Protein–RNA interactions for Protein: Q02789

Cacna1s, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, mousemouse

Predictions only

Length 1,880 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna1sQ02789 Cox6a2-201ENSMUST00000033049 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cacna1sQ02789 Il25-201ENSMUST00000037863 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cacna1sQ02789 Mir219a-1-201ENSMUST00000083621 110 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Cacna1sQ02789 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cacna1sQ02789 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cacna1sQ02789 Cyp2a12-201ENSMUST00000075552 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cacna1sQ02789 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cacna1sQ02789 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cacna1sQ02789 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cacna1sQ02789 Odf2-208ENSMUST00000113763 2364 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cacna1sQ02789 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cacna1sQ02789 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cacna1sQ02789 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cacna1sQ02789 Gm5525-201ENSMUST00000190438 1312 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Cacna1sQ02789 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cacna1sQ02789 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Cacna1sQ02789 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cacna1sQ02789 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cacna1sQ02789 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cacna1sQ02789 Gm10544-201ENSMUST00000180516 2239 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cacna1sQ02789 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cacna1sQ02789 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cacna1sQ02789 Ins2-203ENSMUST00000105931 472 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cacna1sQ02789 Gm53-203ENSMUST00000143887 757 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cacna1sQ02789 CT009713.8-201ENSMUST00000225448 560 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Cacna1sQ02789 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cacna1sQ02789 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cacna1sQ02789 Spert-202ENSMUST00000164082 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cacna1sQ02789 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cacna1sQ02789 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cacna1sQ02789 Gm5580-201ENSMUST00000122096 1362 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cacna1sQ02789 Gsdmcl-ps-203ENSMUST00000188367 1375 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Cacna1sQ02789 Gramd2-201ENSMUST00000098661 1368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cacna1sQ02789 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cacna1sQ02789 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cacna1sQ02789 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cacna1sQ02789 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cacna1sQ02789 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cacna1sQ02789 Rab30-202ENSMUST00000107179 1304 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cacna1sQ02789 Cdc42ep2-201ENSMUST00000055458 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cacna1sQ02789 Mir680-2-201ENSMUST00000102163 110 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Cacna1sQ02789 Gm23251-201ENSMUST00000103773 110 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Cacna1sQ02789 Dixdc1-204ENSMUST00000118707 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cacna1sQ02789 Gm15711-201ENSMUST00000118889 535 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Cacna1sQ02789 Adap2os-201ENSMUST00000140556 984 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cacna1sQ02789 Gm8492-201ENSMUST00000182375 987 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Cacna1sQ02789 Rps12-203ENSMUST00000218107 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cacna1sQ02789 Ankrd2-201ENSMUST00000026172 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cacna1sQ02789 Mrpl30-201ENSMUST00000027256 969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cacna1sQ02789 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cacna1sQ02789 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cacna1sQ02789 Ppm1g-201ENSMUST00000031032 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cacna1sQ02789 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cacna1sQ02789 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cacna1sQ02789 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cacna1sQ02789 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Cacna1sQ02789 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cacna1sQ02789 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cacna1sQ02789 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cacna1sQ02789 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cacna1sQ02789 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cacna1sQ02789 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cacna1sQ02789 Ubl5-206ENSMUST00000161486 794 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cacna1sQ02789 Nme9-202ENSMUST00000163199 1196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cacna1sQ02789 Tepp-207ENSMUST00000212056 613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cacna1sQ02789 Lman1l-202ENSMUST00000093832 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Cacna1sQ02789 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Cacna1sQ02789 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Cacna1sQ02789 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Cacna1sQ02789 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Cacna1sQ02789 Phf8-205ENSMUST00000112668 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cacna1sQ02789 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cacna1sQ02789 Ankrd29-202ENSMUST00000122408 850 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cacna1sQ02789 9430091E24Rik-201ENSMUST00000127301 1067 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cacna1sQ02789 Gm16296-201ENSMUST00000159905 325 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Cacna1sQ02789 Lmo3-202ENSMUST00000161450 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cacna1sQ02789 3110045C21Rik-201ENSMUST00000180638 1135 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cacna1sQ02789 Gm28215-201ENSMUST00000186146 346 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cacna1sQ02789 Gm43962-201ENSMUST00000203898 190 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Cacna1sQ02789 Gm32352-201ENSMUST00000212465 688 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cacna1sQ02789 Immp1l-201ENSMUST00000037499 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cacna1sQ02789 Snu13-202ENSMUST00000080622 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cacna1sQ02789 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cacna1sQ02789 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cacna1sQ02789 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cacna1sQ02789 Pgbd5-203ENSMUST00000136892 1739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cacna1sQ02789 0610040F04Rik-201ENSMUST00000137478 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cacna1sQ02789 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cacna1sQ02789 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cacna1sQ02789 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cacna1sQ02789 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cacna1sQ02789 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cacna1sQ02789 Gm11340-201ENSMUST00000119226 412 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Cacna1sQ02789 Gm12196-201ENSMUST00000120954 262 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Cacna1sQ02789 Tmem74bos-201ENSMUST00000137422 390 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cacna1sQ02789 Mcfd2-205ENSMUST00000145895 751 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cacna1sQ02789 A430050A11Rik-201ENSMUST00000195348 646 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Cacna1sQ02789 Gm1821-202ENSMUST00000227415 750 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Cacna1sQ02789 Mir339-201ENSMUST00000083659 96 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Cacna1sQ02789 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.7 ms