Protein–RNA interactions for Protein: Q3US59

Gm28047, Predicted gene, 28047, mousemouse

Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28047Q3US59 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gm28047Q3US59 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gm28047Q3US59 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm28047Q3US59 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm28047Q3US59 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm28047Q3US59 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm28047Q3US59 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm28047Q3US59 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm28047Q3US59 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm28047Q3US59 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm28047Q3US59 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm28047Q3US59 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm28047Q3US59 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm28047Q3US59 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm28047Q3US59 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm28047Q3US59 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm28047Q3US59 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm28047Q3US59 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm28047Q3US59 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm28047Q3US59 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm28047Q3US59 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm28047Q3US59 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm28047Q3US59 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm28047Q3US59 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm28047Q3US59 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm28047Q3US59 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm28047Q3US59 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm28047Q3US59 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm28047Q3US59 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm28047Q3US59 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm28047Q3US59 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm28047Q3US59 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm28047Q3US59 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm28047Q3US59 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm28047Q3US59 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm28047Q3US59 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm28047Q3US59 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm28047Q3US59 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm28047Q3US59 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm28047Q3US59 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm28047Q3US59 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm28047Q3US59 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm28047Q3US59 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm28047Q3US59 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm28047Q3US59 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm28047Q3US59 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm28047Q3US59 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm28047Q3US59 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm28047Q3US59 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm28047Q3US59 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm28047Q3US59 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm28047Q3US59 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm28047Q3US59 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm28047Q3US59 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm28047Q3US59 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm28047Q3US59 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm28047Q3US59 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm28047Q3US59 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm28047Q3US59 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm28047Q3US59 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm28047Q3US59 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm28047Q3US59 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm28047Q3US59 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm28047Q3US59 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm28047Q3US59 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm28047Q3US59 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm28047Q3US59 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm28047Q3US59 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm28047Q3US59 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm28047Q3US59 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm28047Q3US59 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm28047Q3US59 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm28047Q3US59 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm28047Q3US59 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm28047Q3US59 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm28047Q3US59 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm28047Q3US59 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm28047Q3US59 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm28047Q3US59 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm28047Q3US59 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm28047Q3US59 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm28047Q3US59 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm28047Q3US59 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm28047Q3US59 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm28047Q3US59 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm28047Q3US59 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm28047Q3US59 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm28047Q3US59 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm28047Q3US59 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm28047Q3US59 Gm15459-201ENSMUST00000117405 1941 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm28047Q3US59 Gm8355-201ENSMUST00000177767 1941 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm28047Q3US59 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm28047Q3US59 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm28047Q3US59 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm28047Q3US59 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm28047Q3US59 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm28047Q3US59 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm28047Q3US59 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm28047Q3US59 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm28047Q3US59 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.4 ms