Protein–RNA interactions for Protein: Q01853

Vcp, Transitional endoplasmic reticulum ATPase, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 806 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VcpQ01853 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
VcpQ01853 Net1-207ENSMUST00000223258 597 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
VcpQ01853 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
VcpQ01853 AC122459.1-201ENSMUST00000228373 885 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
VcpQ01853 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
VcpQ01853 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
VcpQ01853 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
VcpQ01853 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
VcpQ01853 Ccdc190-201ENSMUST00000094348 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
VcpQ01853 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
VcpQ01853 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
VcpQ01853 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
VcpQ01853 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
VcpQ01853 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
VcpQ01853 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
VcpQ01853 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
VcpQ01853 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC14.37□□□□□ -0.11
VcpQ01853 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
VcpQ01853 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
VcpQ01853 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
VcpQ01853 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
VcpQ01853 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
VcpQ01853 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
VcpQ01853 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
VcpQ01853 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
VcpQ01853 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
VcpQ01853 Rhox2g-201ENSMUST00000115169 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
VcpQ01853 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
VcpQ01853 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
VcpQ01853 Sox2ot-208ENSMUST00000197103 802 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
VcpQ01853 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
VcpQ01853 Gm9299-201ENSMUST00000206392 1140 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
VcpQ01853 Rad51d-202ENSMUST00000021033 1201 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
VcpQ01853 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
VcpQ01853 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
VcpQ01853 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
VcpQ01853 Cryba4-201ENSMUST00000086629 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
VcpQ01853 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
VcpQ01853 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
VcpQ01853 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
VcpQ01853 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
VcpQ01853 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
VcpQ01853 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
VcpQ01853 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
VcpQ01853 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
VcpQ01853 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
VcpQ01853 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
VcpQ01853 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
VcpQ01853 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
VcpQ01853 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
VcpQ01853 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
VcpQ01853 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
VcpQ01853 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
VcpQ01853 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
VcpQ01853 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
VcpQ01853 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
VcpQ01853 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
VcpQ01853 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
VcpQ01853 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
VcpQ01853 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
VcpQ01853 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
VcpQ01853 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
VcpQ01853 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
VcpQ01853 Gm15236-201ENSMUST00000117309 379 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
VcpQ01853 Cryzl1-204ENSMUST00000122254 845 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
VcpQ01853 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
VcpQ01853 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
VcpQ01853 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
VcpQ01853 Svip-203ENSMUST00000209193 487 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
VcpQ01853 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
VcpQ01853 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
VcpQ01853 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
VcpQ01853 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
VcpQ01853 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
VcpQ01853 Txn2-201ENSMUST00000005487 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
VcpQ01853 Rpl10-201ENSMUST00000008826 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
VcpQ01853 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
VcpQ01853 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
VcpQ01853 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
VcpQ01853 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
VcpQ01853 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
VcpQ01853 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
VcpQ01853 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
VcpQ01853 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
VcpQ01853 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
VcpQ01853 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
VcpQ01853 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
VcpQ01853 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
VcpQ01853 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
VcpQ01853 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
VcpQ01853 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
VcpQ01853 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC14.34□□□□□ -0.11
VcpQ01853 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
VcpQ01853 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
VcpQ01853 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
VcpQ01853 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
VcpQ01853 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
VcpQ01853 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
VcpQ01853 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
VcpQ01853 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms