Protein–RNA interactions for Protein: Q61345

Foxd1, Forkhead box protein D1, mousemouse

Predictions only

Length 456 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxd1Q61345 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Foxd1Q61345 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Foxd1Q61345 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Foxd1Q61345 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Foxd1Q61345 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Foxd1Q61345 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Foxd1Q61345 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Foxd1Q61345 Gltp-202ENSMUST00000112212 799 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Foxd1Q61345 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Foxd1Q61345 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Foxd1Q61345 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Foxd1Q61345 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Foxd1Q61345 Gm5869-201ENSMUST00000200248 1257 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Foxd1Q61345 Gm10308-201ENSMUST00000095183 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Foxd1Q61345 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Foxd1Q61345 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Foxd1Q61345 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Foxd1Q61345 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Foxd1Q61345 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Foxd1Q61345 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Foxd1Q61345 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Foxd1Q61345 9030407P20Rik-201ENSMUST00000180933 2310 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Foxd1Q61345 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Foxd1Q61345 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Foxd1Q61345 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Foxd1Q61345 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Foxd1Q61345 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Foxd1Q61345 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Foxd1Q61345 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Foxd1Q61345 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Foxd1Q61345 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Foxd1Q61345 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Foxd1Q61345 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Foxd1Q61345 Gm11597-201ENSMUST00000121423 964 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Foxd1Q61345 Gm10863-201ENSMUST00000130745 438 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Foxd1Q61345 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Foxd1Q61345 Tmem116-209ENSMUST00000156080 1184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Foxd1Q61345 Gng2-205ENSMUST00000161247 419 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Foxd1Q61345 Gm17087-201ENSMUST00000184183 471 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Foxd1Q61345 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Foxd1Q61345 Gm43584-201ENSMUST00000199762 605 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
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Foxd1Q61345 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Foxd1Q61345 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Foxd1Q61345 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
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Foxd1Q61345 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Foxd1Q61345 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Foxd1Q61345 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Foxd1Q61345 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Foxd1Q61345 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Foxd1Q61345 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Foxd1Q61345 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Foxd1Q61345 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Foxd1Q61345 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Foxd1Q61345 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Foxd1Q61345 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Foxd1Q61345 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Foxd1Q61345 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Foxd1Q61345 Zp3-201ENSMUST00000005073 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Foxd1Q61345 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Foxd1Q61345 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Foxd1Q61345 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Foxd1Q61345 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Foxd1Q61345 Napsa-201ENSMUST00000002274 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Foxd1Q61345 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
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Foxd1Q61345 Spsb1-202ENSMUST00000105684 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
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Foxd1Q61345 Drap1-209ENSMUST00000136579 734 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Foxd1Q61345 Ccdc103-202ENSMUST00000159834 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Foxd1Q61345 1700099I09Rik-201ENSMUST00000167834 769 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Foxd1Q61345 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
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Foxd1Q61345 Sox2ot-205ENSMUST00000196795 754 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Foxd1Q61345 Gm43701-201ENSMUST00000202047 391 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Foxd1Q61345 Gm44100-201ENSMUST00000204329 436 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Foxd1Q61345 4930578M07Rik-202ENSMUST00000212946 552 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Foxd1Q61345 Crip3-201ENSMUST00000024764 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Foxd1Q61345 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Foxd1Q61345 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Foxd1Q61345 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Foxd1Q61345 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Foxd1Q61345 Oas1f-201ENSMUST00000057814 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Foxd1Q61345 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Foxd1Q61345 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
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Foxd1Q61345 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Foxd1Q61345 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Foxd1Q61345 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
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Foxd1Q61345 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 86 ms