Protein–RNA interactions for Protein: Q62241

Snrpc, U1 small nuclear ribonucleoprotein C, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SnrpcQ62241 Grhl2-201ENSMUST00000022895 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
SnrpcQ62241 Plcg1-203ENSMUST00000109462 5107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
SnrpcQ62241 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
SnrpcQ62241 Ttbk2-202ENSMUST00000057135 11066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
SnrpcQ62241 Zfp398-201ENSMUST00000079881 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
SnrpcQ62241 Pdp1-203ENSMUST00000108297 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
SnrpcQ62241 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
SnrpcQ62241 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
SnrpcQ62241 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.73
SnrpcQ62241 Fut8-201ENSMUST00000062804 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
SnrpcQ62241 Cbx7-201ENSMUST00000089293 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
SnrpcQ62241 Kcnd1-201ENSMUST00000009875 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
SnrpcQ62241 Gm37513-201ENSMUST00000194830 2268 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
SnrpcQ62241 Gm38378-201ENSMUST00000195153 2268 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
SnrpcQ62241 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
SnrpcQ62241 Arhgef16-207ENSMUST00000169623 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
SnrpcQ62241 Nrg1-201ENSMUST00000073884 2452 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
SnrpcQ62241 Gm10548-201ENSMUST00000097631 2629 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
SnrpcQ62241 Synj2-202ENSMUST00000080283 4793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
SnrpcQ62241 Podn-201ENSMUST00000044248 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
SnrpcQ62241 Unk-202ENSMUST00000106452 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
SnrpcQ62241 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.73
SnrpcQ62241 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
SnrpcQ62241 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
SnrpcQ62241 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
SnrpcQ62241 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
SnrpcQ62241 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
SnrpcQ62241 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
SnrpcQ62241 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
SnrpcQ62241 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
SnrpcQ62241 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
SnrpcQ62241 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
SnrpcQ62241 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
SnrpcQ62241 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
SnrpcQ62241 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
SnrpcQ62241 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
SnrpcQ62241 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
SnrpcQ62241 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
SnrpcQ62241 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
SnrpcQ62241 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.74
SnrpcQ62241 Cramp1l-201ENSMUST00000073337 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
SnrpcQ62241 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
SnrpcQ62241 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
SnrpcQ62241 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
SnrpcQ62241 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
SnrpcQ62241 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
SnrpcQ62241 Cyth3-201ENSMUST00000110727 2068 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
SnrpcQ62241 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
SnrpcQ62241 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
SnrpcQ62241 Mfsd9-201ENSMUST00000039672 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
SnrpcQ62241 Stox2-209ENSMUST00000211882 9696 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
SnrpcQ62241 Arl14ep-201ENSMUST00000028536 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
SnrpcQ62241 Dner-201ENSMUST00000049126 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
SnrpcQ62241 Mcm9-204ENSMUST00000219838 4132 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
SnrpcQ62241 Col14a1-201ENSMUST00000023053 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
SnrpcQ62241 Dlc1-201ENSMUST00000033923 6159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
SnrpcQ62241 Ccdc85a-202ENSMUST00000093253 5431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
SnrpcQ62241 Slc16a12-201ENSMUST00000009522 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
SnrpcQ62241 Spata2-201ENSMUST00000057627 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
SnrpcQ62241 5031434O11Rik-201ENSMUST00000180404 3731 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
SnrpcQ62241 2410002F23Rik-205ENSMUST00000107949 3610 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
SnrpcQ62241 Afap1l1-201ENSMUST00000120472 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
SnrpcQ62241 Cdc7-203ENSMUST00000117196 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
SnrpcQ62241 Palm-204ENSMUST00000218631 2725 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
SnrpcQ62241 Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
SnrpcQ62241 Adamts5-201ENSMUST00000023611 8091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
SnrpcQ62241 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
SnrpcQ62241 Gm10419-202ENSMUST00000196693 2530 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
SnrpcQ62241 Ctnnbl1-201ENSMUST00000029178 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
SnrpcQ62241 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
SnrpcQ62241 Rnf17-202ENSMUST00000223627 2077 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
SnrpcQ62241 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
SnrpcQ62241 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
SnrpcQ62241 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
SnrpcQ62241 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
SnrpcQ62241 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
SnrpcQ62241 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
SnrpcQ62241 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
SnrpcQ62241 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
SnrpcQ62241 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
SnrpcQ62241 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
SnrpcQ62241 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
SnrpcQ62241 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
SnrpcQ62241 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
SnrpcQ62241 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
SnrpcQ62241 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
SnrpcQ62241 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
SnrpcQ62241 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
SnrpcQ62241 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
SnrpcQ62241 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
SnrpcQ62241 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
SnrpcQ62241 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
SnrpcQ62241 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
SnrpcQ62241 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
SnrpcQ62241 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
SnrpcQ62241 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
SnrpcQ62241 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
SnrpcQ62241 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
SnrpcQ62241 B930036N10Rik-202ENSMUST00000181170 3544 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
SnrpcQ62241 Fli1-201ENSMUST00000016231 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68 ms