Protein–RNA interactions for Protein: Q689Z5

Sbno1, Protein strawberry notch homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,390 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sbno1Q689Z5 Dlx5-202ENSMUST00000142635 1324 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sbno1Q689Z5 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sbno1Q689Z5 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sbno1Q689Z5 Camk2b-206ENSMUST00000101585 1650 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sbno1Q689Z5 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sbno1Q689Z5 Pole3-201ENSMUST00000030091 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sbno1Q689Z5 Cant1-206ENSMUST00000164927 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sbno1Q689Z5 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sbno1Q689Z5 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sbno1Q689Z5 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sbno1Q689Z5 Rhox7-ps1-201ENSMUST00000117595 806 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Sbno1Q689Z5 2310057J18Rik-201ENSMUST00000015663 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sbno1Q689Z5 Gm16379-201ENSMUST00000161469 348 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Sbno1Q689Z5 Rn7s1-201ENSMUST00000174924 300 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Sbno1Q689Z5 Rn7s2-201ENSMUST00000175032 300 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Sbno1Q689Z5 Gm26461-201ENSMUST00000175064 290 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Sbno1Q689Z5 Gm8762-201ENSMUST00000193486 339 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Sbno1Q689Z5 Sox2ot-205ENSMUST00000196795 754 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sbno1Q689Z5 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sbno1Q689Z5 Gm32850-202ENSMUST00000209149 732 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sbno1Q689Z5 Cldnd2-201ENSMUST00000040227 664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sbno1Q689Z5 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sbno1Q689Z5 Akp-ps1-201ENSMUST00000188050 1600 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Sbno1Q689Z5 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sbno1Q689Z5 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sbno1Q689Z5 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sbno1Q689Z5 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Sbno1Q689Z5 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sbno1Q689Z5 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sbno1Q689Z5 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sbno1Q689Z5 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sbno1Q689Z5 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sbno1Q689Z5 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sbno1Q689Z5 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sbno1Q689Z5 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sbno1Q689Z5 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sbno1Q689Z5 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sbno1Q689Z5 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sbno1Q689Z5 Gng7-205ENSMUST00000118465 875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sbno1Q689Z5 Cdkn1a-202ENSMUST00000119901 748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sbno1Q689Z5 Gm12167-201ENSMUST00000148132 578 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sbno1Q689Z5 Cdk3-ps-202ENSMUST00000174177 915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
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Sbno1Q689Z5 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sbno1Q689Z5 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sbno1Q689Z5 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
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Sbno1Q689Z5 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sbno1Q689Z5 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sbno1Q689Z5 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sbno1Q689Z5 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sbno1Q689Z5 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sbno1Q689Z5 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sbno1Q689Z5 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
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Sbno1Q689Z5 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sbno1Q689Z5 Tnfrsf4-201ENSMUST00000030952 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sbno1Q689Z5 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sbno1Q689Z5 Olfr1346-201ENSMUST00000056144 1051 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sbno1Q689Z5 A430005L14Rik-201ENSMUST00000058393 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sbno1Q689Z5 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sbno1Q689Z5 Gemin2-201ENSMUST00000021379 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sbno1Q689Z5 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sbno1Q689Z5 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sbno1Q689Z5 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sbno1Q689Z5 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sbno1Q689Z5 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sbno1Q689Z5 Pnck-203ENSMUST00000114473 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
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Sbno1Q689Z5 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sbno1Q689Z5 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sbno1Q689Z5 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sbno1Q689Z5 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sbno1Q689Z5 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sbno1Q689Z5 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sbno1Q689Z5 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sbno1Q689Z5 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sbno1Q689Z5 Gm6023-201ENSMUST00000118217 606 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Sbno1Q689Z5 Sumo3-206ENSMUST00000141228 772 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sbno1Q689Z5 Ighv1-62-201ENSMUST00000193406 350 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Sbno1Q689Z5 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Sbno1Q689Z5 Gm7619-201ENSMUST00000210649 1282 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Sbno1Q689Z5 Scoc-203ENSMUST00000212031 409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sbno1Q689Z5 Gm33056-201ENSMUST00000213234 1120 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sbno1Q689Z5 Olfr983-201ENSMUST00000050996 1050 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sbno1Q689Z5 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sbno1Q689Z5 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sbno1Q689Z5 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sbno1Q689Z5 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sbno1Q689Z5 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sbno1Q689Z5 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sbno1Q689Z5 Ascc1-202ENSMUST00000164083 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sbno1Q689Z5 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sbno1Q689Z5 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sbno1Q689Z5 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sbno1Q689Z5 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms