Q68FG2 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Sptbn2Q68FG2 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Sptbn2Q68FG2 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Sptbn2Q68FG2 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Sptbn2Q68FG2 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Sptbn2Q68FG2 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Sptbn2Q68FG2 Gm11596-201ENSMUST00000105058 1079 ntAPPRIS P1 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Sptbn2Q68FG2 Rbm3-204ENSMUST00000115617 1152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Sptbn2Q68FG2 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Sptbn2Q68FG2 Gm11597-201ENSMUST00000121423 964 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Sptbn2Q68FG2 Gm11675-201ENSMUST00000121873 832 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Sptbn2Q68FG2 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Sptbn2Q68FG2 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Sptbn2Q68FG2 Crb3-205ENSMUST00000169543 778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 93.8 ms