Protein–RNA interactions for Protein: Q0VBF8

Stum, Protein stum homolog, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
StumQ0VBF8 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
StumQ0VBF8 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
StumQ0VBF8 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
StumQ0VBF8 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
StumQ0VBF8 Uggt2-212ENSMUST00000156203 6456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
StumQ0VBF8 Rapgef2-201ENSMUST00000118100 6573 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
StumQ0VBF8 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
StumQ0VBF8 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
StumQ0VBF8 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
StumQ0VBF8 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
StumQ0VBF8 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
StumQ0VBF8 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
StumQ0VBF8 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
StumQ0VBF8 Lamc3-201ENSMUST00000028187 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
StumQ0VBF8 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
StumQ0VBF8 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
StumQ0VBF8 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
StumQ0VBF8 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
StumQ0VBF8 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
StumQ0VBF8 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
StumQ0VBF8 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
StumQ0VBF8 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
StumQ0VBF8 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
StumQ0VBF8 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
StumQ0VBF8 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
StumQ0VBF8 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
StumQ0VBF8 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
StumQ0VBF8 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
StumQ0VBF8 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
StumQ0VBF8 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
StumQ0VBF8 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
StumQ0VBF8 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
StumQ0VBF8 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
StumQ0VBF8 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
StumQ0VBF8 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
StumQ0VBF8 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
StumQ0VBF8 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
StumQ0VBF8 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
StumQ0VBF8 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
StumQ0VBF8 Rbl1-201ENSMUST00000029170 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
StumQ0VBF8 Ky-201ENSMUST00000039390 5837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
StumQ0VBF8 Ccdc85a-202ENSMUST00000093253 5431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
StumQ0VBF8 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
StumQ0VBF8 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
StumQ0VBF8 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
StumQ0VBF8 Lsm11-202ENSMUST00000129820 6453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
StumQ0VBF8 Col14a1-203ENSMUST00000110221 5679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
StumQ0VBF8 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
StumQ0VBF8 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
StumQ0VBF8 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
StumQ0VBF8 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
StumQ0VBF8 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
StumQ0VBF8 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
StumQ0VBF8 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
StumQ0VBF8 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
StumQ0VBF8 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
StumQ0VBF8 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
StumQ0VBF8 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
StumQ0VBF8 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
StumQ0VBF8 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
StumQ0VBF8 Tln1-201ENSMUST00000030187 8393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
StumQ0VBF8 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
StumQ0VBF8 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
StumQ0VBF8 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
StumQ0VBF8 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
StumQ0VBF8 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
StumQ0VBF8 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
StumQ0VBF8 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
StumQ0VBF8 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
StumQ0VBF8 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
StumQ0VBF8 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
StumQ0VBF8 Plxnb2-201ENSMUST00000060808 6394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
StumQ0VBF8 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
StumQ0VBF8 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
StumQ0VBF8 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
StumQ0VBF8 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
StumQ0VBF8 Cngb1-202ENSMUST00000119870 6189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
StumQ0VBF8 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
StumQ0VBF8 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
StumQ0VBF8 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
StumQ0VBF8 Chrnb2-201ENSMUST00000029562 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
StumQ0VBF8 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
StumQ0VBF8 Rubcn-202ENSMUST00000089684 5311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
StumQ0VBF8 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
StumQ0VBF8 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
StumQ0VBF8 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
StumQ0VBF8 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
StumQ0VBF8 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
StumQ0VBF8 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
StumQ0VBF8 Taok2-202ENSMUST00000117394 4985 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
StumQ0VBF8 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.59
StumQ0VBF8 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
StumQ0VBF8 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
StumQ0VBF8 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
StumQ0VBF8 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
StumQ0VBF8 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
StumQ0VBF8 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
StumQ0VBF8 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
StumQ0VBF8 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
StumQ0VBF8 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.9 ms