Protein–RNA interactions for Protein: Q3UMU9

Hdgfl2, Hepatoma-derived growth factor-related protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 669 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdgfl2Q3UMU9 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hdgfl2Q3UMU9 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hdgfl2Q3UMU9 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hdgfl2Q3UMU9 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hdgfl2Q3UMU9 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hdgfl2Q3UMU9 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hdgfl2Q3UMU9 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hdgfl2Q3UMU9 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Hdgfl2Q3UMU9 Camk4-201ENSMUST00000042868 12331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hdgfl2Q3UMU9 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hdgfl2Q3UMU9 Gm13288-201ENSMUST00000094977 2850 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hdgfl2Q3UMU9 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hdgfl2Q3UMU9 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hdgfl2Q3UMU9 Mdga1-201ENSMUST00000073556 7566 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hdgfl2Q3UMU9 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hdgfl2Q3UMU9 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hdgfl2Q3UMU9 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hdgfl2Q3UMU9 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hdgfl2Q3UMU9 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Hdgfl2Q3UMU9 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hdgfl2Q3UMU9 Mbnl2-204ENSMUST00000227012 2390 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Hdgfl2Q3UMU9 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hdgfl2Q3UMU9 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hdgfl2Q3UMU9 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hdgfl2Q3UMU9 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hdgfl2Q3UMU9 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hdgfl2Q3UMU9 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hdgfl2Q3UMU9 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hdgfl2Q3UMU9 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hdgfl2Q3UMU9 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hdgfl2Q3UMU9 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Hdgfl2Q3UMU9 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hdgfl2Q3UMU9 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hdgfl2Q3UMU9 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hdgfl2Q3UMU9 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hdgfl2Q3UMU9 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hdgfl2Q3UMU9 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hdgfl2Q3UMU9 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Hdgfl2Q3UMU9 Cecr2-202ENSMUST00000112686 9212 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hdgfl2Q3UMU9 Xylb-201ENSMUST00000039610 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hdgfl2Q3UMU9 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hdgfl2Q3UMU9 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hdgfl2Q3UMU9 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hdgfl2Q3UMU9 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hdgfl2Q3UMU9 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hdgfl2Q3UMU9 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hdgfl2Q3UMU9 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hdgfl2Q3UMU9 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hdgfl2Q3UMU9 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hdgfl2Q3UMU9 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hdgfl2Q3UMU9 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hdgfl2Q3UMU9 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hdgfl2Q3UMU9 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hdgfl2Q3UMU9 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hdgfl2Q3UMU9 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hdgfl2Q3UMU9 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Hdgfl2Q3UMU9 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Hdgfl2Q3UMU9 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hdgfl2Q3UMU9 Gas5-210ENSMUST00000159706 557 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hdgfl2Q3UMU9 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hdgfl2Q3UMU9 Crip2-202ENSMUST00000196015 772 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hdgfl2Q3UMU9 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hdgfl2Q3UMU9 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hdgfl2Q3UMU9 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hdgfl2Q3UMU9 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hdgfl2Q3UMU9 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hdgfl2Q3UMU9 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Hdgfl2Q3UMU9 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hdgfl2Q3UMU9 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hdgfl2Q3UMU9 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hdgfl2Q3UMU9 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hdgfl2Q3UMU9 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hdgfl2Q3UMU9 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hdgfl2Q3UMU9 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hdgfl2Q3UMU9 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hdgfl2Q3UMU9 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hdgfl2Q3UMU9 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hdgfl2Q3UMU9 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hdgfl2Q3UMU9 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hdgfl2Q3UMU9 Asxl1-201ENSMUST00000109790 6968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hdgfl2Q3UMU9 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hdgfl2Q3UMU9 Armc8-201ENSMUST00000035043 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hdgfl2Q3UMU9 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hdgfl2Q3UMU9 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hdgfl2Q3UMU9 Mrpl3-201ENSMUST00000035177 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hdgfl2Q3UMU9 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hdgfl2Q3UMU9 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hdgfl2Q3UMU9 Apoo-204ENSMUST00000113898 784 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hdgfl2Q3UMU9 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hdgfl2Q3UMU9 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hdgfl2Q3UMU9 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hdgfl2Q3UMU9 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hdgfl2Q3UMU9 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hdgfl2Q3UMU9 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hdgfl2Q3UMU9 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hdgfl2Q3UMU9 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Hdgfl2Q3UMU9 Gm42902-201ENSMUST00000199508 662 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hdgfl2Q3UMU9 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hdgfl2Q3UMU9 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Hdgfl2Q3UMU9 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.1 ms