Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0D9

Hace1, E3 ubiquitin-protein ligase HACE1, mousemouse

Predictions only

Length 909 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hace1Q3U0D9 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hace1Q3U0D9 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hace1Q3U0D9 4933435G04Rik-201ENSMUST00000205892 2108 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Hace1Q3U0D9 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hace1Q3U0D9 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hace1Q3U0D9 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hace1Q3U0D9 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hace1Q3U0D9 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hace1Q3U0D9 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hace1Q3U0D9 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hace1Q3U0D9 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hace1Q3U0D9 Slc22a15-201ENSMUST00000106928 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hace1Q3U0D9 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hace1Q3U0D9 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hace1Q3U0D9 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hace1Q3U0D9 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hace1Q3U0D9 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hace1Q3U0D9 Pcdh19-202ENSMUST00000149154 10289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hace1Q3U0D9 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hace1Q3U0D9 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hace1Q3U0D9 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hace1Q3U0D9 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hace1Q3U0D9 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Hace1Q3U0D9 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Hace1Q3U0D9 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hace1Q3U0D9 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hace1Q3U0D9 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hace1Q3U0D9 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hace1Q3U0D9 9230020A06Rik-204ENSMUST00000215201 1116 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hace1Q3U0D9 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hace1Q3U0D9 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hace1Q3U0D9 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hace1Q3U0D9 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hace1Q3U0D9 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hace1Q3U0D9 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hace1Q3U0D9 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hace1Q3U0D9 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hace1Q3U0D9 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Hace1Q3U0D9 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hace1Q3U0D9 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hace1Q3U0D9 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hace1Q3U0D9 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hace1Q3U0D9 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hace1Q3U0D9 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hace1Q3U0D9 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hace1Q3U0D9 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hace1Q3U0D9 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hace1Q3U0D9 Olfr279-202ENSMUST00000205772 5330 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hace1Q3U0D9 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hace1Q3U0D9 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hace1Q3U0D9 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Hace1Q3U0D9 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hace1Q3U0D9 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Hace1Q3U0D9 Gm29152-201ENSMUST00000189284 325 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hace1Q3U0D9 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Hace1Q3U0D9 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hace1Q3U0D9 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hace1Q3U0D9 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Hace1Q3U0D9 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hace1Q3U0D9 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hace1Q3U0D9 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hace1Q3U0D9 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hace1Q3U0D9 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hace1Q3U0D9 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hace1Q3U0D9 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hace1Q3U0D9 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hace1Q3U0D9 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hace1Q3U0D9 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hace1Q3U0D9 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hace1Q3U0D9 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hace1Q3U0D9 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hace1Q3U0D9 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hace1Q3U0D9 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hace1Q3U0D9 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hace1Q3U0D9 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hace1Q3U0D9 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hace1Q3U0D9 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hace1Q3U0D9 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hace1Q3U0D9 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hace1Q3U0D9 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hace1Q3U0D9 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hace1Q3U0D9 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hace1Q3U0D9 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hace1Q3U0D9 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hace1Q3U0D9 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hace1Q3U0D9 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hace1Q3U0D9 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Hace1Q3U0D9 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hace1Q3U0D9 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hace1Q3U0D9 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hace1Q3U0D9 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hace1Q3U0D9 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hace1Q3U0D9 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hace1Q3U0D9 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hace1Q3U0D9 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hace1Q3U0D9 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hace1Q3U0D9 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hace1Q3U0D9 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hace1Q3U0D9 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hace1Q3U0D9 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms