Protein–RNA interactions for Protein: Q3TD16

Rubcnl, Protein RUBCNL-like, mousemouse

Predictions only

Length 648 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RubcnlQ3TD16 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RubcnlQ3TD16 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RubcnlQ3TD16 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
RubcnlQ3TD16 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
RubcnlQ3TD16 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RubcnlQ3TD16 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RubcnlQ3TD16 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RubcnlQ3TD16 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RubcnlQ3TD16 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RubcnlQ3TD16 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RubcnlQ3TD16 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RubcnlQ3TD16 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RubcnlQ3TD16 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
RubcnlQ3TD16 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RubcnlQ3TD16 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RubcnlQ3TD16 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RubcnlQ3TD16 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RubcnlQ3TD16 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RubcnlQ3TD16 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RubcnlQ3TD16 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RubcnlQ3TD16 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RubcnlQ3TD16 Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 375 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
RubcnlQ3TD16 Gm8598-201ENSMUST00000221184 836 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
RubcnlQ3TD16 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
RubcnlQ3TD16 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RubcnlQ3TD16 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
RubcnlQ3TD16 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RubcnlQ3TD16 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RubcnlQ3TD16 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RubcnlQ3TD16 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RubcnlQ3TD16 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RubcnlQ3TD16 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RubcnlQ3TD16 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RubcnlQ3TD16 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RubcnlQ3TD16 Tle6-201ENSMUST00000072020 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RubcnlQ3TD16 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
RubcnlQ3TD16 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
RubcnlQ3TD16 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RubcnlQ3TD16 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RubcnlQ3TD16 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RubcnlQ3TD16 Gm26551-201ENSMUST00000181262 2432 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RubcnlQ3TD16 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RubcnlQ3TD16 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RubcnlQ3TD16 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RubcnlQ3TD16 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RubcnlQ3TD16 Gm13612-201ENSMUST00000119276 390 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
RubcnlQ3TD16 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RubcnlQ3TD16 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
RubcnlQ3TD16 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RubcnlQ3TD16 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RubcnlQ3TD16 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
RubcnlQ3TD16 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RubcnlQ3TD16 AC153937.1-201ENSMUST00000218734 412 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
RubcnlQ3TD16 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RubcnlQ3TD16 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RubcnlQ3TD16 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RubcnlQ3TD16 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RubcnlQ3TD16 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RubcnlQ3TD16 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RubcnlQ3TD16 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RubcnlQ3TD16 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RubcnlQ3TD16 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RubcnlQ3TD16 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RubcnlQ3TD16 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RubcnlQ3TD16 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RubcnlQ3TD16 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RubcnlQ3TD16 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RubcnlQ3TD16 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RubcnlQ3TD16 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RubcnlQ3TD16 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RubcnlQ3TD16 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RubcnlQ3TD16 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RubcnlQ3TD16 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RubcnlQ3TD16 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RubcnlQ3TD16 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RubcnlQ3TD16 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RubcnlQ3TD16 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RubcnlQ3TD16 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RubcnlQ3TD16 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RubcnlQ3TD16 Podn-201ENSMUST00000044248 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RubcnlQ3TD16 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RubcnlQ3TD16 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RubcnlQ3TD16 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RubcnlQ3TD16 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RubcnlQ3TD16 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RubcnlQ3TD16 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RubcnlQ3TD16 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RubcnlQ3TD16 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RubcnlQ3TD16 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RubcnlQ3TD16 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RubcnlQ3TD16 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RubcnlQ3TD16 Gm29152-201ENSMUST00000189284 325 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RubcnlQ3TD16 Prr29-206ENSMUST00000190795 822 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RubcnlQ3TD16 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RubcnlQ3TD16 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
RubcnlQ3TD16 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RubcnlQ3TD16 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RubcnlQ3TD16 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RubcnlQ3TD16 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RubcnlQ3TD16 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.4 ms