Protein–RNA interactions for Protein: Q5XPI3

Rnf123, E3 ubiquitin-protein ligase RNF123, mousemouse

Predictions only

Length 1,314 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf123Q5XPI3 4930488N24Rik-201ENSMUST00000188802 1527 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Rnf123Q5XPI3 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rnf123Q5XPI3 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rnf123Q5XPI3 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rnf123Q5XPI3 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Rnf123Q5XPI3 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rnf123Q5XPI3 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Rnf123Q5XPI3 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rnf123Q5XPI3 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rnf123Q5XPI3 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rnf123Q5XPI3 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rnf123Q5XPI3 AC134335.2-201ENSMUST00000227660 440 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Rnf123Q5XPI3 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rnf123Q5XPI3 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rnf123Q5XPI3 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rnf123Q5XPI3 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rnf123Q5XPI3 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rnf123Q5XPI3 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rnf123Q5XPI3 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rnf123Q5XPI3 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rnf123Q5XPI3 Slc25a5-ps-202ENSMUST00000223716 1786 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Rnf123Q5XPI3 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rnf123Q5XPI3 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rnf123Q5XPI3 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rnf123Q5XPI3 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rnf123Q5XPI3 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rnf123Q5XPI3 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rnf123Q5XPI3 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rnf123Q5XPI3 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rnf123Q5XPI3 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rnf123Q5XPI3 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rnf123Q5XPI3 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rnf123Q5XPI3 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rnf123Q5XPI3 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rnf123Q5XPI3 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rnf123Q5XPI3 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rnf123Q5XPI3 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rnf123Q5XPI3 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rnf123Q5XPI3 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rnf123Q5XPI3 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Rnf123Q5XPI3 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rnf123Q5XPI3 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Rnf123Q5XPI3 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rnf123Q5XPI3 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Rnf123Q5XPI3 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Rnf123Q5XPI3 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Rnf123Q5XPI3 Gm9899-201ENSMUST00000065519 555 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Rnf123Q5XPI3 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rnf123Q5XPI3 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rnf123Q5XPI3 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rnf123Q5XPI3 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rnf123Q5XPI3 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rnf123Q5XPI3 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rnf123Q5XPI3 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rnf123Q5XPI3 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rnf123Q5XPI3 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Rnf123Q5XPI3 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rnf123Q5XPI3 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rnf123Q5XPI3 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rnf123Q5XPI3 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rnf123Q5XPI3 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rnf123Q5XPI3 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rnf123Q5XPI3 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rnf123Q5XPI3 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rnf123Q5XPI3 Saa3-202ENSMUST00000210913 2200 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rnf123Q5XPI3 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rnf123Q5XPI3 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rnf123Q5XPI3 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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Rnf123Q5XPI3 Spop-202ENSMUST00000107724 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rnf123Q5XPI3 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rnf123Q5XPI3 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rnf123Q5XPI3 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rnf123Q5XPI3 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rnf123Q5XPI3 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rnf123Q5XPI3 Mir1938-201ENSMUST00000158746 100 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Rnf123Q5XPI3 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rnf123Q5XPI3 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
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Rnf123Q5XPI3 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rnf123Q5XPI3 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Rnf123Q5XPI3 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rnf123Q5XPI3 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rnf123Q5XPI3 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rnf123Q5XPI3 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rnf123Q5XPI3 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rnf123Q5XPI3 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rnf123Q5XPI3 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rnf123Q5XPI3 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rnf123Q5XPI3 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rnf123Q5XPI3 Dmac2-202ENSMUST00000085953 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rnf123Q5XPI3 Ankfn1-201ENSMUST00000050983 2665 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rnf123Q5XPI3 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rnf123Q5XPI3 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rnf123Q5XPI3 Camk2b-206ENSMUST00000101585 1650 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
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Rnf123Q5XPI3 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.8 ms