Protein–RNA interactions for Protein: Q3UZ01

Rnpc3, RNA-binding protein 40, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 514 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnpc3Q3UZ01 Gm24526-201ENSMUST00000082921 158 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Rnpc3Q3UZ01 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rnpc3Q3UZ01 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rnpc3Q3UZ01 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rnpc3Q3UZ01 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rnpc3Q3UZ01 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rnpc3Q3UZ01 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rnpc3Q3UZ01 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Rnpc3Q3UZ01 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Rnpc3Q3UZ01 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rnpc3Q3UZ01 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rnpc3Q3UZ01 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rnpc3Q3UZ01 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rnpc3Q3UZ01 Bin2-205ENSMUST00000182814 1901 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Rnpc3Q3UZ01 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rnpc3Q3UZ01 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rnpc3Q3UZ01 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Rnpc3Q3UZ01 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rnpc3Q3UZ01 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rnpc3Q3UZ01 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Rnpc3Q3UZ01 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rnpc3Q3UZ01 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rnpc3Q3UZ01 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rnpc3Q3UZ01 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rnpc3Q3UZ01 Mageb10-ps-201ENSMUST00000119697 1407 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Rnpc3Q3UZ01 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rnpc3Q3UZ01 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rnpc3Q3UZ01 Txn2-202ENSMUST00000100486 676 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rnpc3Q3UZ01 Styxl1-202ENSMUST00000111161 963 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rnpc3Q3UZ01 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Rnpc3Q3UZ01 9230020A06Rik-204ENSMUST00000215201 1116 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Rnpc3Q3UZ01 4930447A16Rik-201ENSMUST00000022897 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rnpc3Q3UZ01 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rnpc3Q3UZ01 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Rnpc3Q3UZ01 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rnpc3Q3UZ01 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rnpc3Q3UZ01 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rnpc3Q3UZ01 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Rnpc3Q3UZ01 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rnpc3Q3UZ01 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rnpc3Q3UZ01 Erich1-201ENSMUST00000110813 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rnpc3Q3UZ01 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Rnpc3Q3UZ01 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rnpc3Q3UZ01 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rnpc3Q3UZ01 4933435G04Rik-201ENSMUST00000205892 2108 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Rnpc3Q3UZ01 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rnpc3Q3UZ01 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rnpc3Q3UZ01 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Rnpc3Q3UZ01 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rnpc3Q3UZ01 Gpr18-201ENSMUST00000055475 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rnpc3Q3UZ01 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rnpc3Q3UZ01 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rnpc3Q3UZ01 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rnpc3Q3UZ01 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rnpc3Q3UZ01 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Rnpc3Q3UZ01 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rnpc3Q3UZ01 Allc-202ENSMUST00000110917 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rnpc3Q3UZ01 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Rnpc3Q3UZ01 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Rnpc3Q3UZ01 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rnpc3Q3UZ01 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rnpc3Q3UZ01 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Rnpc3Q3UZ01 Gm16570-201ENSMUST00000161951 436 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Rnpc3Q3UZ01 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rnpc3Q3UZ01 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rnpc3Q3UZ01 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Rnpc3Q3UZ01 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Rnpc3Q3UZ01 Gm4857-201ENSMUST00000192718 785 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Rnpc3Q3UZ01 Gm37466-201ENSMUST00000195692 652 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Rnpc3Q3UZ01 Gm18473-201ENSMUST00000220543 868 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Rnpc3Q3UZ01 Comt-201ENSMUST00000000335 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rnpc3Q3UZ01 Ccs-201ENSMUST00000037246 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rnpc3Q3UZ01 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rnpc3Q3UZ01 Tmem40-201ENSMUST00000072933 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rnpc3Q3UZ01 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Rnpc3Q3UZ01 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Rnpc3Q3UZ01 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Rnpc3Q3UZ01 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Rnpc3Q3UZ01 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Rnpc3Q3UZ01 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Rnpc3Q3UZ01 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Rnpc3Q3UZ01 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Rnpc3Q3UZ01 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
Rnpc3Q3UZ01 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Rnpc3Q3UZ01 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Rnpc3Q3UZ01 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Rnpc3Q3UZ01 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rnpc3Q3UZ01 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rnpc3Q3UZ01 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rnpc3Q3UZ01 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rnpc3Q3UZ01 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rnpc3Q3UZ01 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rnpc3Q3UZ01 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rnpc3Q3UZ01 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rnpc3Q3UZ01 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rnpc3Q3UZ01 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rnpc3Q3UZ01 Taldo1-204ENSMUST00000211654 1362 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rnpc3Q3UZ01 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rnpc3Q3UZ01 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rnpc3Q3UZ01 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.3 ms