Protein–RNA interactions for Protein: Q3ZN08

Fam220a, Protein FAM220A, mousemouse

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam220aQ3ZN08 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Fam220aQ3ZN08 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Fam220aQ3ZN08 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Fam220aQ3ZN08 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Fam220aQ3ZN08 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Fam220aQ3ZN08 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Fam220aQ3ZN08 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Fam220aQ3ZN08 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Fam220aQ3ZN08 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Fam220aQ3ZN08 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Fam220aQ3ZN08 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Fam220aQ3ZN08 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Fam220aQ3ZN08 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Fam220aQ3ZN08 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Fam220aQ3ZN08 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Fam220aQ3ZN08 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Fam220aQ3ZN08 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Fam220aQ3ZN08 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Fam220aQ3ZN08 Tmcc2-206ENSMUST00000142609 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Fam220aQ3ZN08 Rubcn-203ENSMUST00000115105 5255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Fam220aQ3ZN08 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Fam220aQ3ZN08 Kif1c-204ENSMUST00000137119 6596 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Fam220aQ3ZN08 Rai1-202ENSMUST00000090806 7217 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Fam220aQ3ZN08 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Fam220aQ3ZN08 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Fam220aQ3ZN08 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Fam220aQ3ZN08 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Fam220aQ3ZN08 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.59
Fam220aQ3ZN08 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Fam220aQ3ZN08 Etl4-201ENSMUST00000045555 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Fam220aQ3ZN08 Reep3-201ENSMUST00000020023 5430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Fam220aQ3ZN08 Tcf12-218ENSMUST00000184783 3489 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.59
Fam220aQ3ZN08 Cops7b-202ENSMUST00000121534 5383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.59
Fam220aQ3ZN08 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.59
Fam220aQ3ZN08 Prkar1b-202ENSMUST00000110889 2457 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.59
Fam220aQ3ZN08 St6gal1-201ENSMUST00000023601 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Fam220aQ3ZN08 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Fam220aQ3ZN08 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Fam220aQ3ZN08 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Fam220aQ3ZN08 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Fam220aQ3ZN08 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Fam220aQ3ZN08 Cercam-201ENSMUST00000047521 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Fam220aQ3ZN08 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Fam220aQ3ZN08 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Fam220aQ3ZN08 Cd276-202ENSMUST00000165365 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Fam220aQ3ZN08 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Fam220aQ3ZN08 Zfp429-201ENSMUST00000109732 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Fam220aQ3ZN08 Gnat2-201ENSMUST00000058669 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Fam220aQ3ZN08 Eps15l1-203ENSMUST00000212121 2686 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Fam220aQ3ZN08 Pygo2-202ENSMUST00000107413 2911 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Fam220aQ3ZN08 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Fam220aQ3ZN08 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Fam220aQ3ZN08 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Fam220aQ3ZN08 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Fam220aQ3ZN08 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Fam220aQ3ZN08 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Fam220aQ3ZN08 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Fam220aQ3ZN08 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Fam220aQ3ZN08 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Fam220aQ3ZN08 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Fam220aQ3ZN08 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Fam220aQ3ZN08 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Fam220aQ3ZN08 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Fam220aQ3ZN08 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Fam220aQ3ZN08 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Fam220aQ3ZN08 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Fam220aQ3ZN08 Lrrc3-201ENSMUST00000057608 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Fam220aQ3ZN08 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Fam220aQ3ZN08 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Fam220aQ3ZN08 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Fam220aQ3ZN08 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Fam220aQ3ZN08 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Fam220aQ3ZN08 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Fam220aQ3ZN08 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Fam220aQ3ZN08 Kiss1r-201ENSMUST00000045529 3163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Fam220aQ3ZN08 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Fam220aQ3ZN08 Gm45833-201ENSMUST00000211931 2730 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Fam220aQ3ZN08 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Fam220aQ3ZN08 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Fam220aQ3ZN08 Fibin-201ENSMUST00000099626 2267 ntAPPRIS P1 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Fam220aQ3ZN08 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Fam220aQ3ZN08 Rspry1-201ENSMUST00000060389 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Fam220aQ3ZN08 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Fam220aQ3ZN08 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Fam220aQ3ZN08 Bdp1-201ENSMUST00000038104 9921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Fam220aQ3ZN08 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Fam220aQ3ZN08 Fam173b-203ENSMUST00000161061 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Fam220aQ3ZN08 Capn2-201ENSMUST00000068505 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Fam220aQ3ZN08 Gm2822-201ENSMUST00000164299 2910 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Fam220aQ3ZN08 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Fam220aQ3ZN08 AC125108.1-201ENSMUST00000218986 2330 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Fam220aQ3ZN08 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Fam220aQ3ZN08 Ip6k1-201ENSMUST00000035214 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Fam220aQ3ZN08 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Fam220aQ3ZN08 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Fam220aQ3ZN08 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Fam220aQ3ZN08 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Fam220aQ3ZN08 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Fam220aQ3ZN08 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Fam220aQ3ZN08 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms