Protein–RNA interactions for Protein: Q30KN7

Defb26, Beta-defensin, mousemouse

Predictions only

Length 186 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defb26Q30KN7 Trav4n-4-201ENSMUST00000103627 354 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Defb26Q30KN7 Trav4-3-201ENSMUST00000103655 411 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Defb26Q30KN7 Trav4-4-dv10-201ENSMUST00000103663 361 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Defb26Q30KN7 Rhox7-ps1-201ENSMUST00000117595 806 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Defb26Q30KN7 Gm6023-201ENSMUST00000118217 606 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Defb26Q30KN7 Gm45692-201ENSMUST00000131138 557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
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Defb26Q30KN7 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
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Defb26Q30KN7 Sox2ot-205ENSMUST00000196795 754 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Defb26Q30KN7 Gm4935-201ENSMUST00000221316 1198 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Defb26Q30KN7 AC132317.1-201ENSMUST00000227227 962 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Defb26Q30KN7 Isoc2b-201ENSMUST00000064547 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
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Defb26Q30KN7 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Defb26Q30KN7 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Defb26Q30KN7 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
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Defb26Q30KN7 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
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Defb26Q30KN7 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Defb26Q30KN7 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
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Defb26Q30KN7 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
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Defb26Q30KN7 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Defb26Q30KN7 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
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Defb26Q30KN7 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
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Defb26Q30KN7 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Defb26Q30KN7 Fam71f2-201ENSMUST00000115286 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
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Defb26Q30KN7 4930524O07Rik-201ENSMUST00000161822 1050 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
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Defb26Q30KN7 D930030I03Rik-201ENSMUST00000180735 920 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
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Defb26Q30KN7 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
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Defb26Q30KN7 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Defb26Q30KN7 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Defb26Q30KN7 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
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Defb26Q30KN7 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Defb26Q30KN7 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
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Defb26Q30KN7 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Defb26Q30KN7 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Defb26Q30KN7 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Defb26Q30KN7 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Defb26Q30KN7 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Defb26Q30KN7 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Defb26Q30KN7 Cecr2-202ENSMUST00000112686 9212 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Defb26Q30KN7 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Defb26Q30KN7 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Defb26Q30KN7 Zc3h4-202ENSMUST00000209289 5853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Defb26Q30KN7 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Defb26Q30KN7 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Defb26Q30KN7 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Defb26Q30KN7 Cryba4-203ENSMUST00000112385 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
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Defb26Q30KN7 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.5 ms