Protein–RNA interactions for Protein: Q3TVC7

Ccndbp1, Cyclin-D1-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccndbp1Q3TVC7 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccndbp1Q3TVC7 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccndbp1Q3TVC7 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccndbp1Q3TVC7 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccndbp1Q3TVC7 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccndbp1Q3TVC7 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccndbp1Q3TVC7 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccndbp1Q3TVC7 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccndbp1Q3TVC7 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccndbp1Q3TVC7 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccndbp1Q3TVC7 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ccndbp1Q3TVC7 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ccndbp1Q3TVC7 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ccndbp1Q3TVC7 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ccndbp1Q3TVC7 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ccndbp1Q3TVC7 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ccndbp1Q3TVC7 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Ccndbp1Q3TVC7 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Ccndbp1Q3TVC7 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ccndbp1Q3TVC7 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ccndbp1Q3TVC7 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ccndbp1Q3TVC7 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ccndbp1Q3TVC7 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ccndbp1Q3TVC7 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ccndbp1Q3TVC7 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ccndbp1Q3TVC7 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ccndbp1Q3TVC7 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ccndbp1Q3TVC7 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ccndbp1Q3TVC7 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Ccndbp1Q3TVC7 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ccndbp1Q3TVC7 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ccndbp1Q3TVC7 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ccndbp1Q3TVC7 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ccndbp1Q3TVC7 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Ccndbp1Q3TVC7 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ccndbp1Q3TVC7 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Ccndbp1Q3TVC7 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ccndbp1Q3TVC7 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ccndbp1Q3TVC7 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ccndbp1Q3TVC7 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ccndbp1Q3TVC7 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ccndbp1Q3TVC7 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ccndbp1Q3TVC7 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Ccndbp1Q3TVC7 4930513N10Rik-204ENSMUST00000212647 3957 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Ccndbp1Q3TVC7 Gpr19-208ENSMUST00000165392 1643 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ccndbp1Q3TVC7 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ccndbp1Q3TVC7 Tmem132e-202ENSMUST00000092852 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ccndbp1Q3TVC7 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ccndbp1Q3TVC7 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ccndbp1Q3TVC7 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ccndbp1Q3TVC7 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ccndbp1Q3TVC7 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ccndbp1Q3TVC7 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ccndbp1Q3TVC7 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ccndbp1Q3TVC7 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ccndbp1Q3TVC7 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ccndbp1Q3TVC7 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ccndbp1Q3TVC7 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ccndbp1Q3TVC7 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ccndbp1Q3TVC7 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ccndbp1Q3TVC7 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ccndbp1Q3TVC7 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ccndbp1Q3TVC7 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ccndbp1Q3TVC7 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ccndbp1Q3TVC7 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ccndbp1Q3TVC7 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ccndbp1Q3TVC7 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ccndbp1Q3TVC7 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ccndbp1Q3TVC7 Gm12537-201ENSMUST00000119266 1002 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
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Ccndbp1Q3TVC7 Gm13292-201ENSMUST00000120014 1000 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Ccndbp1Q3TVC7 Gm12403-201ENSMUST00000121384 959 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Ccndbp1Q3TVC7 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ccndbp1Q3TVC7 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ccndbp1Q3TVC7 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Ccndbp1Q3TVC7 Gm10359-201ENSMUST00000180167 1002 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Ccndbp1Q3TVC7 Gm12033-201ENSMUST00000180654 1002 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Ccndbp1Q3TVC7 Gm5559-201ENSMUST00000180755 1002 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Ccndbp1Q3TVC7 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ccndbp1Q3TVC7 Gm4335-201ENSMUST00000182581 1004 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Ccndbp1Q3TVC7 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Ccndbp1Q3TVC7 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ccndbp1Q3TVC7 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ccndbp1Q3TVC7 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ccndbp1Q3TVC7 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Ccndbp1Q3TVC7 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Ccndbp1Q3TVC7 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ccndbp1Q3TVC7 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ccndbp1Q3TVC7 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ccndbp1Q3TVC7 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ccndbp1Q3TVC7 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ccndbp1Q3TVC7 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ccndbp1Q3TVC7 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ccndbp1Q3TVC7 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ccndbp1Q3TVC7 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ccndbp1Q3TVC7 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ccndbp1Q3TVC7 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ccndbp1Q3TVC7 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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