Protein–RNA interactions for Protein: Q3UI66

Ccdc34, Coiled-coil domain-containing protein 34, mousemouse

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc34Q3UI66 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ccdc34Q3UI66 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ccdc34Q3UI66 Snx33-201ENSMUST00000050916 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ccdc34Q3UI66 Zfp108-203ENSMUST00000206777 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ccdc34Q3UI66 4930534D22Rik-201ENSMUST00000181438 2715 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ccdc34Q3UI66 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ccdc34Q3UI66 Zfp207-206ENSMUST00000165565 2311 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ccdc34Q3UI66 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ccdc34Q3UI66 Kalrn-201ENSMUST00000076810 8940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ccdc34Q3UI66 Hook2-204ENSMUST00000210326 3080 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ccdc34Q3UI66 Cmtm6-201ENSMUST00000035007 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ccdc34Q3UI66 Map3k11-201ENSMUST00000004156 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ccdc34Q3UI66 Pphln1-202ENSMUST00000068457 3816 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ccdc34Q3UI66 Nyap1-202ENSMUST00000118326 4565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ccdc34Q3UI66 Rnf17-202ENSMUST00000223627 2077 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Ccdc34Q3UI66 Islr-201ENSMUST00000041477 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ccdc34Q3UI66 Itfg2-203ENSMUST00000142615 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ccdc34Q3UI66 Cep41-203ENSMUST00000115131 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ccdc34Q3UI66 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ccdc34Q3UI66 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ccdc34Q3UI66 Tns2-201ENSMUST00000046144 4718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ccdc34Q3UI66 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ccdc34Q3UI66 Tnk2-205ENSMUST00000115124 4424 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ccdc34Q3UI66 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ccdc34Q3UI66 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ccdc34Q3UI66 Xkr8-201ENSMUST00000045550 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ccdc34Q3UI66 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ccdc34Q3UI66 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ccdc34Q3UI66 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ccdc34Q3UI66 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ccdc34Q3UI66 Gm38385-201ENSMUST00000194454 2351 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Ccdc34Q3UI66 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ccdc34Q3UI66 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ccdc34Q3UI66 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ccdc34Q3UI66 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ccdc34Q3UI66 Gm42660-201ENSMUST00000197733 947 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Ccdc34Q3UI66 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ccdc34Q3UI66 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ccdc34Q3UI66 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ccdc34Q3UI66 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ccdc34Q3UI66 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ccdc34Q3UI66 Gja8-201ENSMUST00000062944 6940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ccdc34Q3UI66 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ccdc34Q3UI66 Scn8a-208ENSMUST00000200963 5814 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ccdc34Q3UI66 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ccdc34Q3UI66 Csrnp2-201ENSMUST00000061457 4126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ccdc34Q3UI66 Epb41l1-206ENSMUST00000109577 6251 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ccdc34Q3UI66 Olfm2-201ENSMUST00000034692 1836 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ccdc34Q3UI66 Gemin4-201ENSMUST00000102500 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ccdc34Q3UI66 Mrvi1-202ENSMUST00000125758 5953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ccdc34Q3UI66 Crmp1-201ENSMUST00000031004 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ccdc34Q3UI66 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ccdc34Q3UI66 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ccdc34Q3UI66 Pip4k2b-201ENSMUST00000018691 5053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ccdc34Q3UI66 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ccdc34Q3UI66 Nfe2l1-211ENSMUST00000167149 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ccdc34Q3UI66 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ccdc34Q3UI66 Xpot-203ENSMUST00000218004 6005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ccdc34Q3UI66 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ccdc34Q3UI66 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ccdc34Q3UI66 Myo5b-203ENSMUST00000121875 6065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ccdc34Q3UI66 A330093E20Rik-202ENSMUST00000184994 2327 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ccdc34Q3UI66 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ccdc34Q3UI66 Aacs-201ENSMUST00000031445 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ccdc34Q3UI66 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ccdc34Q3UI66 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ccdc34Q3UI66 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ccdc34Q3UI66 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ccdc34Q3UI66 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ccdc34Q3UI66 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ccdc34Q3UI66 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ccdc34Q3UI66 Gm26857-201ENSMUST00000181580 3347 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ccdc34Q3UI66 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ccdc34Q3UI66 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ccdc34Q3UI66 Fbxl12-201ENSMUST00000086458 2056 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ccdc34Q3UI66 Fbxl12-202ENSMUST00000086459 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ccdc34Q3UI66 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ccdc34Q3UI66 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ccdc34Q3UI66 Nol4l-202ENSMUST00000109784 5610 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ccdc34Q3UI66 Ntrk2-202ENSMUST00000109838 6846 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ccdc34Q3UI66 Cog1-201ENSMUST00000018805 3935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ccdc34Q3UI66 Rapgef3-205ENSMUST00000129223 3750 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ccdc34Q3UI66 Abcc10-201ENSMUST00000047970 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ccdc34Q3UI66 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ccdc34Q3UI66 Gtf2ird1-224ENSMUST00000202280 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ccdc34Q3UI66 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ccdc34Q3UI66 Mkl1-209ENSMUST00000149582 4366 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ccdc34Q3UI66 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ccdc34Q3UI66 Ppip5k1-202ENSMUST00000110625 5226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ccdc34Q3UI66 Rasa3-201ENSMUST00000117551 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ccdc34Q3UI66 Eogt-201ENSMUST00000054344 4424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ccdc34Q3UI66 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ccdc34Q3UI66 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Ccdc34Q3UI66 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ccdc34Q3UI66 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ccdc34Q3UI66 Lsm3-205ENSMUST00000206947 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ccdc34Q3UI66 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ccdc34Q3UI66 AC154634.3-201ENSMUST00000224589 736 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Ccdc34Q3UI66 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Ccdc34Q3UI66 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.4 ms