Protein–RNA interactions for Protein: Q0MW30

Neurl1b, E3 ubiquitin-protein ligase NEURL1B, mousemouse

Predictions only

Length 546 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Neurl1bQ0MW30 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Neurl1bQ0MW30 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Neurl1bQ0MW30 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Neurl1bQ0MW30 Pnck-203ENSMUST00000114473 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Neurl1bQ0MW30 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Neurl1bQ0MW30 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Neurl1bQ0MW30 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Neurl1bQ0MW30 Sgce-201ENSMUST00000004750 1703 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Neurl1bQ0MW30 Thoc6-204ENSMUST00000115490 1157 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Neurl1bQ0MW30 Gm11637-201ENSMUST00000120601 592 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Neurl1bQ0MW30 Armc2-208ENSMUST00000162405 1135 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Neurl1bQ0MW30 Cd180-203ENSMUST00000170878 842 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Neurl1bQ0MW30 Cd180-205ENSMUST00000172138 518 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Neurl1bQ0MW30 Gm42627-201ENSMUST00000197347 224 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Neurl1bQ0MW30 Gm44066-201ENSMUST00000203263 519 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Neurl1bQ0MW30 AC154462.2-201ENSMUST00000227519 370 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Neurl1bQ0MW30 n-R5s195-201ENSMUST00000082891 119 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Neurl1bQ0MW30 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Neurl1bQ0MW30 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Neurl1bQ0MW30 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Neurl1bQ0MW30 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Neurl1bQ0MW30 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Neurl1bQ0MW30 Saxo1-201ENSMUST00000030216 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Neurl1bQ0MW30 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Neurl1bQ0MW30 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Neurl1bQ0MW30 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Neurl1bQ0MW30 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Neurl1bQ0MW30 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Neurl1bQ0MW30 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Neurl1bQ0MW30 Sdccag8-202ENSMUST00000056773 1551 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Neurl1bQ0MW30 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Neurl1bQ0MW30 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Neurl1bQ0MW30 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Neurl1bQ0MW30 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Neurl1bQ0MW30 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Neurl1bQ0MW30 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Neurl1bQ0MW30 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Neurl1bQ0MW30 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Neurl1bQ0MW30 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Neurl1bQ0MW30 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Neurl1bQ0MW30 2010320O07Rik-201ENSMUST00000160935 525 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Neurl1bQ0MW30 Gm16379-201ENSMUST00000161469 348 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Neurl1bQ0MW30 Gm8762-201ENSMUST00000193486 339 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Neurl1bQ0MW30 Spata33-205ENSMUST00000212523 486 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Neurl1bQ0MW30 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Neurl1bQ0MW30 Rpl10-201ENSMUST00000008826 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Neurl1bQ0MW30 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Neurl1bQ0MW30 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Neurl1bQ0MW30 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Neurl1bQ0MW30 Rfx7-205ENSMUST00000184015 1554 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Neurl1bQ0MW30 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Neurl1bQ0MW30 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Neurl1bQ0MW30 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Neurl1bQ0MW30 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Neurl1bQ0MW30 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Neurl1bQ0MW30 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Neurl1bQ0MW30 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Neurl1bQ0MW30 Akp-ps1-201ENSMUST00000188050 1600 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Neurl1bQ0MW30 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Neurl1bQ0MW30 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Neurl1bQ0MW30 Taldo1-204ENSMUST00000211654 1362 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Neurl1bQ0MW30 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Neurl1bQ0MW30 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Neurl1bQ0MW30 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Neurl1bQ0MW30 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Neurl1bQ0MW30 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Neurl1bQ0MW30 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Neurl1bQ0MW30 Gm11591-201ENSMUST00000120063 702 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Neurl1bQ0MW30 Gm11658-201ENSMUST00000120913 1008 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Neurl1bQ0MW30 Gm12363-201ENSMUST00000122250 668 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Neurl1bQ0MW30 Gm11978-201ENSMUST00000122315 466 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Neurl1bQ0MW30 Men1-210ENSMUST00000166909 295 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Neurl1bQ0MW30 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Neurl1bQ0MW30 Gm2467-201ENSMUST00000182266 1010 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Neurl1bQ0MW30 Gm6981-201ENSMUST00000182467 1008 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Neurl1bQ0MW30 1700120C18Rik-201ENSMUST00000182952 985 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Neurl1bQ0MW30 2010106C02Rik-201ENSMUST00000191222 660 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Neurl1bQ0MW30 Lsmem2-201ENSMUST00000191791 369 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Neurl1bQ0MW30 AC158516.1-201ENSMUST00000213921 205 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Neurl1bQ0MW30 AC022775.2-201ENSMUST00000227885 646 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Neurl1bQ0MW30 Majin-201ENSMUST00000025699 1239 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Neurl1bQ0MW30 Ndufb3-201ENSMUST00000027193 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Neurl1bQ0MW30 Polr2e-201ENSMUST00000004786 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Neurl1bQ0MW30 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Neurl1bQ0MW30 Krtap4-7-201ENSMUST00000055121 984 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Neurl1bQ0MW30 Rassf8-202ENSMUST00000058538 1131 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Neurl1bQ0MW30 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Neurl1bQ0MW30 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Neurl1bQ0MW30 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Neurl1bQ0MW30 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Neurl1bQ0MW30 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Neurl1bQ0MW30 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Neurl1bQ0MW30 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Neurl1bQ0MW30 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Neurl1bQ0MW30 Ccdc94-201ENSMUST00000086869 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Neurl1bQ0MW30 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Neurl1bQ0MW30 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Neurl1bQ0MW30 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Neurl1bQ0MW30 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Neurl1bQ0MW30 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.7 ms