Protein–RNA interactions for Protein: Q3TMP1

Gtf3c3, General transcription factor IIIC, polypeptide 3, mousemouse

Predictions only

Length 882 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c3Q3TMP1 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gtf3c3Q3TMP1 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gtf3c3Q3TMP1 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gtf3c3Q3TMP1 Gm10419-202ENSMUST00000196693 2530 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gtf3c3Q3TMP1 Ttc34-201ENSMUST00000050220 3200 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gtf3c3Q3TMP1 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gtf3c3Q3TMP1 Pabpc4-204ENSMUST00000106243 3111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gtf3c3Q3TMP1 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gtf3c3Q3TMP1 Kdm4d-201ENSMUST00000058796 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gtf3c3Q3TMP1 Shisa9-201ENSMUST00000023138 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gtf3c3Q3TMP1 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gtf3c3Q3TMP1 Tspan1-201ENSMUST00000030465 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gtf3c3Q3TMP1 2900097C17Rik-202ENSMUST00000192863 4915 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Gtf3c3Q3TMP1 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gtf3c3Q3TMP1 Gm37513-201ENSMUST00000194830 2268 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Gtf3c3Q3TMP1 Gm38378-201ENSMUST00000195153 2268 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Gtf3c3Q3TMP1 Lmo7-201ENSMUST00000100337 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gtf3c3Q3TMP1 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Gtf3c3Q3TMP1 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Gtf3c3Q3TMP1 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Gtf3c3Q3TMP1 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gtf3c3Q3TMP1 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gtf3c3Q3TMP1 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gtf3c3Q3TMP1 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Gtf3c3Q3TMP1 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gtf3c3Q3TMP1 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gtf3c3Q3TMP1 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gtf3c3Q3TMP1 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gtf3c3Q3TMP1 Fn3krp-201ENSMUST00000038096 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gtf3c3Q3TMP1 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gtf3c3Q3TMP1 Olfr464-204ENSMUST00000216461 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gtf3c3Q3TMP1 Ctnnbl1-201ENSMUST00000029178 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gtf3c3Q3TMP1 Sfmbt1-206ENSMUST00000228006 3299 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gtf3c3Q3TMP1 Car10-201ENSMUST00000042943 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gtf3c3Q3TMP1 Cyth3-201ENSMUST00000110727 2068 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gtf3c3Q3TMP1 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gtf3c3Q3TMP1 Zfp536-203ENSMUST00000176114 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gtf3c3Q3TMP1 Wnt9b-201ENSMUST00000018630 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gtf3c3Q3TMP1 Lbh-201ENSMUST00000024857 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gtf3c3Q3TMP1 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gtf3c3Q3TMP1 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gtf3c3Q3TMP1 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gtf3c3Q3TMP1 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gtf3c3Q3TMP1 Ibtk-201ENSMUST00000039213 5650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gtf3c3Q3TMP1 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gtf3c3Q3TMP1 AI597479-201ENSMUST00000010434 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gtf3c3Q3TMP1 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gtf3c3Q3TMP1 Tat-201ENSMUST00000001720 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gtf3c3Q3TMP1 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gtf3c3Q3TMP1 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gtf3c3Q3TMP1 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gtf3c3Q3TMP1 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gtf3c3Q3TMP1 Rad23a-201ENSMUST00000003911 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gtf3c3Q3TMP1 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gtf3c3Q3TMP1 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gtf3c3Q3TMP1 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gtf3c3Q3TMP1 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gtf3c3Q3TMP1 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gtf3c3Q3TMP1 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Gtf3c3Q3TMP1 Tgfbr2-201ENSMUST00000035014 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gtf3c3Q3TMP1 Prkcd-204ENSMUST00000112206 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gtf3c3Q3TMP1 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gtf3c3Q3TMP1 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gtf3c3Q3TMP1 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gtf3c3Q3TMP1 Treh-202ENSMUST00000071219 1927 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gtf3c3Q3TMP1 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gtf3c3Q3TMP1 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gtf3c3Q3TMP1 Ccnk-201ENSMUST00000101055 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gtf3c3Q3TMP1 Kifc5b-201ENSMUST00000078961 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gtf3c3Q3TMP1 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gtf3c3Q3TMP1 Slc25a25-205ENSMUST00000113310 3278 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gtf3c3Q3TMP1 CT009757.3-201ENSMUST00000223367 2320 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
Gtf3c3Q3TMP1 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gtf3c3Q3TMP1 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Gtf3c3Q3TMP1 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gtf3c3Q3TMP1 Cd33-202ENSMUST00000039861 1791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gtf3c3Q3TMP1 Tgm1-202ENSMUST00000168729 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gtf3c3Q3TMP1 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gtf3c3Q3TMP1 Chpf2-202ENSMUST00000121863 3715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gtf3c3Q3TMP1 Slc25a40-201ENSMUST00000066921 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gtf3c3Q3TMP1 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gtf3c3Q3TMP1 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gtf3c3Q3TMP1 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gtf3c3Q3TMP1 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gtf3c3Q3TMP1 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Gtf3c3Q3TMP1 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gtf3c3Q3TMP1 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Gtf3c3Q3TMP1 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gtf3c3Q3TMP1 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Gtf3c3Q3TMP1 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Gtf3c3Q3TMP1 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gtf3c3Q3TMP1 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gtf3c3Q3TMP1 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gtf3c3Q3TMP1 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gtf3c3Q3TMP1 AC153506.1-201ENSMUST00000218768 2915 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Gtf3c3Q3TMP1 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gtf3c3Q3TMP1 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gtf3c3Q3TMP1 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gtf3c3Q3TMP1 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Gtf3c3Q3TMP1 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms