Protein–RNA interactions for Protein: Q3UW68

Capn13, Calpain-13, mousemouse

Predictions only

Length 665 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn13Q3UW68 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Capn13Q3UW68 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Capn13Q3UW68 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Capn13Q3UW68 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Capn13Q3UW68 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Capn13Q3UW68 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Capn13Q3UW68 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Capn13Q3UW68 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Capn13Q3UW68 Emd-202ENSMUST00000088313 1338 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Capn13Q3UW68 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Capn13Q3UW68 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Capn13Q3UW68 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Capn13Q3UW68 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Capn13Q3UW68 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Capn13Q3UW68 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Capn13Q3UW68 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Capn13Q3UW68 Gm18630-201ENSMUST00000222109 1397 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Capn13Q3UW68 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Capn13Q3UW68 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Capn13Q3UW68 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Capn13Q3UW68 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Capn13Q3UW68 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Capn13Q3UW68 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Capn13Q3UW68 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Capn13Q3UW68 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Capn13Q3UW68 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Capn13Q3UW68 Gm6447-201ENSMUST00000118905 835 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Capn13Q3UW68 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Capn13Q3UW68 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Capn13Q3UW68 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Capn13Q3UW68 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Capn13Q3UW68 Gm27847-201ENSMUST00000183711 107 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Capn13Q3UW68 Gm27375-201ENSMUST00000183799 107 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Capn13Q3UW68 Gm45505-201ENSMUST00000210252 948 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Capn13Q3UW68 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Capn13Q3UW68 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Capn13Q3UW68 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Capn13Q3UW68 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Capn13Q3UW68 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Capn13Q3UW68 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Capn13Q3UW68 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Capn13Q3UW68 Abhd6-203ENSMUST00000225234 1958 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Capn13Q3UW68 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Capn13Q3UW68 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Capn13Q3UW68 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Capn13Q3UW68 Gm13050-201ENSMUST00000122149 1345 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Capn13Q3UW68 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Capn13Q3UW68 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Capn13Q3UW68 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Capn13Q3UW68 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Capn13Q3UW68 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Capn13Q3UW68 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Capn13Q3UW68 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Capn13Q3UW68 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Capn13Q3UW68 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Capn13Q3UW68 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Capn13Q3UW68 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Capn13Q3UW68 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Capn13Q3UW68 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Capn13Q3UW68 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Capn13Q3UW68 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Capn13Q3UW68 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Capn13Q3UW68 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Capn13Q3UW68 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Capn13Q3UW68 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Capn13Q3UW68 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Capn13Q3UW68 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Capn13Q3UW68 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Capn13Q3UW68 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Capn13Q3UW68 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Capn13Q3UW68 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Capn13Q3UW68 Wisp1-202ENSMUST00000118823 708 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Capn13Q3UW68 Gm10156-201ENSMUST00000122364 462 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Capn13Q3UW68 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Capn13Q3UW68 Gm16136-203ENSMUST00000162520 1121 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Capn13Q3UW68 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Capn13Q3UW68 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Capn13Q3UW68 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Capn13Q3UW68 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Capn13Q3UW68 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Capn13Q3UW68 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Capn13Q3UW68 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Capn13Q3UW68 Gm6091-201ENSMUST00000098307 165 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Capn13Q3UW68 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Capn13Q3UW68 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Capn13Q3UW68 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Capn13Q3UW68 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Capn13Q3UW68 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Capn13Q3UW68 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Capn13Q3UW68 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Capn13Q3UW68 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Capn13Q3UW68 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Capn13Q3UW68 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Capn13Q3UW68 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Capn13Q3UW68 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Capn13Q3UW68 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Capn13Q3UW68 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Capn13Q3UW68 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Capn13Q3UW68 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Capn13Q3UW68 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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