Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0C5

Usp48, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 48, mousemouse

Predictions only

Length 1,052 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp48Q3V0C5 Gm42627-201ENSMUST00000197347 224 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Usp48Q3V0C5 Gm43118-201ENSMUST00000199149 775 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Usp48Q3V0C5 Gm29705-201ENSMUST00000212598 474 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Usp48Q3V0C5 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Usp48Q3V0C5 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Usp48Q3V0C5 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Usp48Q3V0C5 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Usp48Q3V0C5 Rwdd3-201ENSMUST00000039761 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Usp48Q3V0C5 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Usp48Q3V0C5 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Usp48Q3V0C5 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Usp48Q3V0C5 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Usp48Q3V0C5 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Usp48Q3V0C5 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Usp48Q3V0C5 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Usp48Q3V0C5 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Usp48Q3V0C5 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Usp48Q3V0C5 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Usp48Q3V0C5 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Usp48Q3V0C5 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Usp48Q3V0C5 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Usp48Q3V0C5 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Usp48Q3V0C5 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Usp48Q3V0C5 Gm12843-201ENSMUST00000137607 601 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Usp48Q3V0C5 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Usp48Q3V0C5 Fundc1-204ENSMUST00000176638 448 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Usp48Q3V0C5 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Usp48Q3V0C5 Gm43068-201ENSMUST00000201095 1273 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Usp48Q3V0C5 Gm44632-201ENSMUST00000207245 474 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Usp48Q3V0C5 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Usp48Q3V0C5 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Usp48Q3V0C5 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Usp48Q3V0C5 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Usp48Q3V0C5 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Usp48Q3V0C5 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Usp48Q3V0C5 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Usp48Q3V0C5 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Usp48Q3V0C5 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Usp48Q3V0C5 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Usp48Q3V0C5 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Usp48Q3V0C5 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Usp48Q3V0C5 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Usp48Q3V0C5 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Usp48Q3V0C5 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Usp48Q3V0C5 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Usp48Q3V0C5 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Usp48Q3V0C5 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Usp48Q3V0C5 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Usp48Q3V0C5 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Usp48Q3V0C5 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Usp48Q3V0C5 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Usp48Q3V0C5 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Usp48Q3V0C5 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Usp48Q3V0C5 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Usp48Q3V0C5 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Usp48Q3V0C5 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Usp48Q3V0C5 Ly6g5b-202ENSMUST00000172854 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Usp48Q3V0C5 Dcdc2b-203ENSMUST00000179209 864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Usp48Q3V0C5 Gm8598-201ENSMUST00000221184 836 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Usp48Q3V0C5 Mea1-201ENSMUST00000002845 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Usp48Q3V0C5 1700007G11Rik-201ENSMUST00000080333 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Usp48Q3V0C5 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Usp48Q3V0C5 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Usp48Q3V0C5 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Usp48Q3V0C5 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Usp48Q3V0C5 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Usp48Q3V0C5 4930528D03Rik-203ENSMUST00000225577 1348 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Usp48Q3V0C5 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Usp48Q3V0C5 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Usp48Q3V0C5 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Usp48Q3V0C5 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Usp48Q3V0C5 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Usp48Q3V0C5 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Usp48Q3V0C5 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Usp48Q3V0C5 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Usp48Q3V0C5 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Usp48Q3V0C5 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Usp48Q3V0C5 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Usp48Q3V0C5 Cdkn1a-202ENSMUST00000119901 748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Usp48Q3V0C5 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Usp48Q3V0C5 Gm45692-201ENSMUST00000131138 557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Usp48Q3V0C5 Gm26728-201ENSMUST00000185268 595 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Usp48Q3V0C5 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Usp48Q3V0C5 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Usp48Q3V0C5 Gm38341-201ENSMUST00000195357 515 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Usp48Q3V0C5 Gm18935-201ENSMUST00000212692 664 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Usp48Q3V0C5 Gm18473-201ENSMUST00000220543 868 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Usp48Q3V0C5 Mrap-201ENSMUST00000038197 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Usp48Q3V0C5 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Usp48Q3V0C5 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Usp48Q3V0C5 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Usp48Q3V0C5 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Usp48Q3V0C5 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Usp48Q3V0C5 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Usp48Q3V0C5 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Usp48Q3V0C5 Ewsr1-201ENSMUST00000063232 1320 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Usp48Q3V0C5 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Usp48Q3V0C5 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Usp48Q3V0C5 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Usp48Q3V0C5 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms