Protein–RNA interactions for Protein: Q5SWD9

Tsr1, Pre-rRNA-processing protein TSR1 homolog, mousemouse

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Length 803 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tsr1Q5SWD9 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tsr1Q5SWD9 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tsr1Q5SWD9 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tsr1Q5SWD9 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tsr1Q5SWD9 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tsr1Q5SWD9 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tsr1Q5SWD9 Cox19-201ENSMUST00000049630 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tsr1Q5SWD9 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tsr1Q5SWD9 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tsr1Q5SWD9 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tsr1Q5SWD9 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tsr1Q5SWD9 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tsr1Q5SWD9 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tsr1Q5SWD9 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tsr1Q5SWD9 Gm14342-201ENSMUST00000137629 2119 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tsr1Q5SWD9 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tsr1Q5SWD9 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tsr1Q5SWD9 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tsr1Q5SWD9 Vwf-202ENSMUST00000112253 2184 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Tsr1Q5SWD9 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Tsr1Q5SWD9 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Tsr1Q5SWD9 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Tsr1Q5SWD9 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Tsr1Q5SWD9 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Tsr1Q5SWD9 Chrna10-201ENSMUST00000084830 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Tsr1Q5SWD9 Glis2-201ENSMUST00000014447 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tsr1Q5SWD9 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tsr1Q5SWD9 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tsr1Q5SWD9 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tsr1Q5SWD9 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tsr1Q5SWD9 Gm26841-201ENSMUST00000180725 1787 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tsr1Q5SWD9 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tsr1Q5SWD9 Nars-201ENSMUST00000025483 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tsr1Q5SWD9 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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Tsr1Q5SWD9 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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Tsr1Q5SWD9 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tsr1Q5SWD9 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tsr1Q5SWD9 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tsr1Q5SWD9 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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Tsr1Q5SWD9 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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Tsr1Q5SWD9 Ralgds-202ENSMUST00000100241 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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Tsr1Q5SWD9 Gm17066-202ENSMUST00000165350 1113 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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Tsr1Q5SWD9 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tsr1Q5SWD9 AC138290.1-201ENSMUST00000219242 820 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
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Tsr1Q5SWD9 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Tsr1Q5SWD9 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tsr1Q5SWD9 Ndufc1-201ENSMUST00000038108 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tsr1Q5SWD9 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tsr1Q5SWD9 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Tsr1Q5SWD9 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tsr1Q5SWD9 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tsr1Q5SWD9 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tsr1Q5SWD9 Gm3139-202ENSMUST00000201138 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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